| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 研究背景与文献综述 | 第13-65页 |
| 1.1 生物分子功能环 | 第13-18页 |
| 1.1.1 生物分子功能环对纳米材料功能的影响 | 第14页 |
| 1.1.2 生物分子功能环对生物大分子的影响 | 第14-17页 |
| 1.1.3 生物功能环与细胞的反应 | 第17-18页 |
| 1.2 沸石与凝血酶体系 | 第18-28页 |
| 1.2.1 凝血酶 | 第18-23页 |
| 1.2.2 沸石及其在生物医学中的应用 | 第23-28页 |
| 1.3 单壁碳纳米管和葡萄糖氧化酶 | 第28-39页 |
| 1.3.1 葡萄糖氧化酶 | 第28-34页 |
| 1.3.2 单壁碳纳米管及其在葡萄糖传感器中的应用 | 第34-39页 |
| 1.4 选题意义和本论文工作 | 第39-41页 |
| 1.4.1 选题意义 | 第39-40页 |
| 1.4.2 本论文工作 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-65页 |
| 第二章 分子动力学模拟方法 | 第65-86页 |
| 2.1 分子模拟简介 | 第65-66页 |
| 2.2 分子动力学模拟的基本流程 | 第66-67页 |
| 2.3 常见力场 | 第67-71页 |
| 2.4 分子动力学算法 | 第71-75页 |
| 2.4.1 求解运动方程 | 第71-73页 |
| 2.4.2 周期性边界条件 | 第73-74页 |
| 2.4.3 系综 | 第74-75页 |
| 2.5 操纵式分子动力学模拟(SMD) | 第75-77页 |
| 2.5.1 SMD模拟简介 | 第75页 |
| 2.5.2 SMD模拟原理 | 第75-77页 |
| 2.6 分子动力学模拟的发展限制 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-86页 |
| 第三章 凝血酶在沸石表面的特异性吸附研究 | 第86-108页 |
| 3.1 引言 | 第86-87页 |
| 3.2 模拟方法与模型 | 第87-88页 |
| 3.3 凝血酶在沸石表面自发形成蛋白质环的动力学过程 | 第88-95页 |
| 3.3.1 α笼子吸附位点 | 第89-92页 |
| 3.3.2 结构水层的阻碍作用 | 第92-94页 |
| 3.3.3 不同初始构型的吸附影响 | 第94-95页 |
| 3.4 蛋白质与沸石相互作用的关键残基 | 第95-97页 |
| 3.5 关键残基的结构共性 | 第97-98页 |
| 3.6 蛋白质构象变化及对活性的影响 | 第98-99页 |
| 3.7 与其他蛋白质吸附的对比 | 第99-100页 |
| 3.8 本章小结 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-108页 |
| 第四章 溶液中离子对酶或蛋白质吸附方式的影响 | 第108-125页 |
| 4.1 引言 | 第108页 |
| 4.2 模拟方法与模型 | 第108-109页 |
| 4.3 蛋白质在沸石表面吸附的动力学过程 | 第109-116页 |
| 4.3.1 结构水层的阻碍作用 | 第111-114页 |
| 4.3.2 结构离子层的阻碍作用 | 第114-116页 |
| 4.4 关键残基 | 第116-118页 |
| 4.5 离子对吸附方式的影响 | 第118-119页 |
| 4.6 本章小结 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-125页 |
| 第五章 材料的表面电性对吸附酶结构的影响 | 第125-143页 |
| 5.1 引言 | 第125-126页 |
| 5.2 模拟方法及模型 | 第126-127页 |
| 5.3 FAD在碳纳米管表面的吸附动力学过程 | 第127-128页 |
| 5.4 碳纳米管不同电性对吸附辅酶的影响 | 第128-137页 |
| 5.4.1 对吸附过程的影响 | 第129-133页 |
| 5.4.2 对相互作用能的影响 | 第133-136页 |
| 5.4.3 对脱附过程的影响 | 第136-137页 |
| 5.5 辅酶构象变化对酶活性的影响 | 第137页 |
| 5.6 本章小结 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-143页 |
| 第六章 总结与展望 | 第143-146页 |
| 6.1 工作小结 | 第143-144页 |
| 6.2 展望 | 第144-146页 |
| 致谢 | 第146-148页 |
| 博士期间学术研究成果 | 第148页 |