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LncRNA介导人基因组DNA甲基化研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第9-20页
    1.1 DNA甲基化的研究第9-15页
        1.1.1 DNA甲基化概述第9-11页
        1.1.2 DNA甲基化研究进展第11-15页
    1.2 LncRNA的概述和研究进展第15-17页
    1.3 ncRNA介导DNA甲基化研究第17-20页
第2章 实验材料第20-24页
    2.1 实验设备和试剂耗材第20-22页
        2.1.1 实验主要设备及器材第20-21页
        2.1.2 试剂耗材第21-22页
    2.2 抗体信息第22页
    2.3 引物信息第22-23页
    2.4 细胞来源第23-24页
第3章 实验方法第24-41页
    3.1 Dnmt3a,Dnmt3b,Dnmt1基因序列信息获得第24-25页
    3.2 H9-ESC细胞复苏第25-27页
        3.2.1 用metrigel包被细胞培养皿(扣板)第25页
        3.2.2 Complete TESRTM-E8配制第25-26页
        3.2.3 复苏ES-H9细胞第26-27页
    3.3 胚胎干细胞ES-H9传代第27-28页
    3.4 细胞冻存第28-29页
    3.5 ES细胞向NPC的诱导分化第29-31页
    3.6 NPC细胞传代第31-33页
    3.7 免疫荧光染色第33-34页
    3.8 Trizol法抽提RNA第34-35页
    3.9 去除RNA中的基因组DNA第35页
    3.10 酚氯仿纯化抽提RNA第35-36页
    3.11 RT-qPCR第36-37页
    3.12 RNA免疫沉淀第37-39页
    3.13 RIP-seq数据分析第39-40页
    3.14 转录物组装和合并软件:cufflink使用和ncRNA预测第40-41页
第4章 结果与分析第41-65页
    4.1 ES-H9细胞系的免疫组化鉴定第41-43页
    4.2 ES细胞向NPC细胞分化和分化过程中Dnmts表达量检查结果第43-49页
        4.2.1 ES-H9细胞向NPC细胞分化及NPC细胞鉴定第43-44页
        4.2.2 ES-H9细胞向NPC分化过程中Dnmt3a和Dnmt3b的表达量变化第44-49页
    4.3 RNA免疫共沉淀与捕获能够和Dnmt3b结合的RNA并分析RNA的类型和数量第49-55页
    4.4 人ES-H9细胞分化过程中Dnmt3b在基因组中的定位第55-65页
        4.4.1 人ES向NPC细胞分化过程中与Dnmt3b结合的RNA在基因上的定位及其在基因组结合位点附近基因的甲基化情况第57-62页
        4.4.2 人细胞中Dnmt3b在基因组上结合位点附近基因的功能分析第62-65页
第5章 讨论第65-67页
致谢第67-69页
参考文献第69-74页

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