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玉米生态型自交不亲和系花丝基因差异表达分析

摘要第1-11页
1 文献综述第11-22页
   ·植物自交不亲和性第11-16页
     ·植物自交不亲和性的分类和遗传特征第11-12页
     ·禾本科自交不亲和性第12-16页
       ·禾本科自交不亲和性的发现及其遗传方式第12-13页
       ·禾本科自交不亲和基因的克隆与定位第13-15页
       ·禾本科自交不亲和性的分子机制第15-16页
   ·差异表达基因的克隆方法第16-22页
     ·克隆差异表达基因的常用方法第16-18页
       ·cDNA文库差示筛选法第16页
       ·差异显示反转录PCR技术(DDRT-PCR)第16-17页
       ·代表性差示分析法(RDA)第17页
       ·基因表达系列分析法(SAGE)第17-18页
       ·抑制差减杂交第18页
       ·DNA芯片和cDNA微列阵技术第18页
     ·本研究采用的抑制差减杂交SSH技术简介第18-22页
       ·抑制性消减杂交技术原理和试验流程第18-19页
       ·SSH技术的优缺点评析第19-20页
       ·抑制性消减杂交的应用与发展第20-22页
2 引言第22-23页
3.材料和方法第23-37页
   ·材料第23页
   ·方法第23-37页
     ·试验材料的种植、取样和鉴定第23页
     ·总RNA的抽提第23-25页
       ·实验前的准备第23页
       ·所需试验试剂第23-24页
       ·抽提RNA第24页
       ·RNA含量和质量的检测第24-25页
     ·mRNA的分离纯化第25-26页
     ·逆转录和正反向抑制差减杂交第26-31页
       ·mRNA反转录成cDNA第26-27页
       ·用RsaⅠ酶消化cDNA第27-28页
       ·检测RsaⅠ的消化效率第28页
       ·将tester cDNA接头连接第28-29页
       ·第一次杂交第29页
       ·第二次杂交第29-30页
       ·两轮PCR扩增第30-31页
     ·SSH第二次PCR产物的抽提第31-32页
     ·T/A克隆、电转化和差减文库扩增第32-33页
       ·检测PCR产物浓度第32页
       ·PCR产物与PGEM-T easy(Promega)载体连接第32页
       ·电转化(以下操作均在无菌环境下进行)第32-33页
       ·文库质量检测第33页
     ·正向和反向差减cDNA文库的反向Northern差异筛选第33-35页
       ·杂交点阵膜的制备第33页
       ·放射性探针标记第33-34页
       ·预杂交和杂交第34页
       ·洗X光片第34-35页
       ·差异表达克隆选取和阳性克隆测序第35页
     ·阳性克隆的生物信息学分析第35-37页
       ·差异克隆的序列同源性检索第35页
       ·差异基因的功能聚类第35-36页
       ·1A7的生物信息学分析第36-37页
4.结果与分析第37-54页
   ·试验株自交穗的考种和亲和性的判定第37-38页
   ·RNA的含量和质量测定结果第38-39页
   ·mRNA反转录成cDNA的电泳检测结果第39页
   ·第二次扣除杂交之后的PCR产物检测第39-40页
   ·对转化产物的PCR检测结果第40-41页
   ·差异筛选的Dot Blotting和阳性克隆测序第41-42页
   ·阳性克隆的生物信息学分析第42-54页
     ·测序克隆的序列同源性分析第43-45页
     ·差异基因的功能聚类第45-46页
     ·1A7的生物信息学分析第46-54页
       ·1A7的EST序列电子延伸第46-47页
       ·Contig1A7中ORF的查找第47-49页
       ·Contig1A7编码蛋白的分子量和等电点分析第49页
       ·Contig1A7编码蛋白二级结构预测第49页
       ·Contig1A7编码蛋白疏水性分析第49-50页
       ·Contig1A7编码蛋白跨膜域的预测第50-51页
       ·Contig1A7编码蛋白质功能域的确定第51-52页
       ·Contig1A7与几种植物同源序列氨基酸的比较分析第52-53页
       ·基于Contig1A7的系统发生树第53-54页
5.结论与讨论第54-57页
   ·结论第54页
   ·讨论第54-57页
     ·实验问题评价及改进方法第54-55页
     ·Contig1A7的研究意义第55页
     ·文库中的重点研究对象第55-56页
     ·后续研究中的技术策略第56-57页
参考文献第57-66页
Abstract:第66-68页
附录第68-70页
 附录1:抑制差减杂交原理流程图第68页
 附录2:pGEM-T Easy载体的结构和克隆位点及侧翼序列第68-69页
 附录3:SSH中所用的部分接头和引物序列第69页
 附录4:预杂交液/杂交液的配制第69-70页
 附录5:生物信息学分析中所用到的软件及网络连接第70页

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