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一种基于新型引物设计策略的丙型肝炎病毒逆转录荧光定量PCR检测方法的研究

英文缩略词第6-8页
中文摘要第8-10页
英文摘要第10-12页
前言第13-17页
1. 材料和方法第17-51页
    1.1. 实验材料和试剂配制第17-20页
    1.2. 方法第20-50页
        1.2.1. HCV RNA新的引物设计策略的制定第20-31页
            1.2.1.1. 各亚型保守区分析第20-22页
            1.2.1.2. 5'-UTR二级结构分析第22-23页
            1.2.1.3. HCV RNA降解机制分析第23-30页
            1.2.1.4. 新的引物设计策略的内容第30-31页
        1.2.2. HCV RNA新的检测体系的建立第31-36页
            1.2.2.1. 核酸的提取第31-33页
            1.2.2.2. 核酸扩增体系和扩增参数第33-34页
            1.2.2.3. 经验条件下初步检测第34-36页
        1.2.3. HCV RNA检测体系的优化第36-41页
            1.2.3.1. 检测体系优化的目的第36页
            1.2.3.2. 核酸提取柱的选择第36-37页
            1.2.3.3. 核酸扩增体系和扩增参数的选择第37-40页
            1.2.3.4. 核酸检测定量第40-41页
        1.2.4. HCV RNA检测体系的方法学性能评价第41-45页
            1.2.4.1. 最低检出限第41页
            1.2.4.2. 重复性第41-42页
            1.2.4.3. 特异性第42页
            1.2.4.4. 线性第42页
            1.2.4.5. 一致性第42-45页
        1.2.5. HCV RNA新的引物设计策略的正确性验证第45-47页
            1.2.5.1. 多对扩增引物的选择第45-46页
            1.2.5.2. RNA稳定时引物设计长度和位置的比较第46页
            1.2.5.3. RNA不稳定时引物设计长度和位置的比较第46-47页
        1.2.6. HCV RNA新的检测方法的临床实用性验证第47-50页
            1.2.6.1. 临床样本的处理第47页
            1.2.6.2. 不同商品化试剂盒的核酸提取扩增第47-50页
            1.2.6.3. 本方法与商品化试剂盒的比较第50页
    1.3. 统计学分析第50-51页
2. 结果第51-88页
    2.1. HCV RNA新的检测体系的建立第51-54页
        2.1.1. 未优化体系经验条件下初测第53-54页
    2.2. HCV RNA检测体系的优化第54-58页
        2.2.1. 最佳核酸提取柱的确定第54-55页
        2.2.2. 最佳核酸扩增体系和循环参数的确定第55-58页
    2.3. HCV RNA检测体系的方法学性能评价第58-66页
        2.3.1. 最低检出限第58-60页
        2.3.2. 重复性第60-62页
        2.3.3. 特异性第62页
        2.3.4. 线性第62-64页
        2.3.5. 一致性第64-66页
    2.4. HCV RNA新的引物设计策略的正确性验证第66-75页
        2.4.1. 多对扩增引物的长度比较和位置分布第66-69页
        2.4.2. RNA稳定时引物设计长度和位置的影响第69-72页
        2.4.3. RNA不稳定时引物设计长度和位置的影响第72-75页
    2.5. HCV RNA新的检测方法的临床实用性验证第75-81页
        2.5.1. RNA稳定时与商品化试剂盒比较第75-78页
        2.5.2. RNA不稳定时与商品化试剂盒比较第78-81页
    3. 讨论第81-88页
参考文献第88-94页
论文综述——HCV RNA降解机制和意义的研究现状第94-122页
    参考文献第116-122页
附录1. 42名丙型肝炎患者初始检测信息表第122-124页
附录2. HCV各亚型血清盘详细信息第124-127页
附录3. 各亚型在GENBANK的详细信息第127-133页
附录4. 根据各基因型序列的保守区分析的候选引物第133-137页
致谢第137-139页
个人简介第139页

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