| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-14页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第14-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第15-37页 |
| 第一章 棉纤维发育过程及研究进展 | 第15-27页 |
| 1 棉纤维发育过程概述 | 第15-16页 |
| 2 棉纤维发育机制与重要基因 | 第16-27页 |
| ·纤维起始发育 | 第16-20页 |
| ·纤维伸长发育过程 | 第20-23页 |
| ·棉纤维次生壁增厚 | 第23-25页 |
| ·脱水成熟期 | 第25-27页 |
| 第二章 棉纤维发育转录组研究 | 第27-35页 |
| 1 转录组学的主要研究方法 | 第27-28页 |
| 2 基于微阵列的表达谱分析 | 第28-32页 |
| ·基因芯片技术的原理 | 第29-30页 |
| ·基因芯片的分类 | 第30页 |
| ·基因芯片在棉花中的应用 | 第30-32页 |
| 3 基于测序技术的表达谱分析手段 | 第32-35页 |
| 本研究的目的与意义 | 第35-37页 |
| 第二部分 研究报告 | 第37-83页 |
| 第三章 新乡小吉无绒无絮(XinWX)和新乡小吉无绒有絮(XinFLM)在纤维起始发育期的差异表达谱分析 | 第37-65页 |
| 1 材料与方法 | 第38-42页 |
| ·植物材料 | 第38页 |
| ·电镜材料准备及观察 | 第38页 |
| ·RNA提取和纯化 | 第38-39页 |
| ·RNA样品标记探针 | 第39-40页 |
| ·cDNA芯片杂交 | 第40页 |
| ·统计分析 | 第40-41页 |
| ·RNA反转录 | 第41页 |
| ·定量PCR分析 | 第41-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-60页 |
| ·XinWX和XinFLM成熟棉籽形态观察 | 第42页 |
| ·XinWX和XinFLM起始期胚珠电镜扫描结果 | 第42-44页 |
| ·XinWX和XinFLM在纤维发育起始期表达谱变化 | 第44-45页 |
| ·表达谱差异表达基因的定量验证 | 第45-47页 |
| ·相邻时期同一材料差异基因的GO功能注释与富集分析 | 第47-50页 |
| ·相同发育时期XinWX和XinFLM两个材料间差异表达基因的GO功能注释与富集分析 | 第50-52页 |
| ·转录因子分析 | 第52-57页 |
| ·激轰在纤维起始发育过程中的作用 | 第57-60页 |
| 3 讨论 | 第60-65页 |
| ·棉纤维起始发育表达谱研究材料的选择 | 第60页 |
| ·XinWX和XinFLM在纤维发育起始期具有不同的差异转录水平 | 第60页 |
| ·纤维起始发育过程中重要的代谢途径 | 第60-61页 |
| ·转录因子与纤维起始发育 | 第61-62页 |
| ·激素与纤维起始发育 | 第62-65页 |
| 第四章 茉莉酸及其合成代谢途径在纤维起始发育期作用分析 | 第65-83页 |
| 1 材料与方法 | 第66-69页 |
| ·材料 | 第66-67页 |
| ·丙二烯环化物氧化酶(AOC)进化分析 | 第67页 |
| ·植物材料的胁迫处理 | 第67页 |
| ·RNA提取 | 第67页 |
| ·cDNA反转录与定量PCR | 第67-68页 |
| ·棉花胚珠离体培养 | 第68-69页 |
| ·电镜观察 | 第69页 |
| 2 结果与分析 | 第69-80页 |
| ·AOC家族基因的进化分析 | 第69-71页 |
| ·AOC家族基因在纤维发育过程中的表达 | 第71-73页 |
| ·不同纤维发育突变体起始期AOC家族基因的表达分析 | 第73-75页 |
| ·外源茉莉酸对AOC基因的诱导表达 | 第75-76页 |
| ·芯片中茉莉酸合成代谢相关基因的表达分析 | 第76-77页 |
| ·外源添加不同浓度JA离体培养 | 第77-80页 |
| 3 讨论 | 第80-83页 |
| ·AOC调控茉莉酸以及纤维的起始发育 | 第80-81页 |
| ·茉莉酸参与纤维的起始发育 | 第81-83页 |
| 全文结论 | 第83-85页 |
| 本研究的创新点 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-103页 |
| 附录 | 第103-119页 |
| 致谢 | 第119-121页 |
| 攻读博士学位期间发表及待发表论文 | 第121页 |
