| 致谢 | 第7-12页 |
| 缩略词表 | 第12-16页 |
| 摘要 | 第16-19页 |
| Abstract | 第19-22页 |
| 第一章 文献综述 | 第23-42页 |
| 1.1 引言 | 第23页 |
| 1.2 大麦矮秆基因的分类 | 第23-27页 |
| 1.2.1 brachytic矮秆基因 | 第24页 |
| 1.2.2 breviaristatum矮秆基因 | 第24页 |
| 1.2.3 erectoides矮秆基因 | 第24-25页 |
| 1.2.4 zeocriton矮秆基因 | 第25页 |
| 1.2.5 uzu矮秆基因 | 第25-26页 |
| 1.2.6 sdw矮秆基因 | 第26页 |
| 1.2.7 大麦新矮秆基因 | 第26-27页 |
| 1.3 大麦矮秆育种中的主要矮秆基因 | 第27-34页 |
| 1.3.1 大麦主要矮秆基因的育种应用 | 第27-28页 |
| 1.3.2 大麦主要矮秆基因的定位和克隆 | 第28-30页 |
| 1.3.2.1 uzu1基因的定位与克隆 | 第28-30页 |
| 1.3.2.2 ari-e基因的定位 | 第30页 |
| 1.3.2.3 sdw1/denso基因的定位 | 第30页 |
| 1.3.3 大麦主要矮秆基因对农艺性状、生理和非生物胁迫的影响 | 第30-34页 |
| 1.3.3.1 uzu1基因对大麦农艺性状和非生物胁迫的影响 | 第30-31页 |
| 1.3.3.2 ari-e基因对大麦农艺性状和耐盐性的影响 | 第31-32页 |
| 1.3.3.3 sdw1/denso基因对大麦农艺性状、生理、形态结构的影响 | 第32-34页 |
| 1.3.3.3.1 sdw1/denso基因对大麦农艺性状的影响 | 第32-33页 |
| 1.3.3.3.2 sdw1/denso基因对生理、形态和结构性状的影响 | 第33-34页 |
| 1.4 矮化基因的作用机制 | 第34-38页 |
| 1.4.1 赤霉素合成代谢途径的关键酶对矮化的影响 | 第34-37页 |
| 1.4.2 赤霉素信号转导途径相关基因对矮化的影响 | 第37-38页 |
| 1.5 基因表达数量性状定位分析技术(eQTL) | 第38-41页 |
| 1.5.1 eQTL技术原理 | 第38-39页 |
| 1.5.2 eQTL的分类 | 第39-40页 |
| 1.5.3 eQTL在植物中的应用 | 第40-41页 |
| 1.5.3.1 候选基因挖掘 | 第40页 |
| 1.5.3.2 基因调控网络 | 第40-41页 |
| 1.6 本研究目的和意义 | 第41-42页 |
| 第二章 大麦sdw1/denso候选基因的克隆 | 第42-56页 |
| 2.1 引言 | 第42页 |
| 2.2 材料与方法 | 第42-46页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第42页 |
| 2.2.2 DNA提取 | 第42-43页 |
| 2.2.3 水稻和大麦共线性分析 | 第43页 |
| 2.2.4 HvGA20ox_2基因部分序列的获得 | 第43-44页 |
| 2.2.5 HvGA20ox_2基因全长基因序列的获得 | 第44页 |
| 2.2.6 基因同源性分析 | 第44-45页 |
| 2.2.7 SNP标记的SSCP分型 | 第45-46页 |
| 2.2.8 数据分析 | 第46页 |
| 2.3 结果与分析 | 第46-53页 |
| 2.3.1 大麦sdw1/denso基因区域与水稻基因组共线性分析 | 第46页 |
| 2.3.2 sdw1/denso候选基因HvGA20ox_2克隆 | 第46-48页 |
| 2.3.3 大麦GA 20-氧化酶基因的同源性分析 | 第48-52页 |
| 2.3.4 不同物种间GA 20-氧化酶的同源性分析 | 第52页 |
| 2.3.5 大麦HvGA20ox_2基因定位 | 第52-53页 |
| 2.3.6 株高与HvGA20ox_2基因标记的关系 | 第53页 |
| 2.4 讨论 | 第53-56页 |
| 第三章 HvGA20ox_2基因表达对重要农艺性状的影响 | 第56-69页 |
| 3.1 引言 | 第56-57页 |
| 3.2 材料与方法 | 第57-61页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第57页 |
| 3.2.2 田间试验和农艺性状测定 | 第57页 |
| 3.2.3 RNA提取 | 第57-58页 |
| 3.2.4 cDNA合成 | 第58页 |
| 3.2.5 HvGA20ox_2基因RT-PCR | 第58页 |
| 3.2.6 荧光定量PCR标准样品制备 | 第58-60页 |
| 3.2.7 HvGA20ox_2基因qRT-PCR | 第60页 |
| 3.2.8 赤霉素反应试验 | 第60页 |
| 3.2.9 数据分析 | 第60-61页 |
| 3.3 结果与分析 | 第61-65页 |
| 3.3.1 HvGA20ox_2基因表达及对株高的影响 | 第61-62页 |
| 3.3.2 HvGA20ox_2基因eQTL | 第62页 |
| 3.3.3 Baudin× AC Metcalfe DH群体重要农艺性状QTL定位 | 第62页 |
| 3.3.4 HvGA20ox_2基因表达量与基因型的关系 | 第62-64页 |
| 3.3.5 HvGA20ox_2基因表达量与农艺性状的关系 | 第64-65页 |
| 3.3.6 外施赤霉素对半矮秆品种Baudin株高的影响 | 第65页 |
| 3.4 讨论 | 第65-69页 |
| 3.4.1 HvGA20ox_2表达量与株高的关系 | 第65-66页 |
| 3.4.2 HvGA20ox_2基因表达受顺式调控 | 第66-67页 |
| 3.4.3 HvGA20ox_2基因对农艺性状的影响 | 第67-69页 |
| 第四章 sdw1/denso不同等位基因的鉴定及其功能研究 | 第69-80页 |
| 4.1 引言 | 第69页 |
| 4.2 材料与方法 | 第69-71页 |
| 4.2.1 试验材料 | 第69页 |
| 4.2.2 DNA提取、HvGA20ox_2基因PCR扩增和测序 | 第69页 |
| 4.2.3 InDel-denso标记开发和sdw1/deno基因型品种鉴定 | 第69-70页 |
| 4.2.4 RNA提取和cDNA合成 | 第70页 |
| 4.2.5 荧光定量PCR | 第70页 |
| 4.2.6 HvGA20ox_2基因上、下游序列和旁邻基因PCR扩增 | 第70-71页 |
| 4.3 结果与分析 | 第71-77页 |
| 4.3.1 sdw1/denso半矮秆品种的HvGA20ox_2序列分析 | 第71-72页 |
| 4.3.2 denso和sdw1(Jotun)基因型鉴定标记 | 第72-74页 |
| 4.3.2.1 利用荧光定量PCR鉴定denso和sdw1基因型 | 第72页 |
| 4.3.2.2 利用InDel-denso标记鉴定denso和sdw1(Juton)基因型 | 第72-73页 |
| 4.3.2.3 InDel-denso标记鉴定大麦品种 | 第73-74页 |
| 4.3.3 两个不同来源的sdw1基因型鉴定 | 第74-77页 |
| 4.4 讨论 | 第77-80页 |
| 4.4.1 GA 20-氧化酶为植物表型变异热点 | 第77-78页 |
| 4.4.2 HvGA20ox_2表达量降低可能影响麦芽品质 | 第78页 |
| 4.4.3 denso基因在我国大麦育种中的应用 | 第78-80页 |
| 第五章 大麦HvGA20ox_2基因的功能分析 | 第80-96页 |
| 5.1 引言 | 第80页 |
| 5.2 材料与方法 | 第80-86页 |
| 5.2.1 试验材料 | 第80-81页 |
| 5.2.2 超表达载体构建 | 第81-82页 |
| 5.2.3 拟南芥转基因方法及其检测 | 第82-83页 |
| 5.2.4 转基因拟南芥表型试验 | 第83页 |
| 5.2.5 DNA、RNA提取及cDNA合成 | 第83页 |
| 5.2.6 荧光定量PCR | 第83-84页 |
| 5.2.7 赤霉素含量测定 | 第84-86页 |
| 5.2.8 统计分析 | 第86页 |
| 5.3 结果与分析 | 第86-93页 |
| 5.3.1 sdw1/denso半矮秆突变体赤霉素合成和代谢相关基因的表达分析 | 第86-87页 |
| 5.3.2 转基因拟南芥的获得和分子检测 | 第87-88页 |
| 5.3.2.1 除草剂喷施和PCR检测 | 第87-88页 |
| 5.3.2.2 实时荧光定量PCR检测转基因拟南芥 | 第88页 |
| 5.3.3 HvGA20ox_2基因超表达导致拟南芥赤霉素过量表型 | 第88-91页 |
| 5.3.4 转基因拟南芥的赤霉素含量 | 第91页 |
| 5.3.5 转基因拟南芥中赤霉素相关基因的表达分析 | 第91-93页 |
| 5.4 讨论 | 第93-96页 |
| 5.4.1 HvGA20ox_2具有GA 20-氧化酶功能并参与赤霉素合成 | 第93-94页 |
| 5.4.2 HvGA20ox_2基因的多效性影响大麦花期 | 第94-96页 |
| 第六章 全文总结与展望 | 第96-99页 |
| 参考文献 | 第99-115页 |
| 附录 | 第115-121页 |
| 作者简历 | 第121页 |
