复杂疾病的核心基因筛选及分子机制研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| ·课题研究的背景介绍 | 第8-11页 |
| ·单基因疾病与复杂疾病 | 第8-9页 |
| ·不同层面的生物学数据及其分析方法 | 第9-10页 |
| ·系统生物学在复杂疾病研究中的应用 | 第10-11页 |
| ·课题研究目的与内容 | 第11-13页 |
| 第二章 转录组数据中保守性共表达基因的筛选 | 第13-23页 |
| ·转录组数据及其处理分析 | 第13-18页 |
| ·转录组数据 | 第13-14页 |
| ·转录组数据分析 | 第14-18页 |
| ·保守性共表达基因（TICOGE）筛选流程的建立 | 第18-22页 |
| ·具有相似表达谱的基因聚类成动态共表达基因模块 | 第19-21页 |
| ·动态共表达基因模块中基因保守性判定 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 前列腺癌发生发展过程中的核心基因研究 | 第23-46页 |
| ·背景介绍 | 第24-29页 |
| ·肿瘤的发生与发展 | 第24-26页 |
| ·与细胞增殖相关的主要信号通路 | 第26-29页 |
| ·实验数据来源与预处理 | 第29-31页 |
| ·前列腺癌发生发展的芯片表达谱数据 | 第29-31页 |
| ·TICOGE 方法的应用结果分析 | 第31-44页 |
| ·TiCoGE 方法的具体应用 | 第31-34页 |
| ·共表达基因模块的功能检验 | 第34-38页 |
| ·与其他筛选方法的比较 | 第38-40页 |
| ·筛选所得高分基因的功能 | 第40-44页 |
| ·本章小结 | 第44-46页 |
| 第四章 抗糖尿病药物的分子机制研究 | 第46-75页 |
| ·背景介绍 | 第46-49页 |
| ·糖尿病的发生及其主要治疗药物 | 第46-48页 |
| ·高通量转录组测序数据 RNA-Seq | 第48-49页 |
| ·实验数据来源与预处理 | 第49-54页 |
| ·抗糖尿病药物在不同组织中的表达数据 | 第49-52页 |
| ·数据预处理 | 第52-54页 |
| ·TICOGE 方法的应用及结果分析 | 第54-59页 |
| ·TiCoGE 方法的应用 | 第56页 |
| ·保守性共表达基因的功能分析 | 第56-58页 |
| ·保守性共表达基因与疾病关系 | 第58-59页 |
| ·糖尿病药物刺激下核心共表达基因网络分析 | 第59-73页 |
| ·协同表达基因的定义 | 第59-60页 |
| ·协同表达基因群的功能分析 | 第60-68页 |
| ·基因关系网络中的差异表达基因分析 | 第68-73页 |
| ·本章小结 | 第73-75页 |
| 第五章 诱导性多能干细胞分化的分子机制 | 第75-91页 |
| ·背景介绍 | 第75-78页 |
| ·干细胞多能性 | 第75-77页 |
| ·印记基因与细胞多能性关系 | 第77-78页 |
| ·数据来源与处理 | 第78-82页 |
| ·小鼠多功能干细胞的 miRNA 数据 | 第78-79页 |
| ·数据预处理与差异表达 miRNA 筛选 | 第79-82页 |
| ·差异 MIRNA 与印记基因区域比较 | 第82-89页 |
| ·差异表达 miRNA 的染色体区域富集 | 第82-83页 |
| ·差异表达 miRNA 靶基因与印记基因关系分析 | 第83-89页 |
| ·本章小结 | 第89-91页 |
| 第六章 全文总结 | 第91-95页 |
| ·工作总结 | 第91-93页 |
| ·研究展望 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-111页 |
| 附录一 对前列腺癌数据应用不同方法的结果比较 | 第111-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
| 攻读博士学位期间已发表或录用的论文 | 第115-116页 |
| 攻读博士学位期间参与的科研项目 | 第116-118页 |
