致谢 | 第5-6页 |
中文摘要 | 第6-9页 |
Abstract | 第9-11页 |
缩略语 | 第12-15页 |
1 引言 | 第15-21页 |
2 仪器设备和试剂 | 第21-24页 |
2.1 仪器设备 | 第21-22页 |
2.2 主要生物化学试剂 | 第22-24页 |
3 材料和方法 | 第24-39页 |
3.1 蛋白免疫印记缓冲液 | 第24-27页 |
3.2 基因克隆缓冲液 | 第27-28页 |
3.3 细胞培养液 | 第28-29页 |
3.4 结直肠癌样本 | 第29页 |
3.5 细胞培养 | 第29页 |
3.6 结直肠癌肿瘤组织DNA、RNA、蛋白共提取(OMEGA试剂盒) | 第29-30页 |
3.7 细胞总RNA提取 | 第30-31页 |
3.8 细胞系基因组DNA抽提(天根试剂盒) | 第31页 |
3.9 甲基化质粒λ DNA构建(NEB公司试剂盒) | 第31-32页 |
3.10 基因组DNA超声破碎 | 第32页 |
3.11 琼脂糖凝肢电泳 | 第32-33页 |
3.12 甲基化免疫共沉淀(磁珠富集法,Zymo试剂盒) | 第33页 |
3.13 甲基化免疫共沉淀(滤柱富集法,Epigentek试剂盒) | 第33-34页 |
3.14 羟甲基化免疫共沉淀(Active Motif试剂盒) | 第34-35页 |
3.15 羟甲基化免疫共沉淀(JBP法,Zymo试剂盒) | 第35页 |
3.16 MeDIP、hMeDIP 产物DNA纯化 | 第35-36页 |
3.17 逆转录PCR | 第36页 |
3.18 荧光定量PCR检测 | 第36-37页 |
3.19 QuantiGenePlex assay | 第37页 |
3.20 网络数据库资料分析 | 第37-38页 |
3.21 结直肠癌样本 | 第38页 |
3.22 数据统计 | 第38-39页 |
4 实验结果 | 第39-53页 |
4.1 结直肠癌组织DNA序列各组件中5MC与5HMC在的分布检测 | 第39页 |
4.2 结直肠癌组织DNA序列中5MC、5HMC差异区段分析 | 第39-41页 |
4.3 甲基化DNA标准品的制备和检验与基因组DNA碎片化验证 | 第41-42页 |
4.4 结直肠癌肿瘤组织和配对癌旁组织中,5MC、5HMC含量存在差异的基因筛查 | 第42-44页 |
4.5 结直肠癌患者肿瘤组织和配对癌旁组织中MRNA表达水平差异基因的筛查与验证 | 第44-45页 |
4.6 研究人群临床病理参数的整理分析 | 第45-47页 |
4.7 KIAA1199、AQP8、SOX9、BEST4、MAL和ADH1A表达与临床病理参数的相关性分析 | 第47-50页 |
4.8 KIAA1199、AQP8、SOX9、BEST4、MAL和ADH1A的MRNA表达水平对结直肠癌患者的预后影响 | 第50-53页 |
5 讨论 | 第53-59页 |
6 结论 | 第59-60页 |
参考文献 | 第60-65页 |
综述 | 第65-74页 |
参考文献 | 第70-74页 |
作者简历及在读期间所取得科研成果 | 第74页 |