| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 第1章 引言 | 第14-28页 |
| ·嗜热菌多样性研究现状 | 第14-19页 |
| ·嗜热菌 | 第14-15页 |
| ·嗜热菌研究意义 | 第15页 |
| ·温泉嗜热菌 | 第15-18页 |
| ·温泉嗜热菌多样性 | 第16页 |
| ·温泉嗜热菌多样性研究方法 | 第16-17页 |
| ·不依赖培养的方式间接研究温泉菌多样性 | 第17-18页 |
| ·嗜热菌温度适应机制研究 | 第18-19页 |
| ·嗜热菌温度适应机制的研究方法与适应性进化技术 | 第19-22页 |
| ·嗜热菌温度适应机制的研究方法 | 第19-21页 |
| ·温度胁迫下的表达变化 | 第20页 |
| ·比较基因组学方法研究嗜热菌温度适应机制 | 第20-21页 |
| ·适应性进化(Experimental evolution)研究嗜热菌温度适应机制 | 第21-22页 |
| ·Geobacillus属研究进展 | 第22-26页 |
| ·Geobacillus的定义 | 第22-23页 |
| ·Geobacillus spp.应用 | 第23-24页 |
| ·Geobacillus遗传转化体系研究进展 | 第24-25页 |
| ·Geobacillus低温适应性及研究进展 | 第25-26页 |
| ·本研究的内容和意义 | 第26-28页 |
| 第2章 福州温泉细菌多样性 | 第28-56页 |
| ·材料和方法 | 第28-30页 |
| ·材料 | 第28页 |
| ·方法 | 第28-30页 |
| ·水体取样及样品处理 | 第28-29页 |
| ·温泉水体中总细菌的16S rDNA高通量测序 | 第29页 |
| ·温泉细菌多样性与温泉泉水理化性质的关系 | 第29页 |
| ·温泉底泥取样及处理 | 第29-30页 |
| ·可培养菌株16S rDNA序列的扩增、测序及比对 | 第30页 |
| ·细菌系统发育分析 | 第30页 |
| ·可培养细菌种类数据分析 | 第30页 |
| ·结果与分析 | 第30-49页 |
| ·温泉水非可培养细菌多样性 | 第30-42页 |
| ·温泉水理化性质分析 | 第30-31页 |
| ·水体样品基因组的提取与扩增 | 第31页 |
| ·Illumina MiSeq高通量测序数据处理 | 第31-36页 |
| ·各温泉水样中细菌分类学分析 | 第36-38页 |
| ·温泉微生物多样性与水体理化性质的相关性 | 第38-42页 |
| ·温泉底泥样品可培养细菌多样性 | 第42-49页 |
| ·采样点环境 | 第42页 |
| ·三处温泉底泥理化性质分析 | 第42页 |
| ·培养嗜热菌种属多样性 | 第42-43页 |
| ·培养嗜热菌的系统进化分析 | 第43-46页 |
| ·培养嗜热菌种类数目与环境关系 | 第46-49页 |
| ·讨论 | 第49-53页 |
| ·福州温泉非可培养细菌多样性影响因素 | 第49-51页 |
| ·可培养菌多样性与非可培养多样性的比较 | 第51-52页 |
| ·福州温泉细菌多样性与国内外温泉微生物的比较 | 第52-53页 |
| ·小结 | 第53-56页 |
| 第3章 嗜热菌Geobacillus sp.CHB1的低温适应机制 | 第56-93页 |
| ·材料与方法 | 第56-61页 |
| ·菌株和试剂 | 第56-57页 |
| ·Geobacillus sp.CHB1多相鉴定 | 第57-58页 |
| ·样品分离与保藏 | 第57页 |
| ·Geobacillus sp.CHB1的表型和生理生化特征鉴定 | 第57页 |
| ·Geobacillus sp.CHB1的16S rDNA鉴定 | 第57-58页 |
| ·细胞膜磷质脂肪酸鉴定 | 第58页 |
| ·基因组G+C百分含量测定 | 第58页 |
| ·Geobacillus sp.CHB1与近缘种的基因组杂交 | 第58页 |
| ·菌株CHB1适应低温进化 | 第58-61页 |
| ·初始菌株的准备 | 第59页 |
| ·适应低温进化实验 | 第59页 |
| ·适应低温生长的进化菌株的获取 | 第59页 |
| ·菌体生长曲线绘制 | 第59-60页 |
| ·脂肪酸的测定 | 第60页 |
| ·菌体总蛋白的提取 | 第60页 |
| ·总蛋白的SDS-PAGE电泳 | 第60页 |
| ·总蛋白的2-D电泳 | 第60-61页 |
| ·基因组测序 | 第61页 |
| ·结果与分析 | 第61-91页 |
| ·菌株CHB1的鉴定 | 第61-65页 |
| ·菌株CHB1菌株表型特征 | 第61页 |
| ·菌株CHB1的生理生化特征 | 第61-62页 |
| ·CHB1的16S rDNA同源性鉴定 | 第62页 |
| ·细胞膜磷脂脂肪酸组成分析 | 第62-64页 |
| ·CHB1与其它标准菌株基因组水平的差异 | 第64-65页 |
| ·菌株CHB1种属确定 | 第65页 |
| ·CHB1基因组特征 | 第65-68页 |
| ·菌株Geobacillus sp.CHB1的低温适应机制 | 第68-91页 |
| ·Geobacillus sp.CHB1的适应性进化 | 第68-70页 |
| ·进化菌株的确认 | 第70-72页 |
| ·进化菌株细胞膜磷脂脂肪酸水平变化 | 第72-74页 |
| ·蛋白组水平的变化 | 第74-80页 |
| ·比较基因组学分析Geobacillus sp.CHB1低温适应机制 | 第80-83页 |
| ·进化群体和进化个体的基因组水平的比较 | 第83-84页 |
| ·低温进化过程中表型改变 | 第84-91页 |
| ·讨论 | 第91-92页 |
| ·小结 | 第92-93页 |
| 第4章 过氧化氢酶与低温适应性 | 第93-109页 |
| ·材料与方法 | 第93-98页 |
| ·材料 | 第93页 |
| ·初始菌株和进化菌株的获取 | 第93-94页 |
| ·过氧化氢酶活性比较 | 第94页 |
| ·过氧化氢酶基因转录水平的测定 | 第94-95页 |
| ·过氧化氢对菌株生长的影响 | 第95页 |
| ·过氧化氢酶反应温度和pH测定 | 第95页 |
| ·过氧化氢酶基因的克隆和表达 | 第95-97页 |
| ·重组过氧化氢酶的纯化 | 第97-98页 |
| ·重组过氧化氢酶的动力学常数测定 | 第98页 |
| ·结果与分析 | 第98-106页 |
| ·初始菌株与进化菌株产过长氧化氢酶能力比较 | 第98-99页 |
| ·过氧化氢酶基因在翻译和转录水平的变化 | 第99-102页 |
| ·过氧化氢酶基因的克隆 | 第102页 |
| ·载体构建及表达 | 第102-104页 |
| ·菌株过氧化氢耐受性的改变 | 第104-105页 |
| ·过氧化氢酶的性质 | 第105-106页 |
| ·讨论 | 第106-108页 |
| ·小结 | 第108-109页 |
| 总结与展望 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-123页 |
| 附录 | 第123-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
