| 符号说明 | 第1-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 第Ⅰ部分 文献综述 | 第12-51页 |
| 第一章 卷叶性状的研究进展 | 第12-24页 |
| ·水稻卷叶性状与理想株型 | 第12-14页 |
| ·国际水稻所的新株型模式 | 第12-13页 |
| ·杨守仁的“短枝立叶，大穗直穗”株型模式 | 第13页 |
| ·周开达的“重穗型”模式 | 第13-14页 |
| ·袁隆平提出的超高产杂交稻的理想株型模式 | 第14页 |
| ·卷叶的生理生态学效应 | 第14-17页 |
| ·水稻叶片性状对产量的影响 | 第14-15页 |
| ·卷叶性状的生理生态效应的研究 | 第15-17页 |
| ·卷叶性状的形成机制 | 第17-24页 |
| ·胁迫条件下叶片卷曲 | 第17-21页 |
| ·叶片卷曲是抗旱性指标之一 | 第18-19页 |
| ·干旱胁迫卷叶性状基因的定位 | 第19-21页 |
| ·卷叶的遗传学研究 | 第21-24页 |
| 第二章 叶片极性发育的研究进展 | 第24-44页 |
| ·叶片近-远轴发育基因的研究 | 第26-39页 |
| ·近-远轴不对称性的的获得 | 第26-29页 |
| ·近-远轴不对称性的维持 | 第29-33页 |
| ·近轴叶组织和茎顶端分生组织的发育 | 第33-34页 |
| ·miRNA 对叶片近轴/远轴发育基因的调控机理 | 第34-38页 |
| ·近-远轴极性基因的结构域分析 | 第38-39页 |
| ·叶的基-顶轴极性的研究 | 第39-41页 |
| ·控制叶片极性发育基因的特征 | 第41-44页 |
| 第三章 T-DNA 标签技术在植物功能基因组研究中的应用 | 第44-51页 |
| ·T-DNA 插入突变的几种策略 | 第44-49页 |
| ·基因敲除 | 第44-46页 |
| ·基因陷阱 | 第46-49页 |
| ·基因陷阱的分类 | 第46-48页 |
| ·基因陷阱系统的改进 | 第48-49页 |
| ·T-DNA 插入片段侧翼序列的分离 | 第49-51页 |
| 第Ⅱ部分 水稻卷叶突变体（T-DNA）的研究 | 第51-64页 |
| 第四章 水稻卷叶突变体（T-DNA）的筛选及遗传分析 | 第51-64页 |
| ·前言 | 第51页 |
| ·材料与方法 | 第51-53页 |
| ·供试材料 | 第51-52页 |
| ·实验方法 | 第52-53页 |
| ·材料种植与筛选 | 第52页 |
| ·基于 T-DNA 插入序列的特异 PCR 检测 | 第52页 |
| ·T-DNA 侧翼序列的分离 | 第52-53页 |
| ·结果与分析 | 第53-60页 |
| ·卷叶突变体的鉴定筛选 | 第53-55页 |
| ·卷叶突变体在 T1 代中的共分离分析 | 第55-56页 |
| ·T-DNA 插入突变体的 T2 代验证 | 第56-58页 |
| ·T-DNA 标签系的侧翼序列分离 | 第58-59页 |
| ·侧翼序列的共分离分析 | 第59-60页 |
| ·讨论 | 第60-64页 |
| ·关于突变性状与 T-DNA 插入的共分离检测 | 第60-61页 |
| ·多拷贝插入突变体的筛选思路 | 第61-62页 |
| ·卷叶突变体的研究 | 第62-64页 |
| 第Ⅲ部分 卷叶基因rl(t)的研究 | 第64-109页 |
| 第五章 InDel 和 SNP 标记在水稻卷叶基因rl(t)精细定位中的应用 | 第64-75页 |
| ·前言 | 第64-65页 |
| ·InDel 标记 | 第65-67页 |
| ·从水稻公共数据库中寻找 InDel | 第65-67页 |
| ·InDel 标记的设计 | 第67页 |
| ·SNP 标记 | 第67-71页 |
| ·从水稻公共数据库中寻找 SNP | 第67页 |
| ·SNP 标记的设计 | 第67-71页 |
| ·将 SNP 标记转化为 CAPS 标记 | 第68页 |
| ·将 SNP 标记转化为dCAPS 标记 | 第68页 |
| ·AS-PCR(Allele Specific PCR)策略,即等位基因特异 PCR | 第68-70页 |
| ·其他检测方法 | 第70-71页 |
| ·卷叶基因初级定位区间内 InDel 和 SNP 标记的发展 | 第71-73页 |
| ·InDel 和 SNP 标记利用中的注意点 | 第73-75页 |
| ·InDel 和 SNP 标记在基因图位克隆中的重要性 | 第73页 |
| ·InDel 标记利用中的几个注意点 | 第73页 |
| ·SNP标记利用中的几个注意点 | 第73-74页 |
| ·InDel 和 SNP 标记的优缺点比较 | 第74-75页 |
| 第六章 卷叶基因rl(t)的精细定位 | 第75-87页 |
| ·前言 | 第75页 |
| ·材料与方法 | 第75-79页 |
| ·试验材料 | 第75-77页 |
| ·亲本材料 | 第75-76页 |
| ·奇妙香卷叶近等基因系选育方法 | 第76页 |
| ·精细定位群体 | 第76-77页 |
| ·田间试验 | 第77页 |
| ·DNA 提取和 PCR 反应 | 第77页 |
| ·DNA 提取 | 第77页 |
| ·PCR 反应与产物检测 | 第77页 |
| ·精细定位的方法 | 第77-78页 |
| ·精细定位的策略 | 第78-79页 |
| ·结果与分析 | 第79-84页 |
| ·卷叶基因rl(t)的精细定位 | 第79-80页 |
| ·卷叶基因rl(t)的进一步定位 | 第80-83页 |
| ·精细定位的群体 | 第80-81页 |
| ·精细定位的策略 | 第81-82页 |
| ·卷叶基因rl(t)所在区间的进一步缩小 | 第82-83页 |
| ·覆盖卷叶基因rl(t)的物理图谱的构建 | 第83-84页 |
| ·讨论 | 第84-87页 |
| ·质量-数量性状的调查方法 | 第84-85页 |
| ·提高精细定位的效率 | 第85页 |
| ·精细定位方法的探讨 | 第85-87页 |
| 第七章 水稻卷叶基因rl(t) 的候选基因分析 | 第87-102页 |
| ·前言 | 第87页 |
| ·材料与方法 | 第87-89页 |
| ·供试水稻材料 | 第87页 |
| ·基因释义 | 第87-88页 |
| ·各材料的 RNA 提取与反转录反应 | 第88页 |
| ·预测基因的表达分析 | 第88-89页 |
| ·候选基因的序列分析 | 第89页 |
| ·结果与分析 | 第89-96页 |
| ·rl(t)的物理区间内的基因释义 | 第89-91页 |
| ·候选基因的序列分析 | 第91-92页 |
| ·设计测序引物 | 第91-92页 |
| ·测序及序列拼接 | 第92页 |
| ·序列差异比较 | 第92页 |
| ·候选基因的表达分析 | 第92-95页 |
| ·候选基因的功能分析 | 第95-96页 |
| ·讨论 | 第96-102页 |
| ·3'UTR 的调控作用与卷叶性状的关系 | 第96-99页 |
| ·3'UTR 控制 mRNA 的末端加尾 | 第97-98页 |
| ·3'UTR 控制mRNA 的稳定性 | 第98-99页 |
| ·3'UTR 控制 mRNA 的翻译 | 第99页 |
| ·3'UTR可能调控卷叶基因的表达 | 第99页 |
| ·水稻中的其它 HD-GL2 类基因 | 第99-100页 |
| ·候选基因分析 | 第100-102页 |
| 第八章 卷叶基因rl(t)的功能验证 | 第102-109页 |
| ·前言 | 第102页 |
| ·试验材料 | 第102-104页 |
| ·RNAi 载体的构建 | 第104-107页 |
| ·RNAi 引物 | 第104页 |
| ·PCR 产物的回收 | 第104-105页 |
| ·BP 反应 | 第105-106页 |
| ·构建好的 RNAi 载体导入大肠杆菌 | 第106页 |
| ·RNAi 载体导入农杆菌 | 第106页 |
| ·农杆菌的转化 | 第106-107页 |
| ·实验进展说明 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-125页 |
| 附录1：DNA 提取及 PCR 分析 | 第125-126页 |
| 附录2：RNA 完整性的甲醛凝胶电泳检测 | 第126-127页 |
| 附录3：rl(t)候选基因的测序数据与日本晴和93-11 序列的多重比较 | 第127-141页 |
| 附录4：rl(t)与 HD-GL2 类基因的氨基酸序列的多重比较 | 第141-144页 |
| 博士研究生期间发表的论文 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
