坛紫菜转录组及应答高温胁迫的表达谱分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第1章 引言 | 第11-26页 |
| ·植物应答高温胁迫的研究进展概述 | 第12-18页 |
| ·植物对高温胁迫的生理响应 | 第13-14页 |
| ·植物对高温胁迫的分子响应 | 第14-18页 |
| ·紫菜抗逆机理研究进展 | 第18-20页 |
| ·转录组学研究技术 | 第20-23页 |
| ·表达序列标签（EST） | 第20-21页 |
| ·基因芯片技术 | 第21页 |
| ·RNA-Seq技术 | 第21-22页 |
| ·转录组学技术在海藻中的应用 | 第22-23页 |
| ·内参基因研究进展 | 第23-25页 |
| ·内参基因应具备的条件 | 第24页 |
| ·内参基因表达稳定性评估方法研究 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的意义 | 第25-26页 |
| 第2章 材料与方法 | 第26-39页 |
| ·实验材料及处理 | 第26-27页 |
| ·实验仪器 | 第27-28页 |
| ·实验试剂 | 第28页 |
| ·实验引物 | 第28-30页 |
| ·实验方法 | 第30-39页 |
| ·坛紫菜总RNA的提取 | 第30页 |
| ·总RNA的质量检测 | 第30页 |
| ·坛紫菜的转录组测序 | 第30-31页 |
| ·坛紫菜不同高温胁迫时期的表达谱测序 | 第31-34页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第34-35页 |
| ·基因克隆 | 第35-38页 |
| ·内参基因的筛选 | 第38-39页 |
| 第3章 实验结果 | 第39-109页 |
| ·坛紫菜的转录组测序分析 | 第39-47页 |
| ·实验样品RNA制备质量检测 | 第39-40页 |
| ·测序结果及组装 | 第40-41页 |
| ·转录组测序数据与数据库中坛紫菜EST的比较分析 | 第41-42页 |
| ·基因功能注释 | 第42-46页 |
| ·抗逆相关基因 | 第46-47页 |
| ·坛紫菜高温胁迫的表达谱分析 | 第47-61页 |
| ·测序质量评估 | 第47-48页 |
| ·Clean Tag拷贝数分布统计 | 第48-49页 |
| ·测序饱和度分析 | 第49-50页 |
| ·参考基因序列数据库的基本情况 | 第50页 |
| ·Clean Tag比对具体情况的统计分析 | 第50-52页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第52-55页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第55-57页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第57-59页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第59页 |
| ·表达谱结果的qRT-PCR验证 | 第59-61页 |
| ·坛紫菜定量内参基因的选择 | 第61-66页 |
| ·基因的特异性融解曲线 | 第61页 |
| ·基因的扩增效率及绝对表达量 | 第61-64页 |
| ·候选基因稳定性分析 | 第64-66页 |
| ·坛紫菜热激蛋白基因家族的克隆及分析 | 第66-109页 |
| ·坛紫菜热激蛋白基因家族的克隆 | 第66-68页 |
| ·坛紫菜PhHSP100基因的克隆及表达分析 | 第68-72页 |
| ·坛紫菜PhHSP90基因的克隆及表达分析 | 第72-80页 |
| ·坛紫菜PhHSP70基因的克隆及表达分析 | 第80-100页 |
| ·坛紫菜PhHSP60基因的克隆及表达分析 | 第100-103页 |
| ·坛紫菜PhHSP40基因的克隆及表达分析 | 第103-106页 |
| ·坛紫菜PhsHSP基因的克隆及表达分析 | 第106-109页 |
| 第4章 讨论 | 第109-116页 |
| ·坛紫菜转录组测序分析 | 第109-110页 |
| ·坛紫菜基因表达内参的选择 | 第110-112页 |
| ·坛紫菜高温胁迫的表达谱分析 | 第112-113页 |
| ·热激蛋白家族基因在坛紫菜高温胁迫应答中的作用 | 第113-116页 |
| 结论与展望 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-130页 |
| 附录 | 第130-136页 |
| 在学期间发表的学术论文 | 第136页 |
