| 摘要 | 第1-15页 |
| Abstract | 第15-18页 |
| 第一部分 A 型流感病毒HA 基因遗传多样性分析 | 第18-43页 |
| 1 引言 | 第18-24页 |
| ·流感概述 | 第18页 |
| ·A 型流感病毒概述 | 第18-19页 |
| ·分类地位 | 第18页 |
| ·形态结构及化学组成 | 第18-19页 |
| ·对理化因素的抵抗力 | 第19页 |
| ·血清分型 | 第19页 |
| ·A 型流感病毒HA 基因分子生物学特性 | 第19-23页 |
| ·病毒基因组结构及编码蛋白的功能 | 第19-20页 |
| ·HA 基因及编码蛋白的功能 | 第20页 |
| ·HA 基因与A 型流感病毒的变异 | 第20-21页 |
| ·HA 基因与A 型流感病毒毒力相关分析 | 第21-22页 |
| ·HA 基因与宿主特异性相关分析 | 第22-23页 |
| ·实验目的与意义 | 第23-24页 |
| 2 研究方法 | 第24-25页 |
| ·代表株的初步分析与筛选 | 第24页 |
| ·代表株间遗传距离的计算 | 第24页 |
| ·系统进化分析 | 第24页 |
| ·谱系和亚分支的划分 | 第24-25页 |
| 3 结果 | 第25-39页 |
| ·A 型流感病毒HA 亚型遗传多样性分析 | 第25-26页 |
| ·H1 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第26-29页 |
| ·H2 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第29页 |
| ·H3 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第29-32页 |
| ·H5 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第32-33页 |
| ·H7、H10、H15 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第33-35页 |
| ·H9 亚型A 型流感病毒遗传多样性及进化分析 | 第35-37页 |
| ·其他HA 亚型A 型流感毒株遗传多样性及进化分析 | 第37-39页 |
| 4 讨论 | 第39-42页 |
| ·系统进化分析计算方法 | 第39页 |
| ·代表株的选择与系统进化分析 | 第39-40页 |
| ·A 型流感病毒HA 基因的遗传多样性分析 | 第40页 |
| ·A 型流感病毒HA 基因谱系划分及命名方法 | 第40-42页 |
| 5 结论 | 第42-43页 |
| 第二部分 2007-2008 年我国部分地区H9 亚型AIV 的分离鉴定与HA 基因分子进化分析 | 第43-69页 |
| 1 引言 | 第43-49页 |
| ·禽流感概述 | 第43页 |
| ·禽流感的流行病学 | 第43-46页 |
| ·传染源 | 第43页 |
| ·易感动物 | 第43-44页 |
| ·传播途径 | 第44-45页 |
| ·流行季节 | 第45页 |
| ·宿主间流行特征 | 第45-46页 |
| ·H9 亚型禽流感病毒的研究进展 | 第46-48页 |
| ·H9 亚型AIV 的流行情况 | 第46-47页 |
| ·H9 亚型AIV 的分子流行病学研究进展 | 第47-48页 |
| ·实验目的及意义 | 第48-49页 |
| 2 材料与方法 | 第49-56页 |
| ·材料 | 第49-51页 |
| ·样品的采集 | 第49页 |
| ·主要试剂与主要仪器 | 第49-50页 |
| ·主要溶液与培养基的配制 | 第50页 |
| ·DH5α感受态细胞的制备 | 第50-51页 |
| ·引物的设计与合成 | 第51页 |
| ·方法 | 第51-56页 |
| ·病毒的扩增 | 第51页 |
| ·病毒RNA 的提取 | 第51-52页 |
| ·一步法RT-PCR 检测 | 第52页 |
| ·DNA 琼脂糖凝胶电泳 | 第52页 |
| ·一步法RT-PCR 扩增HA 基因 | 第52页 |
| ·目的基因片段的回收（PCR 产物的纯化） | 第52-53页 |
| ·目的片段与载体的连接 | 第53页 |
| ·转化 | 第53-54页 |
| ·碱裂解法小量制备质粒DNA | 第54页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第54-55页 |
| ·核苷酸序列测定 | 第55页 |
| ·序列的拼接与分析 | 第55页 |
| ·H9 亚型毒株的分子进化分析 | 第55-56页 |
| 3 结果与分析 | 第56-66页 |
| ·结果 | 第56-58页 |
| ·病原RT-PCR 检测结果 | 第56页 |
| ·HA 基因RT-PCR 扩增结果 | 第56-57页 |
| ·重组质粒的菌液PCR 鉴定结果 | 第57-58页 |
| ·重组质粒酶切鉴定结果 | 第58页 |
| ·序列测定结果 | 第58页 |
| ·分析 | 第58-66页 |
| ·核苷酸序列同源性比较 | 第58-61页 |
| ·编码氨基酸序列分析比较 | 第61-64页 |
| ·07-08 年中国H9 亚型AIV 的HA 基因分子演化分析 | 第64-66页 |
| 4 讨论 | 第66-68页 |
| ·H9 亚型AIV 的病原学检测 | 第66页 |
| ·2007-2008 年H9 亚型AIV 的HA 序列分析 | 第66-67页 |
| ·2007-2008 年H9 亚型AIV 的HA 基因分子进化分析 | 第67-68页 |
| 5 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文与著作 | 第78页 |
