| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第10-22页 |
| 1.1 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化及其菌群的研究进展 | 第10-18页 |
| 1.1.1 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化反应的发现 | 第10页 |
| 1.1.2 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化微生物及其生化反应机理 | 第10-13页 |
| 1.1.3 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化反应的影响因素 | 第13-15页 |
| 1.1.3.1 硝酸盐和亚硝酸盐(NO3-/NO2-) | 第13-14页 |
| 1.1.3.2 甲烷浓度和有机碳含量(CH4/OC) | 第14页 |
| 1.1.3.3 温度 | 第14-15页 |
| 1.1.3.4 氧气(氧化还原电位) | 第15页 |
| 1.1.3.5 含盐量 | 第15页 |
| 1.1.4 自然生境中的亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化反应 | 第15-18页 |
| 1.1.4.1 海洋生态系统 | 第15-16页 |
| 1.1.4.2 淡水生态系统 | 第16-17页 |
| 1.1.4.3 湿地生态系统 | 第17-18页 |
| 1.1.4.4 稻田生态系统 | 第18页 |
| 1.2 自然生态系统中氮循环的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 研究材料与方法 | 第22-28页 |
| 2.1 研究位点及样品采集 | 第22-24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-28页 |
| 2.2.1 土壤理化性质的测定 | 第24-25页 |
| 2.2.2 样品宏基因组DNA的提取 | 第25页 |
| 2.2.3 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌的PCR扩增 | 第25页 |
| 2.2.4 实时-荧光定量PCR | 第25-26页 |
| 2.2.5 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌的Hi-Seq高通量测序 | 第26页 |
| 2.2.6 稳定性同位素活性示踪实验 | 第26-27页 |
| 2.2.7 数据处理及分析方法 | 第27-28页 |
| 第三章 结果 | 第28-44页 |
| 3.1 土壤理化性质 | 第28-29页 |
| 3.2 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌丰度及其与土壤理化性质的相关性 | 第29-34页 |
| 3.2.1 16SrRNA基因定量的标准曲线 | 第29-31页 |
| 3.2.2 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌16SrRNA基因的丰度 | 第31-32页 |
| 3.2.3 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌16SrRNA基因的丰度与土壤理化相关性分析 | 第32-34页 |
| 3.3 Hi-Seq高通量测序所得菌群组成及结构分析 | 第34-42页 |
| 3.3.1 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌16SrRNA基因PCR结果 | 第34页 |
| 3.3.2 Hi-Seq高通量测序原始数据质量评估 | 第34-38页 |
| 3.3.3 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌系统发育树 | 第38-40页 |
| 3.3.4 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌Venn图分析 | 第40-41页 |
| 3.3.5 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌结构组成与环境因子相关性分析 | 第41-42页 |
| 3.4 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌活性 | 第42-44页 |
| 第四章 讨论 | 第44-48页 |
| 4.1 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌16SrRNA基因的丰度与土壤理化因子的相关性 | 第44-45页 |
| 4.2 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌的多样性和分布特征 | 第45-46页 |
| 4.3 亚硝酸盐型厌氧甲烷氧化菌的活性 | 第46-48页 |
| 第五章 结论 | 第48-50页 |
| 3.1 主要结论 | 第48-49页 |
| 3.2 研究展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 资金资助情况 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
