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结直肠癌中甲基化、羟甲基化差异基因探索及KIAA1199、AQP8、SOX9、BEST4、MAL和ADH1A基因的预后分析

致谢第5-6页
中文摘要第6-9页
Abstract第9-11页
缩略语第12-15页
1 引言第15-21页
2 仪器设备和试剂第21-24页
    2.1 仪器设备第21-22页
    2.2 主要生物化学试剂第22-24页
3 材料和方法第24-39页
    3.1 蛋白免疫印记缓冲液第24-27页
    3.2 基因克隆缓冲液第27-28页
    3.3 细胞培养液第28-29页
    3.4 结直肠癌样本第29页
    3.5 细胞培养第29页
    3.6 结直肠癌肿瘤组织DNA、RNA、蛋白共提取(OMEGA试剂盒)第29-30页
    3.7 细胞总RNA提取第30-31页
    3.8 细胞系基因组DNA抽提(天根试剂盒)第31页
    3.9 甲基化质粒λ DNA构建(NEB公司试剂盒)第31-32页
    3.10 基因组DNA超声破碎第32页
    3.11 琼脂糖凝肢电泳第32-33页
    3.12 甲基化免疫共沉淀(磁珠富集法,Zymo试剂盒)第33页
    3.13 甲基化免疫共沉淀(滤柱富集法,Epigentek试剂盒)第33-34页
    3.14 羟甲基化免疫共沉淀(Active Motif试剂盒)第34-35页
    3.15 羟甲基化免疫共沉淀(JBP法,Zymo试剂盒)第35页
    3.16 MeDIP、hMeDIP 产物DNA纯化第35-36页
    3.17 逆转录PCR第36页
    3.18 荧光定量PCR检测第36-37页
    3.19 QuantiGenePlex assay第37页
    3.20 网络数据库资料分析第37-38页
    3.21 结直肠癌样本第38页
    3.22 数据统计第38-39页
4 实验结果第39-53页
    4.1 结直肠癌组织DNA序列各组件中5MC与5HMC在的分布检测第39页
    4.2 结直肠癌组织DNA序列中5MC、5HMC差异区段分析第39-41页
    4.3 甲基化DNA标准品的制备和检验与基因组DNA碎片化验证第41-42页
    4.4 结直肠癌肿瘤组织和配对癌旁组织中,5MC、5HMC含量存在差异的基因筛查第42-44页
    4.5 结直肠癌患者肿瘤组织和配对癌旁组织中MRNA表达水平差异基因的筛查与验证第44-45页
    4.6 研究人群临床病理参数的整理分析第45-47页
    4.7 KIAA1199、AQP8、SOX9、BEST4、MAL和ADH1A表达与临床病理参数的相关性分析第47-50页
    4.8 KIAA1199、AQP8、SOX9、BEST4、MAL和ADH1A的MRNA表达水平对结直肠癌患者的预后影响第50-53页
5 讨论第53-59页
6 结论第59-60页
参考文献第60-65页
综述第65-74页
    参考文献第70-74页
作者简历及在读期间所取得科研成果第74页

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