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双列杂交分析与QTL定位分析之间关系的研究

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-16页
1 前言第16-18页
2 文献综述第18-37页
   ·经典数量遗传学的发展和分子数量遗传学的兴起第18-20页
     ·经典数量遗传学的发展第18-19页
     ·分子数量遗传学的兴起第19-20页
   ·双列杂交分析第20-22页
   ·遗传标记和作图群体第22-29页
     ·作图群体第22-24页
     ·遗传标记第24-29页
       ·形态标记第25页
       ·细胞学标记第25页
       ·生化标记第25-26页
       ·DNA分子标记第26-29页
         ·RFLP标记第26-27页
         ·RAPD标记第27页
         ·SSR标记第27-28页
         ·AFLP标记第28页
         ·SNP标记第28-29页
   ·QTL定位方法研究进展第29-35页
     ·基于加显模型的QTL定位方法第29-33页
       ·单标记分析法第29-30页
       ·简单区间作图法第30页
       ·复合区间作图法第30-31页
       ·基于混合线性模型的复合区间作图法第31-32页
       ·Bayesian分析方法第32-33页
     ·QTL上位性效应的研究第33-34页
     ·QTLX环境互作效应的研究第34-35页
   ·分子标记辅助选择第35-37页
3 双列杂交分析与QTL定位分析之间关系的模拟研究第37-82页
   ·前言第37页
   ·方法第37-43页
     ·双列杂交分析方法第37-38页
     ·QTL定位分析的遗传模型第38-40页
       ·DH群体QTL定位的遗传模型第38-39页
       ·永久F_2群体QTL定位的遗传模型第39-40页
     ·基于QTL定位结果预测群体各个体遗传效应的方法第40页
     ·QTL模拟数据产生方法第40-43页
     ·双列杂交分析与QTL定位分析之间的相关系数估算方法第43页
   ·结果与分析第43-80页
     ·双列杂交分析(估计值)QTL模拟真值与之间关系的研究第43-65页
       ·比较两种定义下的各遗传效应组分在不同基因型下的对应关系第43-49页
         ·加性(A)效应与加性×环境互作(AE)效应第44-46页
         ·显性(D)效应与显性×环境互作(DE)效应第46-47页
         ·加加上位性(AA)效应与加加×环境互作(AAE)效应第47-49页
       ·双列杂交分析与QTL模拟真值之间各遗传效应的相关性程度比较第49-52页
         ·遗传效应值相等时的相关性比较第49-51页
         ·遗传效应方差相等时的相关性比较第51-52页
       ·DH群体与IF_2群体样本容量比例大小对A效应相关性的影响第52-53页
       ·QTL数目对相关性的影响第53-55页
       ·QTL间连锁对相关性的影响第55-56页
       ·各遗传效应相互之间对彼此相关性的影响第56-63页
         ·A效应与D效应相互对彼此相关性的影响第56-59页
         ·A效应与AA效应相互对彼此相关性的影响第59-63页
       ·分别选用DH群体与IF_2群体估算出的r_A与r_(AA)的差异第63-65页
         ·分别选用DH和IF_2群体估算出的r_A的差异第63-64页
         ·分别选用DH和IF_2群体估算出的r_(AA)的差异第64-65页
     ·QTL模拟真值与QTL定位分析(估计值)之间关系的研究第65-71页
       ·多基因遗传体系相关性的影响第65-70页
       ·QTL效应值偏差对相关性的影响第70页
       ·QTL位置偏差对相关性的影响第70-71页
       ·假QTL对相关性的影响第71页
       ·概率Threshold(P值)对相关性的影响第71页
     ·双列杂交分析(估计值)与QTL定位分析(估计值)之间关系的研究第71-80页
       ·多基因遗传控制体系的差异对相关性的影响第72-78页
         ·基因组中QTL只具有A效应第72-74页
         ·基因组中同时存在A效应QTL与D效应QTL第74-78页
       ·QTL效应值偏差对相关性的影响第78-79页
       ·QTL位置偏差对二者相关性的影响第79-80页
       ·假QTL对二者相关性的影响第80页
       ·选择不同的概率Threshold(P值)对相关性的影响第80页
   ·小结第80-82页
4 实例分析:水稻QTL定位分析与双列杂交分析之间的关系第82-99页
   ·前言第82-83页
     ·材料与方法第83-85页
     ·实验材料第83页
     ·田间实验第83页
     ·性状调查第83-85页
     ·统计分析方法第85页
   ·结果与分析第85-97页
     ·水稻双列杂交分析第85-87页
     ·水稻QTL定位分析第87-90页
       ·QTL鉴别与位置估计第87页
       ·QTL遗传效应估计第87-90页
     ·双列杂交分析与QTL定位分析相关性分析第90-97页
       ·双列杂交分析与QTL定位分析之间的相关系数估算第90-91页
       ·双列杂交分析与QTL定位分析之间的相关性分析第91-96页
         ·加性效应的相关性分析第91-94页
         ·显性效应的相关性分析第94-96页
       ·相关性分析对育种实践的启示第96-97页
   ·小结第97-99页
5 基于水稻QTL定位结果的预测分析第99-117页
   ·前言第99页
   ·材料与方法第99-102页
     ·材料第99页
     ·方法第99-102页
       ·永久性F_2群体QTL定位遗传模型第99页
       ·基于QTL效应的杂种优势遗传组成预测方法第99-100页
         ·基于QTL主效应的杂种优势预测第99-100页
         ·基于QE互作随机效应的环境互作杂种优势预测第100页
       ·最佳QTL基因型及其遗传效应预测方法第100-102页
   ·结果与分析第102-116页
     ·QTL定位分析结果第102-110页
       ·QTL鉴别与位置估计第102页
       ·QTL遗传效应估计第102-110页
         ·QTL遗传主效应估计第102页
         ·QE互作效应的预测第102-110页
     ·基于QTL定位结果的杂种优势预测第110页
     ·基于QTL定位结果的最优基因型预测第110-116页
   ·小结第116-117页
6 讨论第117-124页
   ·数量遗传学中两种遗传效应的定义第117-119页
   ·主基因与微效多基因遗传体系(多基因遗传控制体系)第119-120页
   ·双列杂交分析与QTL定位分析的各自特点及比较第120-121页
   ·双列杂交分析与QTL定位分析之间的相关性分析第121-122页
   ·双列杂交分析与QTL定位分析之间相关性分析对遗传育种的指导意义第122-124页
7 参考文献第124-139页

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