21种雀形目鸟类细胞色素b基因序列分析及其系统发育研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 1 绪论 | 第7-20页 |
| 1．1 引言 | 第7-8页 |
| 1．2 鸟类分子系统学研究现状 | 第8-15页 |
| 1．2．1 研究方法及概况 | 第8-14页 |
| 1．2．2 问题及展望 | 第14-15页 |
| 1．3 雀形目鸟类简介及分子系统学研究现状 | 第15-16页 |
| 1．4 鸟类线粒体基因组与cyt-b基因 | 第16-19页 |
| 1．4．1 线粒体基因组 | 第16-18页 |
| 1．4．2 细胞色素b基因及其应用 | 第18-19页 |
| 1．5 本研究要解决的问题 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-27页 |
| 2．1 样品采集 | 第20页 |
| 2．2 总 DNA的提取及检测 | 第20-23页 |
| 2．2．1 DNA的提取 | 第20-23页 |
| 2．2．2 DNA质量检测 | 第23页 |
| 2．3 引物设计、PCR扩增及扩增产物检测 | 第23-24页 |
| 2．3．1 引物设计 | 第23页 |
| 2．3．2 PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2．3．3 扩增产物检测 | 第24页 |
| 2．4 PCR产物的回收与纯化 | 第24页 |
| 2．5 PCR产物的 T-A克隆 | 第24-26页 |
| 2．5．1 连接反应 | 第24页 |
| 2．5．2 转化 | 第24-25页 |
| 2．5．3 转化子蓝白斑筛选 | 第25页 |
| 2．5．4 转化子的鉴定 | 第25-26页 |
| 2．6 测序 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-45页 |
| 3．1 DNA提取结果 | 第27页 |
| 3．2 PCR扩增结果 | 第27-28页 |
| 3．3 测序结果 | 第28页 |
| 3．4 序列分析 | 第28-36页 |
| 3．4．1 异常片段的序列特征 | 第28-29页 |
| 3．4．2 cyt-b基因序列分析 | 第29-36页 |
| 3．5 系统树构建与检验 | 第36-43页 |
| 3．5．1 距离法构建系统树 | 第36-37页 |
| 3．5．2 简约法构建系统树 | 第37-43页 |
| 3．5．3 系统发育检验 | 第43页 |
| 3．6 分子钟与相对速率检验 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-52页 |
| 4．1 短片段的成因分析 | 第45-46页 |
| 4．2 所研究的雀形目鸟类的系统关系 | 第46-48页 |
| 4．2．1 科级系统关系 | 第46-48页 |
| 4．2．2 科下系统关系 | 第48页 |
| 4．3 关于系统树构建方法的讨论 | 第48-49页 |
| 4．4 分子钟和类群分歧时间 | 第49-51页 |
| 4．5 本研究的不足和待改进之处 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录 | 第58-60页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
