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基于中间锦鸡儿干旱转录组开发SSR标记及遗传多样性研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略语表第10-11页
1 引言第11-17页
    1.1 分子标记主要类型概述第11-13页
        1.1.1 限制性片段长度多态性第11-12页
        1.1.2 随机扩增多态性DNA第12页
        1.1.3 扩增片段长度多态性第12页
        1.1.4 微卫星标记第12-13页
        1.1.5 简单重复间序列第13页
        1.1.6 单核苷酸多态性第13页
    1.2 SSR标记的应用第13-14页
    1.3 EST-SSR的通用性第14页
    1.4 中间锦鸡儿和柠条锦鸡儿的研究概况第14-15页
        1.4.1 锦鸡儿属植物的地理分布第14页
        1.4.2 中间锦鸡儿与柠条锦鸡儿的亲缘关系第14-15页
        1.4.3 锦鸡儿属植物应用及价值第15页
        1.4.4 锦鸡儿属植物的遗传多样性研究第15页
    1.5 研究的目的和意义第15-17页
2 实验材料和方法第17-21页
    2.1 植物材料第17页
    2.2 实验试剂第17-18页
    2.3 仪器设备第18页
    2.4 研究方法第18-21页
        2.4.1 DNA的提取与检测第18-19页
        2.4.2 中间锦鸡儿SSR标记位点识别第19页
        2.4.3 SSR引物设计和合成第19页
        2.4.4 SSR有效引物的确定、多态性位点筛选第19-20页
        2.4.5 引物的通用性检测第20页
        2.4.6 数据统计与分析第20页
        2.4.7 本研究所用的软件第20-21页
3 结果与分析第21-36页
    3.1 中间锦鸡儿基因组DNA的提取与检测第21页
    3.2 中间锦鸡儿干旱转录组中SSR位点的分布特点第21-22页
    3.3 中间锦鸡儿干旱转录组SSR的特性第22页
    3.4 SSR引物设计与有效引物的确定第22-23页
    3.5 多态性引物筛选第23-25页
    3.6 多态性位点的测序验证第25-26页
    3.7 SSR引物通用性鉴定第26-27页
    3.8 柠条锦鸡儿中多态性的鉴定第27-28页
    3.9 SSR位点遗传多样性分析第28-29页
    3.10 居群间遗传多样性分析第29-30页
    3.11 种群的遗传距离、遗传一致度和聚类分析第30-32页
    3.12 居群的F值和基因流统计第32-33页
    3.13 遗传距离与地理距离的分析第33-34页
    3.14 种群遗传变异分析第34-36页
4 讨论与结论第36-40页
    4.1 讨论第36-38页
        4.1.1 中间锦鸡儿干旱转录组SSR分子标记第36页
        4.1.2 SSR引物的开发及通用性第36-37页
        4.1.3 居群的遗传多样性分析第37页
        4.1.4 居群的遗传分化分析第37-38页
        4.1.5 居群遗传多样性低的原因第38页
    4.2 结论第38-40页
致谢第40-41页
参考文献第41-48页
附录第48-53页
作者简介第53页

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