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生物医学计算平台CSF-OPAL的设计及实现

提要第4-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第11-22页
    1.1 研究背景和意义第11-12页
    1.2 研究现状第12-15页
        1.2.1 生物医学数组类型应用的特性第13页
        1.2.2 资源信息获取第13页
        1.2.3 作业调度策略第13-14页
        1.2.4 当前解决方案第14页
        1.2.5 现有研究缺陷第14-15页
    1.3 相关技术第15-20页
        1.3.1 Globus Toolkit第15-17页
        1.3.2 RSL规范第17-19页
        1.3.3 OPAL Toolkit第19-20页
    1.4 本文工作第20-22页
第2章 CSF元调度器第22-28页
    2.1 CSF4的总体结构第22-25页
    2.2 CSF4的插件机制第25-26页
    2.3 CSF4的资源管理机制第26-28页
第3章 CSF-OPAL生物医学计算平台总体设计第28-37页
    3.1 CSF-OPAL模型设计第28-32页
        3.1.1 跨域资源共享第28-29页
        3.1.2 作业协同管理第29-32页
    3.2 数组作业的调度和管理第32-37页
        3.2.1 作业描述,建模与解析第32-34页
        3.2.2 作业拆分和任务调度第34-35页
        3.2.3 错误处理第35-37页
第4章 CSF-OPAL生物医学计算平台的原型设计与实现第37-47页
    4.1 框架设计第37页
    4.2 调度插件的设计和实现第37-42页
        4.2.1 插件的设计第37-39页
        4.2.2 插件的实现第39-42页
    4.3 资源管理器的设计和实现第42-47页
        4.3.1 OPAL资源管理器框架设计第42页
        4.3.2 OPAL资源管理器框架实现第42-44页
        4.3.3 任务提交第44-45页
        4.3.4 任务查询第45-46页
        4.3.5 任务控制第46-47页
第5章 测试和分析第47-55页
    5.1 试验环境第47-48页
    5.2 测试用例第48-50页
        5.2.1 Autodock应用第48页
        5.2.2 RSL文件第48-49页
        5.2.3 环境配置第49-50页
    5.3 数据分析第50-55页
        5.3.1 功能测试第50-51页
        5.3.2 效率分析第51-53页
        5.3.3 时间开销第53-55页
第6章 总结和未来展望第55-56页
参考文献第56-59页
作者简介及在学期间所取得的科研成果第59-60页
致谢第60页

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