| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 引言 | 第11-13页 |
| 第一章 微卫星标记概述及其在水产动物上的应用 | 第13-21页 |
| 1.1 DNA分子标记概述 | 第13-14页 |
| 1.2 微卫星原理 | 第14页 |
| 1.3 微卫星标记特点 | 第14-15页 |
| 1.3.1 含量丰富 | 第14页 |
| 1.3.2 多态性高 | 第14-15页 |
| 1.3.3 共显性遗传 | 第15页 |
| 1.3.4 保守性 | 第15页 |
| 1.3.5 检测方便且重复性好 | 第15页 |
| 1.4 微卫星序列的主要来源 | 第15-18页 |
| 1.4.1 从网上公布的序列中直接获得 | 第15-16页 |
| 1.4.2 借用近缘物种之间通用引物 | 第16-17页 |
| 1.4.3 从基因组文库中筛选阳性克隆 | 第17-18页 |
| 1.5 微卫星标记在水产动物上的应用 | 第18-20页 |
| 1.5.1 在亲缘关系上的应用 | 第18页 |
| 1.5.2 在群体遗传学上的应用 | 第18-19页 |
| 1.5.3 在系统发育上的应用 | 第19页 |
| 1.5.4 在遗传连锁图谱的构建及QTL的定位上的应用 | 第19页 |
| 1.5.5 在分子标记辅助育种上的应用 | 第19-20页 |
| 1.6 小结 | 第20-21页 |
| 第二章 DNA甲基化研究及其在水产动物中的应用 | 第21-28页 |
| 2.1 DNA甲基化概述 | 第21-22页 |
| 2.2 DNA甲基化分析检测技术 | 第22-23页 |
| 2.2.1 甲基化敏感扩增多态性 （ Methylation-sensitive amplifiedpolymorphism, MSAP）技术 | 第22页 |
| 2.2.2 高效液相色谱（high performance liquid chromatography, HPLC）技术 | 第22-23页 |
| 2.2.3 亚硫酸氢盐（Sodium Bisulfite）法 | 第23页 |
| 2.2.4 芯片技术 | 第23页 |
| 2.3 DNA甲基化在水产动物中的研究进展 | 第23-26页 |
| 2.3.1 DNA甲基化与胚胎发育 | 第24页 |
| 2.3.2 DNA甲基化与杂种优势 | 第24-25页 |
| 2.3.3 环境因素对DNA甲基化的影响 | 第25-26页 |
| 2.4 刺参的基因组DNA甲基化的研究 | 第26-27页 |
| 2.5 小结 | 第27-28页 |
| 第三章 普通刺参和白刺参遗传变异的微卫星DNA分析 | 第28-39页 |
| 3.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 3.2 实验方法 | 第29-32页 |
| 3.2.1 基因组DNA提取 | 第29页 |
| 3.2.2 微卫星DNA引物的来源 | 第29页 |
| 3.2.3 微卫星DNA的扩增 | 第29-30页 |
| 3.2.4 数据统计处理 | 第30-32页 |
| 3.3 结果 | 第32-35页 |
| 3.3.1 PCR扩增结果及遗传多样性水平 | 第32-34页 |
| 3.3.2 2 群体之间的遗传距离及遗传相似性指数 | 第34页 |
| 3.3.3 群体遗传分化及Fis | 第34-35页 |
| 3.4 讨论 | 第35-38页 |
| 3.4.1 遗传多样性指数 | 第35-36页 |
| 3.4.2 杂合子缺失 | 第36页 |
| 3.4.3 刺参2群体遗传多样性比较 | 第36-37页 |
| 3.4.4 刺参2群体的遗传距离及分化指数 | 第37-38页 |
| 3.5 小结 | 第38-39页 |
| 第四章 普通刺参和白刺参不同组织基因组DNA的MSAP研究 | 第39-51页 |
| 4.1 实验材料 | 第40页 |
| 4.2 基因组DNA提取 | 第40页 |
| 4.3 MSAP分析 | 第40-41页 |
| 4.3.1 酶切和连接反应体系 | 第40页 |
| 4.3.2 预扩增反应 | 第40-41页 |
| 4.3.3 选择性扩增反应 | 第41页 |
| 4.4 MSAP条带统计及数据分析 | 第41-42页 |
| 4.5 结果 | 第42-48页 |
| 4.5.1 引物筛选 | 第42页 |
| 4.5.2 MSAP带型分析 | 第42-43页 |
| 4.5.3 不同组织间基因组DNA甲基化水平差异 | 第43-45页 |
| 4.5.4 刺参不同群体间DNA甲基化水平差异 | 第45-48页 |
| 4.6 讨论 | 第48-50页 |
| 4.6.1 刺参的甲基化水平 | 第48页 |
| 4.6.2 刺参不同组织基因组DNA甲基化模式具有特异性 | 第48-49页 |
| 4.6.3 白刺参与普通刺参基因组DNA甲基化的比较 | 第49-50页 |
| 4.7 小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-62页 |
| 附录 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
