基于图形表示的DNA序列聚类与可靠性分析改进
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第9-21页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 研究现状 | 第10-18页 |
| 1.2.1 图形表示研究现状 | 第10页 |
| 1.2.2 相似性研究现状 | 第10-14页 |
| 1.2.2.1 序列比对方法 | 第11-13页 |
| 1.2.2.2 非序列比对方法 | 第13-14页 |
| 1.2.3 基于聚类算法的进化树构建算法 | 第14-18页 |
| 1.2.3.1 基于距离的系统发生树构建方法 | 第15-17页 |
| 1.2.3.2 基于离散特征的系统发生树构建方法 | 第17-18页 |
| 1.2.3.3 其他系统发生树构建方法 | 第18页 |
| 1.3 研究内容 | 第18-19页 |
| 1.4 论文框架结构 | 第19-21页 |
| 第二章 一种新的DNA序列图形表示方法 | 第21-26页 |
| 2.1 常见图形表示方法 | 第21-23页 |
| 2.1.1 2D图形表示法 | 第21-22页 |
| 2.1.2 3D图形表示方法 | 第22-23页 |
| 2.1.3 高维图形表示方法 | 第23页 |
| 2.2 本文提出的图形方法 | 第23-25页 |
| 2.3 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 DAN序列曲线的数值描述及相似性分析 | 第26-39页 |
| 3.1 常见数值矩阵及矩阵不变量 | 第26-28页 |
| 3.1.1 常见描述生物序列的数值矩阵 | 第26-27页 |
| 3.1.2 常用矩阵不变量 | 第27-28页 |
| 3.2 空间曲线的特征提取方法 | 第28-29页 |
| 3.3 相似性测度方法 | 第29-32页 |
| 3.3.1 常用的相似距离计算方法 | 第29-31页 |
| 3.3.2 循环比较方法 | 第31-32页 |
| 3.4 实验结果比较分析 | 第32-37页 |
| 3.5 本章小结 | 第37-39页 |
| 第四章 聚类分析及可靠性分析改进 | 第39-54页 |
| 4.1 聚类算法简介 | 第39页 |
| 4.2 系统发育树构建方法简介 | 第39-40页 |
| 4.3 可靠性评估 | 第40-42页 |
| 4.3.1 可靠性评估方法介绍 | 第40-41页 |
| 4.3.2 可靠性计算 | 第41-42页 |
| 4.4 BOOTSTRAP方法改进 | 第42-45页 |
| 4.5 实验结果分析 | 第45-53页 |
| 4.6 本章小结 | 第53-54页 |
| 第五章 总结和展望 | 第54-56页 |
| 5.1 研究工作总结 | 第54-55页 |
| 5.2 研究工作展望 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
