| 摘要 | 第1-14页 |
| ABSTRACT | 第14-19页 |
| 缩略词表 | 第19-20页 |
| 菌株缩写表 | 第20-21页 |
| 第一部分 文献综述 | 第21-42页 |
| ·粘细菌的分离与纯化 | 第21-27页 |
| ·分离样品的处理 | 第21-22页 |
| ·环境样品直接分离法 | 第22页 |
| ·土壤诱导分离法 | 第22页 |
| ·菌膜(Swarm)分离法 | 第22-24页 |
| ·抗生素处理分离法 | 第24页 |
| ·纤维素降解粘细菌的分离 | 第24-25页 |
| ·水体中粘细菌的分离 | 第25页 |
| ·粘细菌的纯化 | 第25-27页 |
| ·粘细菌的分类学研究 | 第27-30页 |
| ·粘细菌的形态分类 | 第27-29页 |
| ·粘细菌的系统发育关系 | 第29-30页 |
| ·粘细菌的生态学研究 | 第30-34页 |
| ·粘细菌分布的自然生境 | 第30页 |
| ·粘细菌的全球分布 | 第30-32页 |
| ·极端环境中的粘细菌 | 第32-34页 |
| ·分子生态学方法简介 | 第34-39页 |
| ·G+C含量测定 | 第34-35页 |
| ·DNA Reassociation与杂交 | 第35-36页 |
| ·DNA芯片 | 第36页 |
| ·基于PCR的方法 | 第36-39页 |
| ·本文工作开展思路 | 第39-42页 |
| 第二部分 可培养粘细菌的分离与菌株系统发育关系分析 | 第42-67页 |
| ·实验材料 | 第43-46页 |
| ·仪器与试剂盒 | 第43-44页 |
| ·试剂 | 第44-45页 |
| ·培养基 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-53页 |
| ·粘细菌的形态学观察 | 第46页 |
| ·粘细菌染色体DNA的提取 | 第46-47页 |
| ·粘细菌16S rRNA基因序列的测定 | 第47-48页 |
| ·粘细菌HSP60基因序列的测定 | 第48-53页 |
| ·16S rRNA和HSP60基因序列的系统进化分析 | 第53页 |
| ·结果与分析 | 第53-65页 |
| ·孢囊杆菌亚目菌株的形态特征 | 第53-56页 |
| ·降解纤维素堆囊菌亚目菌株的形态特征 | 第56-59页 |
| ·菌株系统发育关系分析 | 第59-65页 |
| ·本章小结 | 第65-67页 |
| 第三部分 土壤中粘细菌的系统发育多样性 | 第67-97页 |
| ·实验材料 | 第68-69页 |
| ·仪器与试剂盒 | 第68页 |
| ·试剂 | 第68-69页 |
| ·培养基 | 第69页 |
| ·研究材料 | 第69页 |
| ·实验方法 | 第69-79页 |
| ·粘细菌特异寡核苷酸探针/引物的设计与验证 | 第69-74页 |
| ·SDU土样中可培养粘细菌的分离 | 第74-75页 |
| ·土壤总DNA和总RNA的提取 | 第75-76页 |
| ·建立粘细菌富集的土壤16S rRNA基因文库及16S crDNA文库 | 第76-78页 |
| ·克隆文库的杂交筛选及序列测定 | 第78-79页 |
| ·土壤中未可培养粘细菌的系统发育多样性分析 | 第79页 |
| ·结果与分析 | 第79-95页 |
| ·SDU土样中可培养粘细菌的分离 | 第79-80页 |
| ·粘细菌特异寡核苷酸引物特异性验证 | 第80-81页 |
| ·粘细菌特异寡核苷酸探针特异性验证 | 第81-84页 |
| ·粘细菌富集的克隆文库的构建 | 第84-85页 |
| ·文库的杂交筛选及序列测定 | 第85-87页 |
| ·土壤中粘细菌16S rRNA基因序列的系统发育关系分析 | 第87-91页 |
| ·土壤中活性粘细菌16S crDNA序列系统发育关系分析 | 第91-95页 |
| ·本章小结 | 第95-97页 |
| 第四部分 海底沉积物中粘细菌的系统发育多样性 | 第97-114页 |
| ·实验材料 | 第98页 |
| ·仪器与试剂盒 | 第98页 |
| ·试剂 | 第98页 |
| ·培养基 | 第98页 |
| ·实验材料 | 第98页 |
| ·实验方法 | 第98-101页 |
| ·海底沉积物中可培养粘细菌的分离 | 第98页 |
| ·海底沉积物总DNA的提取 | 第98-99页 |
| ·细菌通用16S rRNA基因文库构建及分析 | 第99-100页 |
| ·建立粘细菌富集的海底沉积物16S rRNA基因文库 | 第100页 |
| ·粘细菌富集文库的筛选与分析 | 第100-101页 |
| ·结果与分析 | 第101-111页 |
| ·海底沉积物中可培养粘细菌的分析 | 第101-102页 |
| ·海底沉积物916-1和7K367 M2-1中细菌多样性分析 | 第102-103页 |
| ·海底沉积物中粘细菌组成多样性分析 | 第103-111页 |
| ·本章小结 | 第111-114页 |
| 总结与展望 | 第114-118页 |
| 附录 | 第118-119页 |
| 附录一:递交GenBank的核酸序列号 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-126页 |
| 致谢 | 第126-127页 |
| 在读博士期间发表的论文 | 第127-128页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第128-129页 |
| 附件 | 第129-150页 |
