| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-25页 |
| ·DNA 计算产生的背景和意义 | 第10-11页 |
| ·研究背景 | 第10-11页 |
| ·研究意义 | 第11页 |
| ·文献综述 | 第11-22页 |
| ·DNA 计算文献计量 | 第11-20页 |
| ·DNA 计算研究现状 | 第20-22页 |
| ·本文的研究内容与创新点 | 第22-23页 |
| ·本文的研究内容与框架 | 第22-23页 |
| ·本文的创新点 | 第23页 |
| ·本文的组织结构 | 第23-25页 |
| 第二章 DNA 计算建模 | 第25-35页 |
| ·DNA 计算理论基础 | 第25-29页 |
| ·DNA 分子结构 | 第25-26页 |
| ·DNA 计算编码问题 | 第26-27页 |
| ·生物操作 | 第27-29页 |
| ·DNA 计算基础模型 | 第29-31页 |
| ·DNA 发夹模型构建 | 第29-30页 |
| ·三链 DNA 分子模型构建 | 第30页 |
| ·k‐臂 DNA 分子模型构建 | 第30-31页 |
| ·基于三链 DNA 结构的 0‐1 规划改进算法 | 第31-34页 |
| ·0‐1 整数规划问题 | 第31-32页 |
| ·改进算法 | 第32-33页 |
| ·算法分析 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第三章 基于 3‐臂 DNA 分子模型求解最近邻聚类问题 | 第35-39页 |
| ·最近邻聚类问题的分析与转化 | 第35-36页 |
| ·基于 3‐臂 DNA 分子结构的 DNA 算法 | 第36-38页 |
| ·DNA 编码 | 第36页 |
| ·生物算法 | 第36-38页 |
| ·算法复杂性讨论 | 第38页 |
| ·时间复杂度（操作复杂度） | 第38页 |
| ·编码序列规模 | 第38页 |
| ·空间复杂性 | 第38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 基于 k‐臂 DNA 分子模型求解最大团问题(MCP) | 第39-48页 |
| ·最大团问题 | 第39页 |
| ·基于 k‐臂 DNA 分子模型的算法 | 第39-42页 |
| ·结构块（Building Block）编码 | 第39-40页 |
| ·顶点块预处理算法 | 第40-41页 |
| ·算法实现 | 第41-42页 |
| ·算法复杂性 | 第42-43页 |
| ·时间复杂性（操作复杂性） | 第42页 |
| ·编码序列规模 | 第42-43页 |
| ·最大团问题的三维 DNA 图结构进化算法 | 第43-46页 |
| ·DNA 计算与进化计算 | 第43-44页 |
| ·进化计算改进解空间规模算法 | 第44页 |
| ·进化算法与 DNA 计算的结合算法 | 第44-45页 |
| ·仿真实验 | 第45-46页 |
| ·本章小结 | 第46-48页 |
| 第五章 最近邻聚类和 MPC 的 DNA 算法实例分析 | 第48-55页 |
| ·三链 DNA 分子模型应用实例 | 第48-50页 |
| ·问题描述 | 第48页 |
| ·基于三链模型的求解过程 | 第48-50页 |
| ·基于 3‐臂 DNA 分子模型的层次聚类算法应用实例 | 第50-52页 |
| ·基于 k‐臂 DNA 分子模型的最大团问题算应用实例 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 第六章 结论与展望 | 第55-58页 |
| ·研究工作总结 | 第55-56页 |
| ·后续研究及展望 | 第56-58页 |
| ·后续研究及问题 | 第56页 |
| ·DNA 计算展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 硕士期间发表的论文和参与的项目 | 第63-64页 |
| 附录一 | 第64-79页 |
| 附录二 | 第79-85页 |
