长江流域二倍体泥鳅野生群体遗传多样性的微卫星分析
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1 遗传多样性的概念及其意义 | 第10-11页 |
| ·遗传多样性的概念 | 第10页 |
| ·研究水产动物遗传多样性的意义 | 第10-11页 |
| 2 遗传多样性的研究方法 | 第11-16页 |
| ·形态学标记 | 第11-12页 |
| ·细胞学标记 | 第12-13页 |
| ·生物化学标记 | 第13页 |
| ·分子遗传标记 | 第13-16页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLP)标记 | 第13-14页 |
| ·扩增片段长度多态性(AFLP)标记 | 第14-15页 |
| ·随即引物扩增多态性(RAPD)标记 | 第15页 |
| ·微卫星DNA标记 | 第15-16页 |
| ·单核苷酸(SNP)标记 | 第16页 |
| 3 微卫星分子标记在水产动物中的应用 | 第16-20页 |
| ·微卫星DNA的形成机制及其功能 | 第17页 |
| ·微卫星标记的特点 | 第17-18页 |
| ·微卫星DNA数量大、分布广且均匀 | 第17页 |
| ·微卫星DNA具有多态性和保守性 | 第17-18页 |
| ·微卫星呈共显性遗传 | 第18页 |
| ·微卫星检测快速方便 | 第18页 |
| ·微卫星位点的分离 | 第18-19页 |
| ·微卫星分子标记在水产动物中的应用 | 第19-20页 |
| ·水产动物群体遗传多样性研究 | 第19页 |
| ·物种鉴定与亲缘关系分析 | 第19-20页 |
| ·遗传图谱构建 | 第20页 |
| 4 泥鳅种质资源和遗传学研究现状 | 第20-21页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 二倍体泥鳅遗传多样性的微卫星分析 | 第22-57页 |
| 1 材料和方法 | 第22-28页 |
| ·样本采集 | 第22-23页 |
| ·实验主要仪器与试剂 | 第23-25页 |
| ·主要仪器及来源 | 第23页 |
| ·主要试剂及来源 | 第23-24页 |
| ·泥鳅倍性检测相关试剂 | 第24页 |
| ·动物基因组DNA提取所用溶液配制 | 第24-25页 |
| ·琼脂糖、聚丙烯酰胺凝胶电泳所用试剂 | 第25页 |
| ·银染所用试剂 | 第25页 |
| ·泥鳅倍性检测 | 第25-26页 |
| ·二倍体泥鳅基因组DNA的提取与检测 | 第26-27页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第26页 |
| ·DNA的电泳检测和浓度测定 | 第26-27页 |
| ·二倍体泥鳅的微卫星PCR扩增 | 第27-28页 |
| ·微卫星引物筛选 | 第27页 |
| ·微卫星扩增反应体系和热循环参数 | 第27页 |
| ·PCR扩增产物电泳检测 | 第27-28页 |
| ·PCR扩增产物的聚丙烯酞胺凝胶电泳 | 第28页 |
| ·银染检测及分析 | 第28页 |
| 2 数据统计与分析 | 第28-34页 |
| ·微卫星基因型的判断 | 第28-29页 |
| ·群体内的遗传分析 | 第29-31页 |
| ·等位基因数和有效等位基因数 | 第29页 |
| ·等位基因频率 | 第29页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验 | 第29-30页 |
| ·杂合度 | 第30-31页 |
| ·多态信息含量 | 第31页 |
| ·群体间的遗传分析 | 第31-34页 |
| ·F-统计量 | 第31-32页 |
| ·遗传分化系数 | 第32-33页 |
| ·分子方差分析(AMOVA) | 第33页 |
| ·群体每代迁移数和成对固定指数 | 第33页 |
| ·地理隔离和Nei’s标准遗传距离 | 第33-34页 |
| ·聚类分析 | 第34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-50页 |
| ·泥鳅倍性检测结果 | 第34-35页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第35页 |
| ·微卫星引物筛选结果 | 第35-36页 |
| ·微卫星PCR扩增结果 | 第36-40页 |
| ·六个二倍体泥鳅群体的遗传多样性分析 | 第40-50页 |
| ·等位基因和等位基因频率 | 第40-43页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验平衡检验 | 第43-44页 |
| ·遗传杂合度和多态信息含量 | 第44-46页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第46-48页 |
| ·地理隔离和聚类分析 | 第48-50页 |
| 4 讨论 | 第50-55页 |
| ·关于本研究的实验技术体系 | 第50-53页 |
| ·关于样本容量 | 第50-51页 |
| ·关于PCR扩增反应条件 | 第51页 |
| ·关于聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳 | 第51-52页 |
| ·关于“影子带”和目的带的判读 | 第52-53页 |
| ·二倍体泥鳅群体的遗传多样性 | 第53-54页 |
| ·二倍体泥鳅群体的遗传分化 | 第54-55页 |
| 5 结论 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
