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扇贝的染色体作图及系统进化分析

摘要第1-9页
Abstract第9-17页
主要符号对照表第17-19页
第一章 文献综述第19-42页
 0 引言第19页
 1 双壳贝类基因组特征第19-20页
 2 双壳贝类基因组研究现状第20-23页
   ·分子标记的发展和连锁图谱的构建第20-22页
   ·双壳贝类基因组中的功能基因研究第22-23页
   ·双壳贝类的分子系统进化关系研究第23页
 3 双壳贝类的染色体研究现状第23-36页
   ·双壳贝类染色体的核型及带型研究第23-25页
   ·荧光原位杂交技术在双壳贝类染色体研究中的应用第25-36页
 4 海洋贝类的杂交育种研究第36-40页
   ·海洋贝类的杂交育种及杂种优势研究概况第36-38页
   ·海洋贝类的杂种鉴定及杂种优势分析第38-40页
 5 本研究的目的与意义第40-42页
第二章 栉孔扇贝微卫星遗传图谱与染色体图谱的初步整合第42-79页
 0 引言第42页
 1 材料与方法第42-51页
   ·实验材料第42-43页
   ·主要试剂第43-45页
   ·主要仪器第45页
   ·实验方法第45-51页
 2 结果与分析第51-73页
   ·SSR 标记的 BAC 克隆筛选第51-56页
   ·探针的制备第56-57页
   ·SSR-BAC 克隆的 FISH 定位结果第57-61页
   ·同一连锁群的 SSR-BAC 克隆的 FISH 定位结果第61-71页
   ·微卫星图谱与染色体图谱的整合第71-73页
 3 讨论第73-79页
   ·微卫星标记的 BAC 文库筛选第73-74页
   ·遗传连锁图谱(Genetic linkage map)与物理图谱(Physical map)的整合第74-76页
   ·栉孔扇贝的染色体识别与图谱整合第76-79页
第三章 栉孔扇贝染色体鉴别技术的建立第79-116页
 0 引言第79-80页
 第一节 栉孔扇贝染色体特异性探针的筛选第80-90页
  1 材料与方法第80-81页
   ·实验材料第80页
   ·试剂及仪器第80页
   ·实验方法第80-81页
  2 结果与分析第81-87页
   ·基因序列对 BAC 文库的筛选第81页
   ·含 gene 序列 BAC 克隆的 FISH 定位第81-82页
   ·随机选取 BAC 克隆的 FISH 定位第82页
   ·含重复序列 fosmid 克隆的 FISH 定位第82页
   ·含 gene 序列 fosmid 克隆的 FISH 定位第82-87页
  3 讨论第87-90页
   ·利用 fosmid 及 BAC 克隆进行栉孔扇贝染色体识别的可行性第87-89页
   ·fosmid 克隆和 BAC 克隆的 FISH 定位比较第89-90页
 第二节 栉孔扇贝分子标记染色体定位模式图的构建第90-116页
  1 材料与方法第90-91页
   ·实验材料第90页
   ·实验方法第90-91页
  2 结果与分析第91-110页
   ·染色体特异性探针的制备第91-92页
   ·染色体的区分鉴定第92-99页
   ·染色体图谱的构建第99-102页
   ·染色体识别图式的建立第102-110页
  3 讨论第110-116页
   ·栉孔扇贝染色体的识别鉴定第110-112页
   ·栉孔扇贝的细胞遗传学图谱第112-114页
   ·染色体图谱构建尚需改善的方面及下一步的工作展望第114-116页
第四章 扇贝的比较细胞遗传分析及系统发生关系研究第116-147页
 第一节 C0t-1 DNA 在栉孔扇贝、虾夷扇贝及海湾扇贝染色体上的比较定位研究第116-125页
  0 引言第116-117页
  1 材料与方法第117-118页
   ·实验材料第117页
   ·试剂及仪器第117-118页
   ·实验方法第118页
  2 结果与分析第118-120页
   ·C0t-1 DNA 探针的制备第118-119页
   ·C0t-1 DNA 在三种扇贝染色体上的 FISH 定位第119-120页
  3 讨论第120-125页
   ·几种扇贝的亲缘关系第120-123页
   ·栉孔扇贝的 C0t-1 DNA 染色体带型第123-125页
 第二节 核糖体 DNA(5S rDNA 和 18S-28S rDNA)在华贵栉孔扇贝和紫扇贝染色体上的定位第125-135页
  0 引言第125页
  1 材料与方法第125-127页
   ·实验材料第125-126页
   ·试剂及仪器第126页
   ·实验方法第126-127页
  2 结果与分析第127-131页
   ·18S-28S rDNA 和 5S rDNA 探针的制备第127-128页
   ·华贵栉孔扇贝和紫扇贝 18S-28S rDNA 的 FISH 定位第128页
   ·华贵栉孔扇贝和紫扇贝 5S rDNA 的 FISH 定位第128-130页
   ·18S-28S rDNA 和 5S rDNA 的双色 FISH第130-131页
  3 讨论第131-135页
 第三节 基于核糖体转录间隔区(ITS)序列探讨扇贝属多个扇贝物种的系统发生关系第135-147页
  0 引言第135-136页
  1 材料与方法第136-138页
   ·实验材料第136页
   ·实验方法第136-138页
  2 结果与分析第138-141页
   ·序列扩增及比对分析第138-140页
   ·遗传距离分析第140页
   ·系统进化分析第140-141页
  3 讨论第141-147页
   ·个测序扇贝物种 ITS 区域序列的遗传特性第141-144页
   ·1 个扇贝物种的 ITS 序列比较及系统进化关系第144-147页
第五章 紫扇贝和海湾扇贝正反杂交子代的分子及细胞遗传学分析第147-176页
 0 引言第147-148页
 第一节 紫扇贝和海湾扇贝杂交子代幼虫的 GISH 分析第148-155页
  0 引言第148-149页
  1 材料与方法第149-150页
   ·实验材料第149页
   ·试剂及仪器第149页
   ·实验方法第149-150页
  2 结果与分析第150-152页
  3 讨论第152-155页
   ·杂交子代的染色体构成第152-153页
   ·GISH 带型第153-155页
 第二节 紫扇贝和海湾扇贝杂交子代核糖体 ITS 及线粒体 16SrDNA 基因序列的遗传分析第155-162页
  0 引言第155-156页
  1 材料与方法第156-157页
   ·实验材料第156页
   ·实验方法第156-157页
  2 结果与分析第157-160页
   ·ITS 序列的电泳检测第157页
   ·ITS 片段的序列分析第157-159页
   ·6S rDNA 片段的序列分析第159-160页
  3 讨论第160-162页
 第三节 紫扇贝和海湾扇贝杂交子代成体的遗传构成及遗传变异分析第162-176页
  0 引言第162-163页
  1 材料与方法第163-165页
   ·实验材料第163页
   ·实验方法第163-165页
  2 结果与分析第165-172页
   ·AFLP 扩增带谱分析第165-167页
   ·SSR 扩增结果分析第167-170页
   ·遗传变异分析第170-172页
   ·遗传多样性分析第172页
  3 讨论第172-176页
参考文献第176-195页
致谢第195-196页
个人简历第196-197页
学术成果第197-198页

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