| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·研究背景及意义 | 第10-12页 |
| ·研究动态 | 第12-13页 |
| ·本文的研究思路 | 第13页 |
| ·本文的研究结构及安排 | 第13-16页 |
| 第二章 基因调控网络 | 第16-28页 |
| ·基因调控网络的概述 | 第16-20页 |
| ·概述 | 第16-17页 |
| ·数据集 | 第17-19页 |
| ·基因调控网络的研究方法 | 第19-20页 |
| ·基因调控网络的构建模型 | 第20-26页 |
| ·布尔网络模型 | 第20-21页 |
| ·线性组合模型和加权矩阵模型 | 第21-23页 |
| ·信息论模型 | 第23-24页 |
| ·贝叶斯网络模型 | 第24-25页 |
| ·神经网络模型 | 第25页 |
| ·微分方程模型 | 第25-26页 |
| ·基因调控网络的建模过程 | 第26-28页 |
| 第三章 微分方程模型及其演化 | 第28-36页 |
| ·微分方程模型 | 第28-30页 |
| ·微分方程的解法 | 第30-31页 |
| ·进化算法 | 第31-34页 |
| ·概述 | 第31-32页 |
| ·粒子群算法 | 第32-34页 |
| ·遗传编程算法 | 第34页 |
| ·微分方程模型的研究现状 | 第34-36页 |
| 第四章 灵活树模型及其优化 | 第36-44页 |
| ·灵活树模型 | 第36-39页 |
| ·概述 | 第36-37页 |
| ·进化操作 | 第37-38页 |
| ·适应度函数 | 第38-39页 |
| ·浮点数遗传算法 | 第39-41页 |
| ·概述 | 第39页 |
| ·编码 | 第39页 |
| ·进化算子 | 第39-40页 |
| ·适应度函数 | 第40页 |
| ·算法流程 | 第40-41页 |
| ·灵活树模型的优化流程 | 第41-44页 |
| 第五章 实验结果与分析 | 第44-52页 |
| ·概述 | 第44页 |
| ·虚拟细胞模拟实验 | 第44-46页 |
| ·三类Lotka-Volterra模型 | 第46-47页 |
| ·Regulator and Effector基因调控网络 | 第47-48页 |
| ·酵母基因调控网络 | 第48-52页 |
| 第六章 总结与展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |
| 附录 | 第62页 |