| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| ·课题研究背景 | 第10页 |
| ·课题研究的目的及意义 | 第10-12页 |
| ·课题研究目的 | 第11页 |
| ·课题研究意义 | 第11-12页 |
| ·甲型流感病毒进化的研究现状 | 第12-14页 |
| ·国外研究现状 | 第12-13页 |
| ·国内研究现状 | 第13-14页 |
| ·论文的研究内容及研究方法 | 第14-15页 |
| ·主要研究内容 | 第14页 |
| ·主要研究方法 | 第14-15页 |
| ·论文结构安排 | 第15-16页 |
| 第二章 流感病毒相关知识 | 第16-25页 |
| ·概述 | 第16页 |
| ·流感病毒概况 | 第16-18页 |
| ·流感病毒简介 | 第16-17页 |
| ·流感病毒进化历史 | 第17-18页 |
| ·流感病毒进化与变异机制 | 第18-19页 |
| ·抗原漂移 | 第18页 |
| ·抗原转变与基因重组 | 第18-19页 |
| ·生物信息学与流感病毒研究 | 第19-24页 |
| ·生物信息学概述 | 第19-20页 |
| ·生物信息学相关数据库 | 第20-23页 |
| ·生物信息学在流感病毒研究中的应用 | 第23-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 基于 PCA 的甲型流感病毒 HA 基因序列聚类分析方法 | 第25-41页 |
| ·概述 | 第25页 |
| ·PCA（主成分分析）与聚类分析 | 第25-29页 |
| ·PCA 概述 | 第26-27页 |
| ·聚类分析概述 | 第27-28页 |
| ·PCA 用于聚类分析 | 第28-29页 |
| ·HA 基因序列的获取 | 第29-30页 |
| ·HA 基因序列的对位排列 | 第30-34页 |
| ·MUSCLE 介绍 | 第30-31页 |
| ·对位排列 HA 基因序列 | 第31-33页 |
| ·基于时间顺序排列 HA 基因序列 | 第33-34页 |
| ·HA 基因序列的数字化映射 | 第34-37页 |
| ·HA 基因序列的 PCA 聚类分析 | 第37-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 世界地图背景上的流感样本映射与传播模拟 | 第41-52页 |
| ·概述 | 第41-42页 |
| ·世界地图背景上的流感样本映射方法 | 第42-45页 |
| ·菌株样本发生地的信息提取 | 第42-43页 |
| ·发生地经纬信息的检索与查询 | 第43-44页 |
| ·流感样本在世界地图背景上的映射 | 第44-45页 |
| ·流感病毒传播过程的动态模拟 | 第45-50页 |
| ·Flash 平台上的流感样本随时间推移的过程描述 | 第45-48页 |
| ·传播过程的动态模拟举例 1 | 第48-49页 |
| ·传播过程的动态模拟举例 2 | 第49-50页 |
| ·传播过程的动态模拟效果评价 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 人源甲型流感病毒的全球性进化与传播过程分析（1968－2012） | 第52-73页 |
| ·概述 | 第52页 |
| ·人源甲型流感 H1N1 病毒的全球性进化与传播规律 | 第52-59页 |
| ·H1N1 的进化特征分析（1976－2012） | 第53-55页 |
| ·H1N1 的进化与传播规律分析 | 第55-59页 |
| ·人源甲型流感 H3N2 病毒的全球性进化与传播规律 | 第59-65页 |
| ·H3N2 的进化特征分析（1968－2012） | 第59-61页 |
| ·H3N2 的进化与传播规律分析 | 第61-65页 |
| ·H1N1 和 H3N2 在 1968－2012 之间进化与传播的相互关系 | 第65-69页 |
| ·研究结果的对比讨论 | 第69-72页 |
| ·本章小结 | 第72-73页 |
| 第六章 结论与展望 | 第73-75页 |
| ·结论 | 第73-74页 |
| ·展望 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 个人简历、在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第80页 |
