| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| ·研究背景 | 第8-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-14页 |
| ·研究现状 | 第10-13页 |
| ·研究现状分析 | 第13-14页 |
| ·本文的主要工作 | 第14-15页 |
| ·本文的组织结构 | 第15-16页 |
| 第二章 相关技术研究 | 第16-28页 |
| ·可视化技术简介 | 第16-18页 |
| ·可视化的分类 | 第16-17页 |
| ·科学可视化技术的主要特点 | 第17页 |
| ·科学可视化开发技术 | 第17-18页 |
| ·开源化学软件开发工具包 | 第18-22页 |
| ·CDK | 第18-20页 |
| ·JChemPaint | 第20页 |
| ·Jmol | 第20-21页 |
| ·BioJava | 第21-22页 |
| ·Eclipse平台 | 第22-28页 |
| ·Eclipse平台体系架构 | 第23-24页 |
| ·Eclipse的插件技术 | 第24-25页 |
| ·Eclipse通信机制 | 第25-26页 |
| ·RCP应用开发 | 第26-28页 |
| 第三章 关键技术研究 | 第28-37页 |
| ·CDK的图形显示机制 | 第28-29页 |
| ·二维化学结构的解析 | 第29-30页 |
| ·生物大分子三维显示问题 | 第30-33页 |
| ·CdkJmolAdapter | 第31-32页 |
| ·Jmol如何渲染数据类 | 第32-33页 |
| ·蛋白质序列的处理问题 | 第33-37页 |
| ·三种常用的序列格式 | 第34页 |
| ·Biojava实现序列的输入输出 | 第34-37页 |
| 第四章 分子可视化软件的设计与实现 | 第37-51页 |
| ·ChemMolViewer的体系结构 | 第37-38页 |
| ·ChemMolViewer的系统结构设计 | 第37页 |
| ·ChemMolViewer的用户界面 | 第37-38页 |
| ·ChemMolViewer的功能模块 | 第38-39页 |
| ·ChemMolViewer的实现 | 第39-51页 |
| ·ChemMolViewer中GUI模块 | 第39-41页 |
| ·ChemMolViewer中二维化学结构的显示和编辑 | 第41-45页 |
| ·ChemMolViewer中蛋白质序列的显示 | 第45-48页 |
| ·三维化学结构操作环境 | 第48-51页 |
| 第五章 结论与展望 | 第51-53页 |
| ·本文工作总结 | 第51页 |
| ·未来工作展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 研究生期间参与的项目和发表的论文 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |