| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第13-15页 |
| 前言 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-32页 |
| 1.1 体细胞胚胎发生 | 第16-17页 |
| 1.2 激素与体细胞胚胎发生 | 第17-18页 |
| 1.3 胁迫与体细胞胚胎发生 | 第18-19页 |
| 1.4 体细胞胚胎发生过程中的基因表达 | 第19-22页 |
| 1.4.1 Somatic embryogenesis receptor kinase(SERK)与体细胞胚胎发生 | 第19-20页 |
| 1.4.2 Leafy cotyledon (LEC)与体细胞胚胎发生 | 第20-21页 |
| 1.4.3 Wuschel (WUS)与体细胞胚胎发生 | 第21页 |
| 1.4.4 Germin- like protein encoding genes (GLPs)与体细胞胚胎发生 | 第21-22页 |
| 1.5 体细胞胚胎发生中的表观修饰 | 第22-26页 |
| 1.5.1 DNA甲基化 | 第22-23页 |
| 1.5.2 染色质重组 | 第23页 |
| 1.5.3 Micro RNA | 第23-26页 |
| 1.6 多胺及其与体细胞胚胎发生的关系 | 第26-27页 |
| 1.7 转录组学在植物相关领域研究进展 | 第27-28页 |
| 1.8 蛋白组学在植物相关领域研究进展 | 第28-29页 |
| 1.9 棉花体细胞胚胎发生相关研究进展 | 第29-32页 |
| 第二章 棉花(G. hirsutum L.)体细胞胚胎发生De novo转录组研究 | 第32-63页 |
| 2.1 材料与方法 | 第32-36页 |
| 2.1.1 植物材料及培养条件 | 第32-33页 |
| 2.1.2 RNA提取、文库构建以及RNA测序 | 第33页 |
| 2.1.3 测序数据分析以及差异表达基因的鉴定 | 第33-34页 |
| 2.1.4 液体悬浮系的建立以获得均一化的胚性愈伤组织 | 第34页 |
| 2.1.5 外源IAA、K T、多胺、H2O2以及胁迫处理 | 第34-35页 |
| 2.1.6 HPLC法测定棉花组织多胺 | 第35页 |
| 2.1.7 DAB染色法测定组织过氧化氢 | 第35页 |
| 2.1.8 ELISA法测定内源激素 | 第35页 |
| 2.1.9 RNA提取及实时荧光定量PCR | 第35-36页 |
| 2.1.10 统计分析 | 第36页 |
| 2.2 结果 | 第36-57页 |
| 2.2.1 RNA测序及转录组de novo组装 | 第36-37页 |
| 2.2.2 基因鉴定及功能注释 | 第37-38页 |
| 2.2.3 棉花体细胞胚胎发生过程中差异表达基因的比较分析 | 第38-40页 |
| 2.2.4 差异表达基因KEGG分析 | 第40-47页 |
| 2.2.5 棉花体细胞胚胎发生过程中的光合作用和碳同化 | 第47-49页 |
| 2.2.6 棉花体细胞胚胎发生过程中的转录因子 | 第49页 |
| 2.2.7 生长素和细胞分裂素在胚性愈伤组织分化及胚状体形成过程中的作用 | 第49-52页 |
| 2.2.8 多胺促进棉花体细胞胚胎发生 | 第52页 |
| 2.2.9 活性氧(ROS)能够调控棉花体细胞胚胎发生 | 第52-55页 |
| 2.2.10 胁迫可以诱导棉花体细胞胚胎发生 | 第55-56页 |
| 2.2.11 棉花体细胞胚胎发生过程中脂肪酸合成与代谢 | 第56-57页 |
| 2.3 讨论 | 第57-63页 |
| 2.3.1 转录因子调控棉花体细胞胚胎发生 | 第57页 |
| 2.3.2 生长素、细胞分裂素是调控棉花体细胞胚胎发生的重要因素 | 第57-58页 |
| 2.3.3 多胺和体细胞胚胎发生的关系 | 第58页 |
| 2.3.4 其他激素在棉花体细胞胚胎发生中可能的作用 | 第58-63页 |
| 第三章 基于i TRAQ的棉花体细胞胚胎发生过程比较蛋白组学研究 | 第63-85页 |
| 3.1 材料与方法 | 第64-68页 |
| 3.1.1 新陆早33号的组织培养及体细胞胚胎发生 | 第64-65页 |
| 3.1.2 蛋白质提取 | 第65页 |
| 3.1.3 蛋白质浓度测量 | 第65-66页 |
| 3.1.4 SDS电泳 | 第66页 |
| 3.1.5 蛋白质酶解 | 第66页 |
| 3.1.6 i TRAQ标记 | 第66页 |
| 3.1.7 SCX分离 | 第66-67页 |
| 3.1.8 基于QE的液质联用分析 | 第67页 |
| 3.1.9 蛋白测序数据分析 | 第67页 |
| 3.1.10 生物信息学分析 | 第67-68页 |
| 3.1.11 RNA提取及实时荧光定量PCR | 第68页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第68-85页 |
| 3.2.1 新陆早33号体细胞胚胎发生 | 第68-69页 |
| 3.2.2 原始数据分析及蛋白鉴定 | 第69-70页 |
| 3.2.3 蛋白测序样品组内重复性检测 | 第70-71页 |
| 3.2.4 差异表达蛋白的功能聚类 | 第71-72页 |
| 3.2.5 差异表达蛋白的统计 | 第72-73页 |
| 3.2.6 差异表达蛋白的KEGG通路注释 | 第73-76页 |
| 3.2.7 差异表达蛋白的转录水平分析 | 第76-77页 |
| 3.2.8 差异表达蛋白的聚类分析 | 第77-78页 |
| 3.2.9 参与植物激素信号转导相关差异蛋白 | 第78-80页 |
| 3.2.10 棉花体细胞胚胎发生过程中遗传信息相关蛋白 | 第80页 |
| 3.2.11 次生代谢产物相关蛋白广泛地参与了棉花体细胞胚胎发生 | 第80页 |
| 3.2.12 棉花体细胞胚胎发生过程中糖酵解和糖异生作用 | 第80-81页 |
| 3.2.13 棉花体细胞胚胎发生过程的脂肪酸合成和代谢 | 第81页 |
| 3.2.14 棉花体细胞胚胎发生中的半乳糖代谢 | 第81-82页 |
| 3.2.15 棉花体细胞胚胎发生过程转录组、蛋白组关联分析及差异表达相关性 | 第82-85页 |
| 第四章 棉花组织多胺HPLC测定方法的建立及其在体细胞胚胎发生过程中的变化规律 | 第85-93页 |
| 4.1 材料与方法 | 第85-86页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第85-86页 |
| 4.1.2 试剂与仪器 | 第86页 |
| 4.1.3 试验方法 | 第86页 |
| 4.2 结果与分析 | 第86-91页 |
| 4.2.1 多胺标准品HPLC测定 | 第86-88页 |
| 4.2.2 棉花组织培养物多胺HPLC测定方法的优化 | 第88-89页 |
| 4.2.3 棉花组织培养物HPLC测定 | 第89-90页 |
| 4.2.4 回收率测定 | 第90页 |
| 4.2.5 棉花体细胞胚胎发生不同时期多胺含量的变化 | 第90-91页 |
| 4.3 讨论 | 第91-93页 |
| 第五章 多胺调控棉花体细胞胚胎发生的生理及分子机制研究 | 第93-112页 |
| 5.1 材料与方法 | 第94-96页 |
| 5.1.1 新陆早33号棉花的组织培养及体细胞胚胎发生 | 第94页 |
| 5.1.2 液体悬浮系的建立以获得均一化的胚性愈伤组织 | 第94页 |
| 5.1.3 外源物质处理 | 第94-95页 |
| 5.1.4 HPLC法测定棉花组织多胺 | 第95页 |
| 5.1.5 过氧化氢和一氧化氮的测定 | 第95页 |
| 5.1.6 DAB染色法测定组织过氧化氢 | 第95页 |
| 5.1.7 多胺氧化酶活性测定 | 第95-96页 |
| 5.1.8 相关基因的描述及认定 | 第96页 |
| 5.1.9 RNA提取及实时荧光定量PCR | 第96页 |
| 5.1.10 统计分析 | 第96页 |
| 5.2 结果与分析 | 第96-109页 |
| 5.2.1 内源多胺在胚性愈伤组织和胚状体形成初期显著增加 | 第96-98页 |
| 5.2.2 外源多胺能够促进棉花胚性愈伤组织向胚状体的转化 | 第98-101页 |
| 5.2.3 H_2O_2和NO在棉花胚性愈伤组织向胚状体转化过程中的作用 | 第101-105页 |
| 5.2.4 H_2O_2缓解多胺合成抑制剂D-arg的效果促进了胚性愈伤组织向胚状体的转化 | 第105页 |
| 5.2.5 多胺氧化酶在棉花胚性愈伤组织向胚状体转化时起到很重要的正向调控作用 | 第105-109页 |
| 5.3 讨论 | 第109-112页 |
| 第六章 全文结论与创新点 | 第112-114页 |
| 6.1 主要结论 | 第112-113页 |
| 6.2 特色与创新点 | 第113-114页 |
| 参考文献 | 第114-134页 |
| 附录A | 第134-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
| 作者简介 | 第144-146页 |
| 附表 | 第146页 |
