| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 甘薯 | 第11-12页 |
| 1.1.1 甘薯简介 | 第11页 |
| 1.1.2 紫色甘薯 | 第11-12页 |
| 1.2 基因重复 | 第12-14页 |
| 1.2.1 基因重复的概述 | 第12页 |
| 1.2.2 基因重复后的分化机制 | 第12-13页 |
| 1.2.3 基因重复后的表达分化 | 第13页 |
| 1.2.4 基因家族 | 第13-14页 |
| 1.3 bHLH转录因子 | 第14-16页 |
| 1.3.1 转录因子 | 第14页 |
| 1.3.2 bHLH转录因子的结构特征 | 第14页 |
| 1.3.3 bHLH转录因子的分类 | 第14-15页 |
| 1.3.4 bHLH转录因子的研究进展 | 第15页 |
| 1.3.5 bHLH转录因子在植物中的功能研究 | 第15-16页 |
| 1.4 花青素生物合成途径及其研究进展 | 第16-20页 |
| 1.4.1 花青素结构和种类 | 第16-17页 |
| 1.4.2 植物花青素合成途径 | 第17-18页 |
| 1.4.3 影响花青素积累的相关因素 | 第18-19页 |
| 1.4.4 植物花青素生物合成相关基因的研究 | 第19-20页 |
| 1.4.5 花青素功能研究 | 第20页 |
| 1.5 甘薯中bHLH转录因子的研究进展 | 第20-21页 |
| 1.6 本文的研究内容和意义 | 第21-23页 |
| 2 实验材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 本研究使用的实验材料 | 第23页 |
| 2.2 转录组测序 | 第23-25页 |
| 2.2.1 甘薯样品RNA的提取 | 第23页 |
| 2.2.2 甘薯块根RNA质量检测 | 第23-24页 |
| 2.2.3 Illumina文库构建 | 第24页 |
| 2.2.4 文库测序 | 第24页 |
| 2.2.5 Illumina SGS数据的质量过滤和转录组的组装 | 第24页 |
| 2.2.6 实验数据库的获得 | 第24-25页 |
| 2.2.7 序列的功能注释 | 第25页 |
| 2.3 甘薯中总花青素的提取 | 第25-26页 |
| 2.3.1 甘薯中总花青素的提取 | 第25-26页 |
| 2.3.2 甘薯中总花青素含量的计算 | 第26页 |
| 2.4 在甘薯转录本中bHLH转录因子的鉴定 | 第26-27页 |
| 2.5 系统发育树分析 | 第27页 |
| 2.6 MEME分析 | 第27页 |
| 2.7 表达量获得及聚类图的绘制 | 第27页 |
| 2.8 GEM关联分析 | 第27-28页 |
| 2.9 茉莉酸（JA）和赤霉素（GA）处理 | 第28-29页 |
| 2.9.1 茉莉酸（JA）处理 | 第28页 |
| 2.9.2 赤霉素（GA）处理 | 第28-29页 |
| 2.10 基因表达量分析 | 第29-33页 |
| 2.10.1 总RNA的提取 | 第29-30页 |
| 2.10.2 mRNA反转录 | 第30页 |
| 2.10.3 片段的扩增 | 第30-31页 |
| 2.10.4 实时定量PCR实验 | 第31-33页 |
| 3 结果分析 | 第33-53页 |
| 3.1 甘薯bHLH基因家族的信息学分析 | 第33-47页 |
| 3.1.1 甘薯bHLH基因家族的鉴定 | 第33-34页 |
| 3.1.2 甘薯bHLH基因家族的系统发育及保守结构域分析 | 第34-36页 |
| 3.1.3 甘薯和拟南芥bHLH转录因子系统发育树分析 | 第36-43页 |
| 3.1.4 甘薯bHLH转录因子的表达量分析 | 第43-47页 |
| 3.2 甘薯块根中花青素含量与bHLH基因 | 第47-51页 |
| 3.2.1 不同种质甘薯块根中花青素含量的测定 | 第47-48页 |
| 3.2.2 甘薯块根花青素含量显著关联的bHLH基因 | 第48-49页 |
| 3.2.3 bHLH基因在甘薯8个组织中实时定量PCR实验 | 第49-51页 |
| 3.3 甘薯中bHLH基因在茉莉酸和赤霉素处理下的表达模式 | 第51-53页 |
| 4 讨论 | 第53-59页 |
| 4.1 基于转录组鉴定IbbHLH转录因子的可行性 | 第53页 |
| 4.2 拟南芥bHLH转录因子直系同源基因的功能预测 | 第53-55页 |
| 4.2.1 bHLH基因响应植物胁迫 | 第54页 |
| 4.2.2 bHLH基因影响植物生长发育 | 第54-55页 |
| 4.3 bHLH基因家族成员在甘薯不同种质和组织的功能分化 | 第55页 |
| 4.3.1 bHLH基因在甘薯不同种质中的表达差异分析 | 第55页 |
| 4.3.2 bHLH基因在甘薯不同组织中的表达差异分析 | 第55页 |
| 4.4 植物中花青素含量的差异 | 第55-56页 |
| 4.5 甘薯块根中花青素合成相关基因IbbHLH2的分析 | 第56-57页 |
| 4.6 甘薯bHLH基因与茉莉酸和赤霉素信号转导分析 | 第57-59页 |
| 5 结论 | 第59-61页 |
| 附录 | 第61-69页 |
| 参考文献 | 第69-79页 |
| 致谢 | 第79-81页 |
| 作者简介 | 第81-83页 |
| 学位论文数据集 | 第83页 |
