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携带blaIMP的四个新型转座子与质粒和染色体整合研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
前言第10-19页
    1 转座子概述第10-13页
        1.1 转座子定义及分类第10-11页
        1.2 三类常见转座子结构及转座机制第11-12页
        1.3 转座子与耐药的关系第12-13页
    2 碳青霉烯酶IMP概述第13-15页
        2.1 碳青霉烯酶定义及分类第13-15页
        2.2 IMP酶流行病学及分子遗传特征第15页
    3 整合子概述第15-18页
        3.1 整合子分类第15-16页
        3.2 1型整合子结构第16-18页
    4 本研究的目的、意义第18-19页
1 引言第19页
2 材料与方法第19-37页
    2.1 实验材料第19-21页
        2.1.1 实验菌株第19-20页
        2.1.2 试剂第20-21页
        2.1.3 主要仪器第21页
    2.2 实验方法第21-37页
        2.2.1 菌株分纯与保种第21页
        2.2.2 16S rRNA基因及标示基因PCR扩增及测序第21-22页
        2.2.3 改良CarbaNP法检测碳青霉烯酶类型第22-24页
        2.2.4 碳青霉烯酶基因筛查鉴定第24页
        2.2.5 接合转移实验与电转化实验第24-27页
        2.2.6 电转化实验第27-28页
        2.2.7 药物敏感性实验第28页
        2.2.8 利用QIAGENBlood&CellCultureDNAMaxiKit(货号13362)提取基因组DNA第28-29页
        2.2.9 构建配对测序(Matepairsequencing)文库第29-35页
        2.2.10 上机测序及组装第35-36页
        2.2.11 生物信息学分析第36页
        2.2.12 构建进化树第36-37页
3 结果与讨论第37-52页
    3.1 携带blaIMP菌株的筛查与鉴定第37-39页
        3.1.1 菌株临床背景资料第37页
        3.1.2 菌种鉴定第37-39页
        3.1.3 碳青霉烯酶检测第39页
        3.1.4 碳青霉烯酶基因鉴定第39页
    3.2 全基因组测序及外源插入区耐药基因概述第39-41页
        3.2.1 全基因组测序特征概述第39-41页
        3.2.2 外源插入区耐药基因概述第41页
    3.3 p60512-IMP结构精细注释及比较基因组学分析第41-46页
        3.3.1 p60512-IMP纳入分析质粒骨架区异同第41-43页
        3.3.2 外源插入区插入位点分析第43-44页
        3.3.3 Tn6394精细结构比较分析第44-46页
    3.4 p447-IMP比较基因组及精细结构分析第46-47页
    3.5 染色体上整合的转座子Tn6411和Tn6397遗传特征分析第47-49页
        3.5.1 Tn6411比较基因组及精细结构分析第47-48页
        3.5.2 Tn6397比较基因组及精细结构分析第48-49页
    3.6 相关实验菌株获得及其耐药表型与遗传背景分析第49-52页
        3.6.1 系列实验菌株获得:接合转移和电转化第49-50页
        3.6.2 产酶实验第50-51页
        3.6.3 接合子及电转化子基因筛查鉴定第51页
        3.6.4 药敏实验第51-52页
4 讨论第52-53页
5 结论第53-54页
参考文献第54-59页
附录 个人简历第59-60页
在学期间的研究成果目录第60-61页
致谢第61-62页
综述 IMP酶的研究进展第62-65页
    参考文献第65页

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