| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-36页 |
| ·引言 | 第10页 |
| ·miRNA基因 | 第10-13页 |
| ·miRNA的发现及研究 | 第10-11页 |
| ·miRNA的特征 | 第11-13页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第13-16页 |
| ·动物miRNA的生物合成 | 第13-14页 |
| ·植物miRNA的生物合成 | 第14-16页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第16-17页 |
| ·miRNA介导mRNA的翻译抑制 | 第16页 |
| ·miRNA介导mRNA的特异性切割 | 第16-17页 |
| ·miRNA介导mRNA的快速脱腺苷酸化 | 第17页 |
| ·miRNA的生物学功能 | 第17-24页 |
| ·miRNA在植物中的作用 | 第17-21页 |
| ·miRNA在动物中的作用 | 第21-23页 |
| ·miRNA与人类疾病 | 第23-24页 |
| ·miRNA的命名与界定 | 第24-25页 |
| ·miRNA的命名 | 第24-25页 |
| ·miRNA的界定 | 第25页 |
| ·miRNA的鉴定 | 第25-32页 |
| ·实验RNA组学研究miRNA | 第28-30页 |
| ·计算机RNA组学研究miRNA | 第30-32页 |
| ·miRNA靶基因的鉴定 | 第32-34页 |
| ·植物miRNA靶基因的预测 | 第33页 |
| ·动物miRNA靶基因的预测 | 第33-34页 |
| ·本论文的研究目的与意义 | 第34-36页 |
| 第2章 材料与方法 | 第36-51页 |
| ·材料 | 第36-41页 |
| ·马铃薯 | 第36页 |
| ·使用的数据库及分析软件 | 第36-37页 |
| ·主要的仪器和设备 | 第37-38页 |
| ·PCR引物 | 第38-39页 |
| ·主要的酶和试剂 | 第39页 |
| ·主要的缓冲液和试剂的成分及配制 | 第39-41页 |
| ·miRNA的计算机分析 | 第41-43页 |
| ·马铃薯miRNA的搜寻 | 第41-42页 |
| ·马铃薯miRNA靶基因的预测 | 第42-43页 |
| ·核酸的提取和纯化 | 第43-51页 |
| ·马铃薯总RNA的提取 | 第43-46页 |
| ·马铃薯叶片基因组DNA的提取 | 第46-48页 |
| ·总RNA中的DNA的酶解 | 第48-49页 |
| ·RNA的逆转录反应 | 第49页 |
| ·PCR反应及其产物鉴定 | 第49-51页 |
| 第3章 结果与分析 | 第51-77页 |
| ·马铃薯miRNA的计算机预测 | 第51-58页 |
| ·其他植物物种中相关miRNA的预测 | 第58-59页 |
| ·马铃薯miRNA靶基因的预测与分析 | 第59-61页 |
| ·双子叶植物特有的miRNA分子 | 第61-63页 |
| ·miR395基因家族的分析 | 第63-66页 |
| ·马铃薯miRNA的表达分析 | 第66-77页 |
| ·马铃薯总RNA提取结果 | 第66-69页 |
| ·马铃薯DNA提取结果 | 第69页 |
| ·RT-PCR结果 | 第69-77页 |
| 第4章 讨论 | 第77-82页 |
| ·计算机RNA组学与实验RNA组学在研究miRNA中的重要意义 | 第77-78页 |
| ·动植物miRNA保守性分析 | 第78-79页 |
| ·马铃薯miRNA表达分析方法的建立 | 第79-80页 |
| ·miRNA的组织特异性表达 | 第80-81页 |
| ·miRNA靶分子的相关分析 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-90页 |
| 附录A miRNA预测程序及比较 | 第90-92页 |
| 附录B 预测miRNA靶序列的相关软件 | 第92-93页 |
| 附录C 马铃薯miRNA候选分子 | 第93-95页 |
| 附录D 预测马铃薯miRNA靶分子 | 第95-104页 |
| 附录E 预测其他植物中保守的miRNA候选分子 | 第104-111页 |
| 附录F 拟南芥与水稻中高度保守的miRNA | 第111-113页 |
| 附录G 缩略词 | 第113-114页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第114页 |