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牦牛四个低氧适应基因的遗传多态性研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
缩略词对照表第13-14页
前言第14-16页
第一章 文献综述第16-32页
    1.1 牦牛的动物学分类第16-17页
    1.2 牦牛的分布及高原适应的生物学特征第17-22页
        1.2.1 牦牛的分布第17-19页
        1.2.2 牦牛适应高原高寒低氧环境的生物学特征第19-22页
    1.3 EPAS1、EGLN1、HYOU1、HMBS基因的研究进展第22-28页
        1.3.1 内皮PAS1蛋白(EPAS1)基因研究进展第22-25页
        1.3.2 脯氨酸羟化酶 2(PHD2/EGLN1)基因研究进展第25-26页
        1.3.3 缺氧上调基因 1(HYOU1)基因研究进展第26-27页
        1.3.4 羟甲基胆素合酶(HMBS)基因研究进展第27-28页
    1.4 基因池(DNA池)技术第28-29页
    1.5 基因多态性与遗传标记第29-31页
        1.5.1 基因多态性第29-30页
        1.5.2 遗传标记第30-31页
    1.6 本研究目的与意义第31-32页
第二章 材料与方法第32-39页
    2.1 实验材料第32-33页
        2.1.1 实验样品的采集第32页
        2.1.2 主要仪器设备第32-33页
        2.1.3 主要试剂第33页
    2.2 实验方法第33-39页
        2.2.1 基因组DNA的提取和检测第33页
        2.2.2 构建基因组DNA池第33-34页
        2.2.3 引物设计和PCR扩增第34-37页
        2.2.4 PCR扩增体系及程序第37页
        2.2.5 基因SNP位点的筛查与检测第37页
        2.2.6 限定性内切酶酶切体系(PCR-RFLP)第37-38页
        2.2.7 数据统计分析方法第38-39页
第三章 结果与分析第39-74页
    3.1 基因组DNA的提取与检测第39页
    3.2 牦牛EPAS1低氧适应基因的遗传多态性分析第39-48页
        3.2.1 PCR扩增产物检测第39-40页
        3.2.2 EPAS1基因SNPs的筛查和检测第40-41页
        3.2.3 基因型频率和等位基因频率及 χ2适合性检验第41-44页
        3.2.4 群体遗传多态性第44-45页
        3.2.5 各类群间基因型频率差异比较第45-46页
        3.2.6 各牦牛类群连锁不平衡分析第46-47页
        3.2.7 各牦牛类群单倍型分析第47-48页
    3.3 牦牛EGLN1低氧适应基因的遗传多态性分析第48-55页
        3.3.1 PCR扩增产物检测第48页
        3.3.2 EGLN1基因SNPs的筛查和检测第48-50页
        3.3.3 基因型频率和等位基因频率及 χ2适合性检验第50-51页
        3.3.4 群体遗传多态性第51-52页
        3.3.5 各类群间基因型频率差异比较第52-53页
        3.3.6 各牦牛类群连锁不平衡分析第53-54页
        3.3.7 各牦牛类群单倍型分析第54-55页
    3.4 牦牛HYOU1低氧适应基因的遗传多态性分析第55-63页
        3.4.1 PCR扩增产物检测第55页
        3.4.2 HYOU1基因SNPs的筛查和检测第55-58页
        3.4.3 基因型频率和等位基因频率及 χ2适合性检验第58-60页
        3.4.4 群体遗传多态性第60页
        3.4.5 各类群间基因型频率差异比较第60-61页
        3.4.6 各牦牛类群连锁不平衡分析第61-62页
        3.4.7 各牦牛类群单倍型分析第62-63页
    3.5 牦牛HMBS低氧适应基因的遗传多态性分析第63-74页
        3.5.1 PCR扩增产物检测第63-64页
        3.5.2 HMBS基因SNPs的筛查和检测第64-66页
        3.5.3 基因型频率和等位基因频率及 χ2适合性检验第66-68页
        3.5.4 群体遗传多态性第68-69页
        3.5.5 各类群间基因型频率差异比较第69-70页
        3.5.6 各牦牛类群连锁不平衡分析第70-71页
        3.5.7 各牦牛类群单倍型分析第71-74页
第四章 讨论第74-78页
    4.1 EPAS1基因的SNPs与低氧适应性的关系第74-75页
    4.2 EGLN1基因的SNPs与低氧适应性的关系第75-76页
    4.3 HYOU1基因的SNPs与低氧适应性的关系第76页
    4.4 HMBS基因的SNPs与低氧适应性的关系第76-78页
第五章 结论第78-79页
参考文献第79-85页
附录第85-86页
致谢第86页

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