摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-39页 |
1 高等植物线粒体基因组 | 第13-27页 |
·线粒体基因组的起源 | 第13-14页 |
·线粒体基因组的结构特点 | 第14-17页 |
·线粒体基因组的基因组成 | 第17-21页 |
·线粒体基因的转录及编辑 | 第21-22页 |
·线粒体基因组构成 | 第22-25页 |
·芸薹属植物线粒体基因组研究 | 第25-27页 |
2 线粒体与细胞质雄性不育 | 第27-33页 |
·植物细胞质雄性不育的产生途径 | 第27-28页 |
·油菜细胞质雄性不育 | 第28-31页 |
·线粒体基因组与细胞质雄性不育的关系 | 第31-33页 |
3 线粒体基因组测序 | 第33-37页 |
·线粒体DNA的提取方法 | 第33-35页 |
·线粒体基因组测序方法 | 第35-37页 |
4 本研究目的和意义 | 第37-39页 |
第二章 细胞质雄性不育系NH12A线粒体基因组测序及比较研究 | 第39-79页 |
1 材料和方法 | 第39-52页 |
·植物材料 | 第39页 |
·油菜线粒体DNA的提取 | 第39-43页 |
·仪器及试剂 | 第39-40页 |
·油菜线粒体的提取 | 第40-41页 |
·线粒体DNA的萃取及纯化 | 第41-42页 |
·线粒体DNA质量及纯度的鉴定 | 第42-43页 |
·线粒体基因组的测序 | 第43-46页 |
·线粒体基因组序列分析 | 第46-47页 |
·油菜线粒体亚基因组共存性实验 | 第47-50页 |
·线粒体特异序列引物的设计 | 第47-48页 |
·特异序列的克隆测序 | 第48-50页 |
·油菜线粒体中pol与nap两个亚基因组序列含量的测定 | 第50-52页 |
·荧光定量PCR引物及TaqMan探针的设计 | 第50页 |
·TaqMan定量方法的建立 | 第50-52页 |
2 结果与分析 | 第52-73页 |
·线粒体的提取及检测 | 第52-54页 |
·线粒体的提取 | 第52页 |
·线粒体DNA检测 | 第52-54页 |
·NH12A系线粒体基因组 | 第54-65页 |
·线粒体基因组shotgun测序 | 第54-55页 |
·NH12A线粒体基因组的基因及ORF | 第55-59页 |
·重复序列分析 | 第59-62页 |
·NH12A线粒体基因组结构 | 第62-64页 |
·油菜线粒体基因组SNP分析 | 第64-65页 |
·油菜线粒体中pol型与nap型线粒体亚基因组共存 | 第65-68页 |
·orf222与orf224拷贝数的定量测定 | 第68-71页 |
·TaqMan qPCR体系的建立 | 第68-69页 |
·orf222与orf224拷贝数比值 | 第69-71页 |
·油菜线粒体基因组的多环结构 | 第71-72页 |
·油菜线粒体基因组的进化 | 第72-73页 |
3 讨论 | 第73-79页 |
·高等植物线粒体中mitotype的共存 | 第73-74页 |
·mitotype间的亚化学计量转化 | 第74-76页 |
·油菜中PolCMS的发现 | 第76页 |
·短片段重复序列与线粒体基因组序列重排 | 第76-77页 |
·线粒体基因组的特异ORF | 第77页 |
·高纯度mtDNA是线粒体研究的基础 | 第77-79页 |
第三章 细胞质雄性不育系N219A线粒体基因组测序 | 第79-93页 |
1 材料和方法 | 第79-81页 |
·植物材料 | 第79页 |
·油菜线粒体DNA的提取 | 第79-80页 |
·线粒体基因组的solexa高通量测序及拼接 | 第80-81页 |
·线粒体基因组序列分析 | 第81页 |
2 结果与分析 | 第81-90页 |
·N219A线粒体基因组结构 | 第81-83页 |
·N219A线粒体基因组的基因及ORF | 第83-88页 |
·N219A线粒体基因组SNP及重复序列 | 第88-90页 |
3 讨论 | 第90-93页 |
第四章 全文小结 | 第93-95页 |
1 全文结论 | 第93-94页 |
2 创新之处 | 第94-95页 |
参考文献 | 第95-109页 |
致谢 | 第109-111页 |
在读期间发表或待发表研究论文 | 第111页 |