| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一部分 文献综述 | 第7-21页 |
| 第一章 遗传密码的起源及其进化 | 第7-12页 |
| 1. 遗传密码的起源 | 第7-8页 |
| 2. 遗传密码进化的阶段性 | 第8-12页 |
| 第二章 基因表达和进化中密码子使用偏好性 | 第12-17页 |
| 1. 在核基因组中密码子使用的偏好性 | 第12-14页 |
| 2. 在细胞器基因组中密码子使用的偏好性 | 第14页 |
| 3. 在转录水平调控中对密码子使用的偏好性 | 第14-15页 |
| 4. 环境对密码子使用偏好性的影响 | 第15-17页 |
| 第三章 本论文相关软件的使用和数据的处理方式 | 第17-21页 |
| 1. 相关软件的使用介绍 | 第17页 |
| 2. 数据的处理方式及其生物学意义 | 第17-21页 |
| 第二部分 密码子的位点特征同基因进化的关系 | 第21-31页 |
| 引言 | 第21页 |
| 第四章 核基因中密码子的位点特征 | 第21-27页 |
| 1. 数据来源 | 第21-23页 |
| 2. 数据的处理方法 | 第23页 |
| 3. 结果与讨论 | 第23-27页 |
| 第五章 密码子位点分布同基因进化的关系 | 第27-31页 |
| 1. 数据来源 | 第27页 |
| 2. 数据的处理 | 第27-28页 |
| 3. 结果与讨论 | 第28-31页 |
| 第三部分 组蛋白基因密码子位点特征和进化动力学模式 | 第31-41页 |
| 引言 | 第31页 |
| 第六章 组蛋白密码子的位点特征及其与表达的相关性 | 第31-35页 |
| 1. 数据来源 | 第31页 |
| 2. 组蛋白表达的量化计算及其与GC含量的相关性 | 第31-35页 |
| 第七章 组蛋白基因的进化动力学比较 | 第35-41页 |
| 1. 数据来源 | 第35页 |
| 2. p_S和p_N值的计算 | 第35-36页 |
| 3. 结果与讨论 | 第36-38页 |
| 4. 根据组蛋白基因H2A、H2B构建生物进化树 | 第38-41页 |
| 附录一 本论文所涉及的基因索取号 | 第41-49页 |
| 附录二 部分生物组蛋白H2A的p_S和p_N值 | 第49-52页 |
| 附录三 部分生物组蛋白H2B的p_S用p_N值 | 第52-55页 |
| 附录四 物种碱基分布获得程式 | 第55-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 致谢 | 第63页 |