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棉花胞质雄性不育恢复基因的精细定位和物理作图

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
本文所用缩略词第15-17页
第一部分 文献综述第17-39页
 第一章 植物雄性不育的研究第17-24页
  1 植物雄性不育的类型第17-18页
  2 植物胞质雄性不育(CMS)分子机理的研究第18-20页
   ·叶绿体DNA(cpDNA)及其产物与CMS第18-19页
   ·线粒体DNA(mtDNA)及其产物与CMS第19-20页
   ·核质互作与CMS第20页
  3 基因工程创造雄性不育第20-21页
  4 棉花细胞质雄性不育(CMS)的研究第21-22页
  5 恢复基因的克隆第22-24页
 第二章 图位克隆(Map-based Cloning)第24-31页
  1 图位克隆的技术步骤第24-28页
   ·筛选与目标基因连锁的分子标记第24-27页
     ·随机扩增多态性DNA第24-25页
     ·微卫星DNA第25-26页
     ·STS(Sequence Tagged Sites)第26-27页
   ·目的基因区域的精细作图(Fine Map)第27页
   ·构建物理图谱(Physical Map)第27-28页
   ·克隆基因(Gene Cloning)第28页
  2 物理图谱(Physical Map)的构建第28-31页
   ·物理图谱的构建策略第29页
     ·菌落杂交第29页
     ·PCR技术第29页
   ·构建物理图谱的关键要素第29-30页
     ·克隆载体第29页
     ·克隆末端分离技术第29-30页
     ·染色体行走技术第30页
   ·物理图谱研究进展第30-31页
 第三章 基因组文库的构建第31-39页
  1 基因组文库第31页
   ·基因组文库的概念第31页
   ·基因组文库的类型第31页
  2 细菌人工染色体(BAC)文库第31-38页
   ·BAC文库的优点第31-32页
   ·BAC文库的载体第32-34页
     ·pBeloBACll载体第32页
     ·pIndigoBAC-5载体第32-33页
     ·双元T-DNA载体BIBAC(Binary BAC library)第33-34页
   ·BAC克隆策略第34-35页
   ·BAC的应用第35-36页
   ·棉花BAC文库的研究进展第36-38页
  3 研究目的与意义第38-39页
第二部分 研究报告第39-83页
 第四章 棉花胞质雄性不育(CMS)恢复基因的精细作图第39-49页
  Ⅰ 材料与方法第39-43页
   1 材料第39-41页
   ·遗传作图材料第39-40页
   ·分子标记的种类及其来源第40-41页
     ·SSR标记第40页
     ·RAPD标记第40页
     ·STS标记第40-41页
   2 方法第41-43页
   ·育性调查第41页
   ·棉花基因组DNA(微量)的提取第41-42页
   ·分子标记分析第42-43页
     ·SSR分析第42页
     ·RAPD分析第42页
     ·STS分析第42-43页
   ·遗传图谱的构建第43页
  Ⅱ 结果与分析第43-47页
   1 BC_1群体遗传分析第43页
   2 分子标记分析第43-46页
   ·SSR分析第43-45页
   ·RAPD分析第45页
   ·STS分析第45-46页
   ·分子标记来源及特征带大小第46页
   3 Rf_1基因紧密连锁图谱的构建第46-47页
  Ⅲ 讨论第47-49页
   1 精细作图的影响因素第47-48页
   ·表型鉴定的准确性第47-48页
   ·双亲之间的遗传差异第48页
   ·作图群体大小第48页
   2 育性恢复基因紧密连锁标记的应用第48-49页
   ·MAS应用第48页
   ·图位克隆应用第48-49页
 第五章 棉花CMS恢复系细菌人工染色体(BAC)基因组文库的构建第49-67页
  Ⅰ 材料与方法第49-59页
   1 材料第49页
   2 方法第49-59页
   ·棉花高分子量核DNA的制备第49-50页
     ·叶片的准备第49页
     ·细胞核的分离第49-50页
     ·胶块的制备第50页
     ·胶块质量的检测第50页
   ·部分酶切最佳酶用量的确定第50-52页
     ·酶切缓冲液(1)第50-51页
     ·酶切缓冲液(2)第51-52页
     ·确定部分酶切最佳酶用量第52页
   ·大片段DNA的大量酶切第52-53页
   ·酶切DNA片段的大小选择第53-54页
   ·电洗脱回收大片段DNA第54页
   ·大片段DNA与载体DNA的连接第54-55页
   ·连接产物的转化第55页
   ·单克隆文库及混合克隆文库的构建第55-56页
   ·BAC文库的分析第56-57页
     ·文库质量的分析第56页
     ·BAC单克隆稳定性的检测第56-57页
   ·细菌质粒DNA(微量)的提取第57-58页
     ·单个离心管(1.5ml)提取BAC质粒DNA第57-58页
     ·96孔板提取细菌质粒DNA第58页
   ·主要试剂第58-59页
  Ⅱ 结果与分析第59-65页
   1 棉花基因组文库的构建第59-62页
   ·棉花高分子量核DNA的制备第59页
     ·幼苗的避光培养第59页
     ·防氧化处理第59页
     ·不溶性杂质的去除第59页
   ·酶切片段的选择第59-60页
   ·电洗脱回收DNA第60-62页
   ·连接与转化第62页
   ·单克隆的挑取第62页
   2 BAC文库的质量分析第62-65页
   ·插入片段大小第62-63页
   ·BAC单克隆稳定性第63-65页
  Ⅲ 讨论第65-67页
   1 棉花基因组文库构建的方法第65-66页
   ·棉花高分子量基因组DNA的制备第65页
   ·目的片段的二次选择第65页
   ·目的片段DNA的回收第65-66页
   ·Not Ⅰ酶切位点第66页
   2 棉花BAC文库的优点与作用第66-67页
   ·BAC的优点第66页
   ·BAC文库的作用第66-67页
     ·基因的图位克隆第66页
     ·开发新的分子标记第66页
     ·BAC-FISH(Fluorescence in situ hybridization)的应用第66-67页
 第六章 棉花CMS恢复基因的物理作图第67-83页
  Ⅰ 材料与方法第67-69页
   1 材料第67页
   ·BAC文库第67页
   ·分子标记第67页
   ·限制性内切酶第67页
   2 方法第67-69页
   ·分子标记分析第67页
   ·质粒的提取第67-68页
   ·PCR法筛选BAC文库第68页
     ·PCR法筛选文库策略第68页
     ·PCR筛选BAC文库第68页
   ·重叠群构建第68页
   ·BAC末端测序第68-69页
   ·BAC末端序列的引物设计第69页
   ·新标记的增加第69页
  Ⅱ 结果与分析第69-80页
   1 分子标记筛选第69-74页
   ·SSR筛选第69-72页
   ·RAPD筛选第72-73页
   ·STS筛选第73-74页
   2 限制性酶切图谱的构建第74-80页
   ·Not Ⅰ酶切第74页
   ·HindⅢ酶切第74-77页
   ·重叠群(Contig)的构建第77-79页
   ·BAC末端测序第79页
   ·精细图谱的构建第79-80页
  Ⅲ 讨论第80-83页
   1 BC_1作图群体的效率第80-81页
   2 PCR法筛选BAC文库的可行性第81页
   3 BACs的指纹图谱第81页
   4 重叠群(Contig)的构建第81-82页
   5 BACs末端测序第82页
   6 增加了新的分子标记第82页
   7 CMS细胞质雄性不育育性恢复机理探讨第82-83页
全文结论第83-84页
参考文献第84-92页
附录第92-111页
致谢第111-112页
在读期间发表的论文第112页

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