基于基因本体术语相似性的通路功能网络构建和分析
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| 1.1 课题研究背景及目的意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-14页 |
| 1.2.1 分子网络研究现状 | 第10-12页 |
| 1.2.2 通路研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 主要研究内容 | 第14页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第14-17页 |
| 第2章 相关技术知识介绍 | 第17-31页 |
| 2.1 生物分子网络构建 | 第17-19页 |
| 2.2 基因差异表达分析 | 第19-22页 |
| 2.3 通路注释分析 | 第22-26页 |
| 2.4 本体节点相似性计算方法 | 第26-30页 |
| 2.5 本章小结 | 第30-31页 |
| 第3章 基于通路的功能网络构建 | 第31-43页 |
| 3.1 研究数据介绍 | 第31-36页 |
| 3.1.1 基因命名数据 | 第31-32页 |
| 3.1.2 基因表达数据 | 第32-33页 |
| 3.1.3 蛋白质互作数据 | 第33-34页 |
| 3.1.4 通路数据 | 第34-35页 |
| 3.1.5 基因本体数据 | 第35-36页 |
| 3.2 差异表达基因筛选和基因相似性计算 | 第36-39页 |
| 3.2.1 基因差异表达分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 基因相似性计算 | 第37-39页 |
| 3.3 通路网络构建 | 第39-41页 |
| 3.3.1 通路关联构建 | 第39-40页 |
| 3.3.2 通路关联显著性检验 | 第40-41页 |
| 3.4 风险通路识别和功能模块挖掘 | 第41页 |
| 3.5 本章小结 | 第41-43页 |
| 第4章 实验结果和分析 | 第43-58页 |
| 4.1 乳腺癌差异表达基因筛选结果 | 第43页 |
| 4.2 风险通路识别结果 | 第43-44页 |
| 4.3 结果对比与分析 | 第44-53页 |
| 4.4 网络模块挖掘结果和分析 | 第53-57页 |
| 4.5 本章小结 | 第57-58页 |
| 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 个人简历 | 第68页 |
