| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 第一部分 TEF-1下游靶基因的鉴定及其对MAPK通路的调控 | 第13-38页 |
| 1 前言 | 第13-21页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第13页 |
| 1.2 文献综述 | 第13-19页 |
| 1.2.1 TEF-1基因研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2.2 基因转录水平调控的研究方法 | 第14-17页 |
| 1.2.3 TEF-1下游靶基因的钓取(ChIP-on-chip) | 第17页 |
| 1.2.4 MAPK信号通路及通路中FOS,RPS6KA2,MAP2K1IP1基因研究现状 | 第17-19页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.1 材料 | 第21-24页 |
| 2.1.1 DNA样品 | 第21页 |
| 2.1.2 细胞系 | 第21页 |
| 2.1.3 载体和菌株 | 第21-22页 |
| 2.1.4 试剂盒、酶、血清 | 第22-23页 |
| 2.1.5 主要试剂及配制 | 第23页 |
| 2.1.6 主要仪器设备 | 第23页 |
| 2.1.7 主要分子生物学软件及常用网站 | 第23-24页 |
| 2.2 方法 | 第24-30页 |
| 2.2.1 启动子序列TEF-1结合位点预测 | 第24页 |
| 2.2.2 目的基因的确定 | 第24页 |
| 2.2.3 引物设计 | 第24-25页 |
| 2.2.4 TEF-1超表达实验 | 第25页 |
| 2.2.5 小鼠启动子报告基因载体的构建 | 第25-27页 |
| 2.2.6 细胞培养、转染及转染后的荧光素酶活性测定 | 第27页 |
| 2.2.7 EMSA | 第27-30页 |
| 3 结果 | 第30-35页 |
| 3.1 芯片基因启动子的TEF-1结合位点预测 | 第30页 |
| 3.2 TEF-1超表达实验及结果 | 第30-32页 |
| 3.2.1 RT-PCR检测在C2C12中TEF-1超表达结果 | 第30-31页 |
| 3.2.2 荧光定量检测在C2C12中TEF-1超表达结果 | 第31-32页 |
| 3.2.3 荧光定量检测目的基因在TEF-1超表达的C2C12中表达量变化 | 第32页 |
| 3.3 靶基因的启动子活性检测 | 第32-34页 |
| 3.3.1 靶基因的启动子克隆测序 | 第32-34页 |
| 3.3.2 报告载体构建后双酶切验证 | 第34页 |
| 3.4 启动子活性检测 | 第34-35页 |
| 4 讨论 | 第35-37页 |
| 4.1 关于启动子预测的讨论 | 第35页 |
| 4.2 关于研究TEF-1基因转录调控方法的讨论 | 第35-36页 |
| 4.3 TEF-1下游靶基因转录调控问题的讨论 | 第36-37页 |
| 5 小结 | 第37-38页 |
| 5.1 本研究的主要结果与结论 | 第37页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第37页 |
| 5.3 本研究不足之处与进一步工作的建议 | 第37-38页 |
| 第二部分 猪SMYD1-3基因的进化分析,表达特征及SNP筛选 | 第38-54页 |
| 1 前言 | 第38-41页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第38页 |
| 1.2 文献综述 | 第38-39页 |
| 1.2.1 组蛋白甲基化调控肌肉发育研究进展 | 第38-39页 |
| 1.2.2 SMYD1、SMYD2、SMYD3基因的研究进展 | 第39页 |
| 1.3 目的与意义 | 第39-41页 |
| 2 材料与方法 | 第41-45页 |
| 2.1 材料 | 第41-42页 |
| 2.1.1 组织样品 | 第41页 |
| 2.1.2 实验群体与DNA样品 | 第41页 |
| 2.1.3 试剂盒、酶 | 第41页 |
| 2.1.4 主要试剂及配制 | 第41-42页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第42页 |
| 2.1.6 主要分子生物学软件及常用网站 | 第42页 |
| 2.2 方法 | 第42-45页 |
| 2.2.1 猪SMYD1-3基因的生物信息学分析 | 第42页 |
| 2.2.2 引物设计 | 第42-43页 |
| 2.2.3 基因的表达谱分析 | 第43页 |
| 2.2.4 SMYD1-3基因的SNP筛查 | 第43-44页 |
| 2.2.5 SMYD1-3基因的SNP与性状关联分析 | 第44-45页 |
| 3 结果 | 第45-51页 |
| 3.1 猪SMYD1-3基因的cDNA序列分析 | 第45页 |
| 3.2 进化分析 | 第45-46页 |
| 3.3 猪SMYD1-3基因表达模式分析 | 第46-47页 |
| 3.4 猪SMYD1-3基因的多态检测及关联分析 | 第47-51页 |
| 3.4.1 多态检测 | 第47-48页 |
| 3.4.2 关联分析 | 第48-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 4.1 猪SMYD1-3基因的表达规律 | 第51页 |
| 4.2 猪SMYD1-3基因的同源和进化分析 | 第51页 |
| 4.3 猪SMYD1-3基因与骨骼肌发育 | 第51-53页 |
| 5 小结 | 第53-54页 |
| 5.1 本研究获得的主要结果 | 第53页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第53页 |
| 5.3 本研究的不足之处 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
