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棉花体细胞胚胎发生相关基因GhHmgB3的克隆及功能分析

摘要第1-10页
Abstract第10-13页
缩写名词表第13-14页
1 文献综述第14-32页
   ·植物体细胞胚胎发生研究概况第14-19页
     ·影响植物体细胞胚胎发生的因素第14-16页
     ·影响植物体细胞胚胎发生的关键基因第16-19页
       ·WUSCHEL(WUS)基因第16页
       ·SERK基因第16-17页
       ·LEAFY COTYLEDON(LEC)基因第17-18页
       ·late embryo-abundant(LEA)基因第18-19页
     ·植物体细胞胚胎发育的机制第19页
   ·HmgB基因的功能研究第19-25页
     ·HmgB家族的结构特点和命名方式第19-21页
     ·HmgB基因在酵母中的研究第21页
     ·HmgB在植物中的研究第21-22页
     ·HmgB在动物中的研究第22-25页
       ·细胞外HmgB蛋白在疾病研究中的作用第22-24页
       ·HmgB蛋白在生长发育中的作用第24-25页
   ·β-catenin的功能研究第25-30页
     ·β-catenin的结构特点第25-26页
     ·β-catenin的功能第26-30页
       ·β-catenin通过Wnt途径决定细胞的命运第26-28页
       ·β-catenin促进细胞的增殖第28-29页
       ·β-catenin在疾病和癌症中的研究第29-30页
   ·本研究的目的与意义第30-32页
2 陆地棉HmgB家族基因的克降和鉴定第32-46页
   ·引言第32页
   ·材料与方法第32-39页
     ·实验材料,主要试剂和仪器第32-33页
       ·实验材料第32页
       ·主要试剂第32-33页
     ·实验方法第33-39页
       ·RNA的抽提第33页
       ·mRNA的分离和RACE模板的制备第33-34页
       ·HmgB基因的全长克隆第34-35页
       ·陆地棉HmgB家族基因的表达模式分析第35-37页
       ·陆地棉HmgB蛋白序列的进化树分析第37-39页
   ·结果与分析第39-44页
     ·RNA的提取、mRNA的分离第39页
     ·RACE扩增与全长序列的获得第39-40页
     ·GhHmgB家族基因在不同组织内的表达模式第40-42页
     ·GhHmgB家族基因的生物信息学分析第42-44页
   ·讨论第44-46页
     ·GhHmgB家族成员RACE克隆的几点经验第44页
     ·GhHmgB家族成员的结构特点第44-46页
3 RNAi载体构建,转基因材料的鉴定与表型观察第46-62页
   ·材料与方法第46-54页
     ·棉花材料第46页
     ·主要菌株和试剂第46-50页
       ·所用载体菌株第46页
       ·相关酶类和试剂第46页
       ·转基因相关培养基第46页
       ·DNA抽提相关溶液第46-47页
       ·Western相关试剂第47-50页
     ·RNAi载体的构建和遗传转化第50页
     ·农杆菌介导的遗传转化第50-51页
       ·下胚轴、胚性愈伤的诱导第50-51页
       ·农杆菌转化第51页
       ·转基因材料的获得第51页
     ·转基因材料的鉴定第51-54页
       ·转基因材料DNA水平检测第51-52页
       ·转基因材料RNA水平检测第52页
       ·转基因材料蛋白质水平检测(Western blotting)第52-53页
       ·胚性愈伤均一化的悬浮培养与表型观察第53-54页
   ·结果与分析第54-59页
     ·酶切检测RNAi载体pHellsgate 4的构建第54页
     ·RNAi下胚轴的分化和脱分化情况第54-55页
     ·RNAi胚性愈伤的鉴定和表型观察第55-59页
       ·DNA水平的NPTⅡ检测第56页
       ·RNA水平的检测第56-58页
       ·蛋白质水平的Western检测第58页
       ·转基因胚性愈伤的同步化培养和表型鉴定第58-59页
   ·讨论第59-62页
     ·提高BP反应效率的几点经验第59-60页
     ·适合棉花的蛋白质粗提方法以及Western反应第60-61页
     ·胚性愈伤转化的几点问题第61页
     ·本研究中RNAi材料的表型第61-62页
4. Solexa sequencing和相关功能的验证第62-85页
   ·引言第62-63页
   ·材料和方法第63-67页
     ·实验材料第63页
     ·相关试剂第63-64页
       ·细胞增殖相关试剂第63页
       ·分离原生质体相关溶液第63-64页
     ·实验方法第64-67页
       ·Solexa sequencing第64-65页
       ·Solexa Sequencing数据分析第65-66页
       ·细胞增殖测定第66页
       ·MTS assay第66页
       ·细胞周期分析第66页
       ·透射电镜扫描第66-67页
   ·结果和分析第67-79页
     ·RNAi和对照间差异表达的基因第67页
     ·差异基因的GO和KEGG分析第67-69页
     ·β-catenin相关基因的Real-time PCR验证第69-75页
     ·细胞增殖检测第75-76页
       ·细胞悬浮培养10天后的增殖率统计第75页
       ·MTS酶活检测第75-76页
     ·细胞周期分析第76-78页
     ·透射电镜扫描第78-79页
   ·讨论第79-85页
     ·β-catenin相关的代谢路径调节棉花体细胞胚胎的发育第79-83页
       ·β-catenin促进细胞的增殖第79-80页
       ·一条和Wnt/β-catenin类似的代谢路径决定细胞的命运第80-82页
       ·GhHmgB3参与β-catenin相关路径的方式第82-83页
     ·GhHmgB3是细胞的正常生长的重要指标第83-85页
参考文献第85-98页
附录第98-138页
在读期间发表的论文第138-139页
致谢第139页

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