| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-33页 |
| §1.1 生物信息学概述 | 第9-10页 |
| §1.2 蛋白质基础知识 | 第10-14页 |
| §1.3 当前蛋白质研究的几个热点问题 | 第14-25页 |
| §1.4 信息论方法在生物信息学中的应用 | 第25-30页 |
| §1.5 本文的选题和主要工作 | 第30-33页 |
| 第二章 蛋白质序列比较研究及其应用 | 第33-51页 |
| §2.1 一个新的蛋白质多序列比对模型及优化算法 | 第33-38页 |
| §2.2 基于FDOD的区分膜蛋白的方法及应用 | 第38-45页 |
| §2.3 基于氨基酸分类的磷化位点预测方法 | 第45-51页 |
| 第三章 蛋白质结构表示及结构比较方法研究 | 第51-77页 |
| §3.1 基于FDOD的蛋白质结构比较方法 | 第51-61页 |
| §3.2 几何-拓扑蛋白质折叠描述方法及其应用 | 第61-71页 |
| §3.3 FDOD与欧式距离、交叉熵的比较 | 第71-77页 |
| 第四章 蛋白质质谱数据分类及生物标志物发现 | 第77-87页 |
| §4.1 基于FDOD的癌症质谱数据分类 | 第77-81页 |
| §4.2 特征选择暨生物标志物的发现 | 第81-87页 |
| 结论与展望 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-99页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文、参加的课题及获奖情况 | 第99-101页 |
| 创新点摘要 | 第101-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |