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基于纳米金刚石的蛋白质组学新技术和新方法研究

中文摘要第1-14页
Abstract第14-18页
第一章 绪论第18-58页
   ·蛋白质组学研究技术第18-27页
       ·蛋白质组学分离分析技术第19-23页
       ·蛋白质样本的制备技术第19-20页
       ·二维凝胶电泳技术第20页
       ·多维液相色谱分离技术第20-21页
       ·毛细管电泳分离技术第21-22页
       ·微流控芯片技术第22-23页
     ·蛋白质组学鉴定技术第23-24页
       ·传统鉴定技术第23页
       ·生物质谱技术第23-24页
     ·蛋白质组学定量研究技术第24-27页
       ·同位素代谢标记法第24-25页
       ·同位素化学标记法第25-27页
       ·非标定量法第27页
   ·蛋白质组学新技术和新方法研究进展第27-36页
     ·低丰度蛋白质或肽的分离富集第27-30页
       ·高丰度蛋白剔除低丰度蛋白富集第28-29页
       ·低丰度肽的富集和除盐技术第29-30页
       ·翻译后修饰蛋白质的鉴定分析第30-36页
       ·磷酸化修饰肽/蛋白的特异性富集分析第30-31页
       ·糖基化修饰的肽/蛋白的特异性富集分析第31-36页
   ·纳米金刚石的研究进展第36-43页
     ·纳米金刚石的制备第37-38页
     ·纳米金刚石的常规应用第38-39页
     ·纳米金刚石在分析化学及生物医学领域中的应用第39-43页
       ·生物大分子的吸附基质第39-40页
       ·色谱固定相第40-41页
       ·纳米金刚石作为载体和探针的应用第41-43页
   ·本论文选题的意义第43页
 参考文献第43-58页
第二章 纳米金刚石对低丰度肽/蛋白的富集及其在探讨宫内生长迟缓大鼠肾脏发育异常可能机制中的应用第58-96页
   ·引言第58-59页
   ·实验部分第59-64页
     ·材料和试剂第59页
     ·仪器设备第59页
     ·材料与实际样本制备第59-60页
       ·dND储备液制备第59-60页
       ·标准蛋白的酶解第60页
       ·实际样本准备第60-62页
       ·动物模型的建立与肾组织标本采集第60页
         ·肾组织全蛋白抽提、双向凝胶电泳分离分析以及差异蛋白质的酶解第60-62页
     ·肽/蛋白的预处理第62-63页
       ·dND对肽/蛋白的富集预处理第62-63页
       ·传统富集方法对肽/蛋白富集预处理第63页
     ·MALDI-TOF/TOF分析及数据处理第63页
     ·dNDs的相关表征第63-64页
   ·结果与讨论第64-88页
     ·dNDs对肽/蛋白的富集第64-65页
     ·dNDs富集性能第65-68页
       ·富集平衡时间第65-66页
       ·吸附容量第66-67页
       ·pH体系依赖度第67-68页
     ·dNDs富集前处理方法与传统前处理方法比较第68-74页
       ·低浓度肽段富集评价第68-71页
       ·耐盐度/耐表面活性剂性能评价第71-74页
     ·dNDs在肝癌血清多肽研究中的应用第74-77页
     ·dNDs在宫内生长迟缓大鼠肾脏发育异常可能机制中的应用第77-88页
   ·结论与展望第88-89页
 参考文献第89-96页
第三章 纳米金刚石在MALDI靶上前处理方法中的应用研究第96-118页
   ·引言第96-98页
   ·实验部分第98-100页
     ·材料和试剂第98页
     ·仪器设备第98页
     ·标准试剂与实际样本制备第98-99页
       ·标准蛋白/肽段制备第98页
       ·实际样本的制备第98-99页
       ·dNDs辅助涂层的制备第99页
       ·MALDI-TOF/TOF MS分析及数据处理第99-100页
   ·结果与讨论第100-113页
     ·dNDs辅助涂层制备及其对质谱信号的增强研究第100-102页
     ·辅助涂层靶点内以及靶点间的样品信号重复性研究第102-104页
     ·缩小dNDs辅助涂层面积实现靶上富集第104-105页
     ·dNDs辅助涂层下的检测灵敏度评价第105-108页
     ·dNDs辅助涂层靶上耐盐评价第108-109页
     ·dNDs辅助涂层在实际样品中的应用第109-113页
   ·结论与展望第113页
 参考文献第113-118页
第四章 纳米金刚石固定化酶及其在蛋白质组学中的应用第118-144页
   ·引言第118-119页
   ·实验部分第119-123页
     ·材料和试剂第119页
     ·仪器设备第119页
     ·酶在dNDs表面的固定化过程第119-120页
       ·氧化/酸化dND颗粒制备第119页
       ·EDC/NHS活化dNDs表面第119-120页
       ·酶的固定第120页
     ·dNDs-酶的表征第120页
       ·电子显微镜表征第120页
       ·傅立叶变换红外光谱表征第120页
     ·dNDs-Try的性质评价第120-122页
       ·酶固定量的评价第120页
       ·dNDs-Try的反应动力学评价第120-121页
       ·dNDs-Try的耐受度评价第121-122页
     ·标准蛋白的溶液酶解第122页
     ·dNDs-Try以及dNDs-PNGase F对标准蛋白的酶解第122页
     ·MALDI-TOF-MS/MS分析及数据处理第122-123页
   ·结果与讨论第123-139页
     ·酶的固定化以及表征第123-126页
     ·游离酶以及固定化酶的反应动力学研究第126-128页
     ·dNDs-Try的耐受度研究第128-131页
     ·dNDs-Try在蛋白质组学中的应用第131-138页
       ·在溶液体系中的应用第131-134页
       ·dNDs-Try MALDI靶上酶解第134-138页
     ·dNDs-PNGase F的制备评价第138-139页
   ·结论与展望第139-140页
 参考文献第140-144页
第五章 硼酸功能化dNDs的制备及其在糖蛋白/糖肽富集方法中的应用第144-168页
   ·引言第144-145页
   ·实验部分第145-148页
     ·材料与试剂第145页
     ·硼酸功能化dNDs的合成第145-146页
     ·硼酸功能化dNDs的表征第146页
     ·dNDs-PL/PEG-APBA纳米粒子用于富集糖基化肽第146页
     ·商品化硼酸磁珠对糖基化肽的富集第146页
     ·dNDs-PL/PEG-APBA纳米粒子用于鼠肝样品中糖基化蛋白分析第146-147页
     ·MALDI-MS第147-148页
     ·鼠肝多肽馏分的Nano-LC/MS分析第148页
     ·Nano-LC/MS数据库检索分析第148页
   ·结果与讨论第148-161页
     ·硼酸功能化dNDs的合成及其表征分析第148-150页
     ·糖肽的富集第150-161页
       ·dNDs-PL/PEG-APBA对N-糖肽的富集原理及流程第150-151页
       ·dNDs-PL/PEG-APBA对N-糖肽的富集及选择特异性评价第151-156页
       ·dNDs-PL/PEG-APBA对N-糖肽的富集效率评价第156-158页
       ·dNDs-PL/PEG-APBA对N-糖肽的富集回收率评价第158-159页
       ·dNDs-PL/PEG-APBA对小鼠肝脏中N-糖基化修饰蛋白的鉴定研究第159-161页
   ·结论与展望第161-165页
 参考文献第165-168页
第六章 Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球的合成及其在分泌蛋白质组学中的应用第168-202页
   ·引言第168页
   ·实验部分第168-173页
     ·材料和试剂第168-169页
     ·仪器设备第169页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球的合成第169-170页
       ·四氧化三铁磁性微球材料的合成第169页
       ·具有核壳结构的Fe_3O_4@SiO_2-NH_2磁性微球材料的合成第169-170页
       ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球的合成第170页
     ·材料表征第170页
       ·电子显微镜表征第170页
       ·傅立叶变换红外光谱表征第170页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球用于肽段富集第170-171页
       ·标准蛋白的酶解第170-171页
       ·肽段的分离富集第171页
       ·MALDI-TOF/TOF分析及数据处理第171页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球用于蛋白富集第171页
       ·蛋白富集第171页
       ·SDS凝胶分离分析第171页
     ·Fe_3O_4@Si_O2@[dNDs]n磁性微球用于有/无四环素刺激HepAD38分泌差异分析第171-173页
       ·HepAD38细胞培养及分泌上清收集第172页
       ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球用于分泌蛋白的富集第172页
       ·HepAD38(Tet~(+/-))分泌蛋白的itraq标记第172页
       ·HepAD38(Tet~(+/-))分泌蛋白的off-line 2D-LC-MS分析鉴定第172-173页
   ·结果讨论第173-197页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球的制备及表征第173-176页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球对肽段富集评价第176-179页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球对蛋白富集评价第179-182页
     ·Fe_3O_4@SiO_2@[dNDs]n磁性微球用于HepAD38(Tet~(+/-))差异分泌蛋白分析第182-197页
   ·结论与展望第197页
 参考文献第197-202页
博士学位攻读期间文章发表情况第202-204页
致谢第204-205页

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