主要缩略词 | 第7-8页 |
中文摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
引言 | 第13-16页 |
第一部分 两种证型的强直性脊柱炎患者与正常人群口腔菌群的多样性及差异性分析 | 第16-34页 |
1 研究对象 | 第16-18页 |
2 材料与方法 | 第18-23页 |
2.1 实验材料 | 第18页 |
2.1.1 主要实验材料 | 第18页 |
2.1.2 主要实验仪器 | 第18页 |
2.2 样本的采集和处理 | 第18-19页 |
2.3 DNA的提取 | 第19页 |
2.4 菌群DNA的测序 | 第19-22页 |
2.4.1 基因组DNA的质控 | 第19-20页 |
2.4.2 设计并合成引物 | 第20页 |
2.4.3 PCR扩增及纯化 | 第20-22页 |
2.4.4 Illumina Miseq测序 | 第22页 |
2.5 扩增子数据分析 | 第22-23页 |
2.5.1 质控,实验设计,双端序列合并 | 第22页 |
2.5.2 样品拆分,切除引物序列 | 第22页 |
2.5.3 格式转换,去除冗长,聚类 | 第22页 |
2.5.4 生成OTU表,物种注释,OTU表操作 | 第22-23页 |
2.5.5 Alpha多样性、Beta多样性分析 | 第23页 |
3 统计分析 | 第23页 |
4 结果 | 第23-32页 |
4.1 一般资料 | 第23-24页 |
4.2 强直性脊柱炎及健康志愿者口腔菌群的组成情况 | 第24-27页 |
4.2.1 强直性脊柱炎患者及健康志愿者口腔菌群组成在门水平的分类 | 第24-25页 |
4.2.2 强直性脊柱炎患者及健康志愿者口腔菌群组成在科水平的分类 | 第25-26页 |
4.2.3 强直性脊柱炎患者及健康志愿者口腔菌群组成在属水平的分类 | 第26-27页 |
4.3 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群多样性分析及对比 | 第27-29页 |
4.3.1 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群的ɑ多样性分析及对比 | 第27-28页 |
4.3.2 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群的β多样性分析及对比 | 第28-29页 |
4.4 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群丰度的差异性分析 | 第29-32页 |
4.4.1 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群在门水平的差异 | 第29-30页 |
4.4.2 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群在科水平的差异 | 第30页 |
4.4.3 强直性脊柱炎患者和健康志愿者口腔菌群在属水平的差异 | 第30-32页 |
5 讨论 | 第32-34页 |
第二部分 口腔菌群与强直性脊柱炎疾病活动度及免疫紊乱的相关性 | 第34-45页 |
1 研究对象 | 第34页 |
2 资料与方法 | 第34-36页 |
2.1 实验材料和仪器 | 第34-35页 |
2.1.1 主要实验材料 | 第34页 |
2.1.2 主要实验仪器 | 第34-35页 |
2.2 样本的采集 | 第35页 |
2.3 检测方法 | 第35页 |
2.4 临床观察指标 | 第35-36页 |
2.4.1 一般指标 | 第35页 |
2.4.2 疾病活动度评估指标 | 第35-36页 |
2.4.3 临床实验室指标 | 第36页 |
3 统计分析 | 第36页 |
4 结果 | 第36-41页 |
4.1 一般资料 | 第36页 |
4.2 强直性脊柱炎患者临床疾病活动情况 | 第36-37页 |
4.3 菌群与临床疾病活动度的相关性 | 第37-38页 |
4.4 强直性脊柱炎患者黏膜免疫相关细胞因子的表达情况 | 第38-39页 |
4.5 菌群与细胞因子的相关性 | 第39-41页 |
5 讨论 | 第41-45页 |
第三部分 两种证型强直性脊柱炎患者口腔菌群的多样性及差异性分析 | 第45-53页 |
1 研究对象 | 第45页 |
1.1 中医证型的诊断标准 | 第45页 |
1.2 排除标准 | 第45页 |
2 资料与方法 | 第45页 |
3 统计分析 | 第45页 |
4 结果 | 第45-50页 |
4.1 基本情况 | 第45-46页 |
4.2 两种证型强直性脊柱炎患者疾病活动度及细胞因子对比 | 第46页 |
4.3 两种证型强直性脊柱炎患者口腔菌群的多样性分析及对比 | 第46-48页 |
4.3.1 两种证型患者口腔菌群的ɑ多样性分析及对比 | 第46-47页 |
4.3.2 两种证型患者口腔菌群的β多样性分析及对比 | 第47-48页 |
4.4 两种证型强直性脊柱炎患者口腔菌群丰度的差异性分析 | 第48-50页 |
4.4.1 两种证型 AS 患者口腔菌群在门水平的差异 | 第48页 |
4.4.2 两种证型 AS 患者口腔菌群在科水平的差异 | 第48-49页 |
4.4.3 两种证型 AS 患者口腔菌群在属水平的差异 | 第49-50页 |
5 讨论 | 第50-53页 |
结论 | 第53-54页 |
致谢 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-60页 |
附录1 文献综述 口腔菌群与风湿病相关性的研究进展 | 第60-67页 |
参考文献 | 第64-67页 |
附录2 已发表论文 | 第67-76页 |
附录3 光华脊柱关节炎数据库病例报告表 | 第76-80页 |
学术会议情况 | 第80页 |