| 摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-17页 |
| 縮略词表 | 第17-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-46页 |
| ·微生物对纤维素的降解策略 | 第19-23页 |
| ·游离纤维素酶系 | 第20-21页 |
| ·纤维小体复合酶系 | 第21-22页 |
| ·细胞结合型非复合体纤维素降解酶系 | 第22-23页 |
| ·纤维素水解产物的转运 | 第23-30页 |
| ·膜蛋白(Membrane Protein)的分类及功能 | 第23-25页 |
| ·细胞外膜的转运蛋白 | 第25-29页 |
| ·细胞内膜的转运蛋白 | 第29-30页 |
| ·细菌的运动模式 | 第30-36页 |
| ·细菌运动方式的分类 | 第30-32页 |
| ·Myxococcus xanthus的双运动系统 | 第32-33页 |
| ·Flavobacterium johnsoniae运动模式 | 第33-36页 |
| ·蛋白分泌系统 | 第36-41页 |
| ·Ⅰ型～Ⅳ型分泌系统 | 第36-38页 |
| ·Ⅴ型分泌系统 | 第38-40页 |
| ·Ⅸ型分泌系统 | 第40-41页 |
| ·Cytophaga hutchinsonii的研究进展 | 第41-43页 |
| ·论文的立题依据及研究内容 | 第43-46页 |
| 第二章 Cytophaga hutchinsonii培养条件优化及遗传操作体系的改进 | 第46-67页 |
| ·引言 | 第46-47页 |
| ·材料与方法 | 第47-54页 |
| ·菌种及质粒 | 第47-48页 |
| ·引物 | 第48-50页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第50页 |
| ·培养条件 | 第50-51页 |
| ·生物信息学分析 | 第51页 |
| ·不同琼脂浓度的固体培养 | 第51页 |
| ·野生型菌株的抗生素耐受 | 第51-52页 |
| ·常规分子生物学方法 | 第52-53页 |
| ·遗传操作 | 第53-54页 |
| ·荧光显微镜观察 | 第54页 |
| ·结果与分析 | 第54-65页 |
| ·固体培养基中琼脂浓度对生长的影响 | 第54-56页 |
| ·可利用抗生素种类的筛选 | 第56-57页 |
| ·接合及电转效率的比较 | 第57-59页 |
| ·可用于C.hutchinsonii体内表达的启动子序列鉴定 | 第59-63页 |
| ·抗性筛选标记的验证 | 第63-65页 |
| ·小结与讨论 | 第65-67页 |
| 第三章 Cytophaga hutchinsonii纤维素酶基因突变株构建及性质研究 | 第67-91页 |
| ·引言 | 第67-68页 |
| ·材料与方法 | 第68-78页 |
| ·菌种及质粒 | 第68-69页 |
| ·引物 | 第69-70页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第70页 |
| ·培养条件 | 第70-71页 |
| ·生物信息学分析 | 第71页 |
| ·常规分子生物学方法 | 第71-73页 |
| ·电转化 | 第73页 |
| ·突变株鉴定 | 第73-77页 |
| ·突变株性质测定 | 第77-78页 |
| ·结果与讨论 | 第78-90页 |
| ·C.hutchinsonii纤维素酶序列及结构域分析 | 第78-80页 |
| ·纤维素酶基因座位分析 | 第80-81页 |
| ·内切纤维素酶基因突变株的构建及验证 | 第81-85页 |
| ·突变株的表型测定 | 第85-87页 |
| ·纤维素利用相关蛋白的鉴定 | 第87-88页 |
| ·Bg1X(CHU_2268)的序列分析及研究 | 第88-90页 |
| ·小结与讨论 | 第90-91页 |
| 第四章 Cytophaga hutchinsonii CHU_1719突变株的性质研究 | 第91-122页 |
| ·引言 | 第91-92页 |
| ·材料与方法 | 第92-102页 |
| ·菌种及质粒 | 第92-93页 |
| ·引物 | 第93-94页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第94-95页 |
| ·培养条件 | 第95页 |
| ·生物信息学分析 | 第95页 |
| ·常规分子生物学方法 | 第95-96页 |
| ·电转化 | 第96页 |
| ·突变株鉴定 | 第96-97页 |
| ·突变株性质测定 | 第97-100页 |
| ·蛋白免疫印迹杂交(Western blot) | 第100-101页 |
| ·蛋白异源表达 | 第101-102页 |
| ·结果与分析 | 第102-120页 |
| ·chu_1719基因序列及蛋白结构域比对分析 | 第102-105页 |
| ·Chin1719插入失活突变株的构建及验证 | 第105-107页 |
| ·回补菌株的构建 | 第107-109页 |
| ·突变株及回补菌株的表型测定 | 第109-118页 |
| ·CHU_1719 N端结构的功能研究 | 第118-120页 |
| ·小结与讨论 | 第120-122页 |
| 第五章 Cytophaga hutchinsonii Sus-like基因的功能与性质研究 | 第122-165页 |
| ·引言 | 第122页 |
| ·材料与方法 | 第122-132页 |
| ·菌种及质粒 | 第122-125页 |
| ·引物 | 第125-128页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第128页 |
| ·培养条件 | 第128页 |
| ·生物信息学分析 | 第128页 |
| ·突变株鉴定 | 第128页 |
| ·总RNA的提取 | 第128-131页 |
| ·突变株性质测定 | 第131-132页 |
| ·蛋白异源表达 | 第132页 |
| ·结果与分析 | 第132-163页 |
| ·突变株Chin0546,Chin0553的研究 | 第132-137页 |
| ·chu_1276及其上下游基因的研究 | 第137-156页 |
| ·蛋白的异源表达 | 第156-162页 |
| ·T127纤维素利用相关基因的转录分析 | 第162-163页 |
| ·小结与讨论 | 第163-165页 |
| 第六章 Cytophaga hutchinsonii野生型和chu_1276转座突变株的转录组分析 | 第165-191页 |
| ·引言 | 第165页 |
| ·材料与方法 | 第165-170页 |
| ·菌种,培养基和培养条件 | 第165页 |
| ·主要试剂及仪器 | 第165-166页 |
| ·总RNA的提取 | 第166页 |
| ·总RNA中蛋白质杂质的去除 | 第166页 |
| ·RNA产率和纯度检测 | 第166页 |
| ·测序准备工作 | 第166-167页 |
| ·基因表达水平研究 | 第167-170页 |
| ·结果与讨论 | 第170-189页 |
| ·RNA样品的浓度和纯度检测 | 第170-171页 |
| ·测序质量分析 | 第171-173页 |
| ·差异表达基因的统计 | 第173-174页 |
| ·差异基因GO富集分析 | 第174-175页 |
| ·差异基因Pathway富集分析 | 第175-178页 |
| ·纤维素利用相关的差异基因表达模式聚类分析 | 第178-180页 |
| ·纤维素降解相关蛋白的表达差异 | 第180-189页 |
| ·小结与讨论 | 第189-191页 |
| 全文总结 | 第191-194页 |
| 参考文献 | 第194-205页 |
| 致谢 | 第205-207页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第207-221页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第221页 |
