| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引用术语缩写说明 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-14页 |
| 1.2 实验动物 | 第14-17页 |
| 1.2.1 陆川猪 | 第14-15页 |
| 1.2.2 杜洛克猪 | 第15-17页 |
| 1.3 猪肉品质 | 第17-18页 |
| 1.3.1 猪肉品质的指标 | 第17-18页 |
| 1.4 脂代谢 | 第18页 |
| 1.5 circRNA以及circRNA测序 | 第18-20页 |
| 1.5.1 circRNA的概念 | 第18页 |
| 1.5.2 circRNA的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.5.3 circRNA的功能和作用机制 | 第20页 |
| 1.6 高通量测序技术及其应用 | 第20-21页 |
| 1.7 GO数据库和KEGG数据库的介绍 | 第21页 |
| 1.8 试验研究的内容、目的及意义 | 第21-23页 |
| 1.8.1 研究的内容 | 第21-22页 |
| 1.8.2 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1 试验仪器与试剂耗材 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.1.2 试验试剂与耗材 | 第24-25页 |
| 2.2 试验动物处理和主要试剂的配制 | 第25-26页 |
| 2.2.1 试验动物饲喂管理以及屠宰取样 | 第25页 |
| 2.2.2 主要溶液的配置方法 | 第25-26页 |
| 2.3 肉质测定 | 第26页 |
| 2.3.1 背膘厚度测定 | 第26页 |
| 2.3.2 pH值测定 | 第26页 |
| 2.3.3 肉色测定 | 第26页 |
| 2.3.4 系水力测定 | 第26页 |
| 2.3.5 剪切力测定 | 第26页 |
| 2.4 试验方法 | 第26-28页 |
| 2.4.1 组织总RNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.4.2 高通量测序 | 第27-28页 |
| 2.5 高通量测序的数据分析 | 第28-29页 |
| 2.5.1 数据质量控制 | 第28-29页 |
| 2.5.2 测序数据与参考基因组序列比对分析 | 第29页 |
| 2.5.3 转录组文库质量评估 | 第29页 |
| 2.6 circRNA的鉴定 | 第29-30页 |
| 2.7 差异表达分析 | 第30页 |
| 2.8 统计分析 | 第30-31页 |
| 第三章 试验结果与分析 | 第31-61页 |
| 3.1 正常饲养条件下两种猪的猪肉品质性状评价 | 第31页 |
| 3.2 高通量测序 | 第31-35页 |
| 3.2.1 样品中总RNA的质量检测结果 | 第31-33页 |
| 3.2.2 RNA文库构建及质量控制 | 第33-34页 |
| 3.2.3 circRNA片段化的随机性检测 | 第34-35页 |
| 3.3 circRNA测序数据概况 | 第35-40页 |
| 3.3.1 原始数据及其质量控制 | 第35-38页 |
| 3.3.2 Mapped Reads在染色体上和参考基因组上不同区域的分布 | 第38-40页 |
| 3.4 circRNA的分析结果 | 第40-61页 |
| 3.4.1 circRNA的鉴定 | 第40-41页 |
| 3.4.2 circRNA的特征分析 | 第41-44页 |
| 3.4.3 circRNA的表达特征 | 第44-51页 |
| 3.4.4 circRNA与mRNA的表达差异分析 | 第51-52页 |
| 3.4.5 circRNA功能相关的分析 | 第52-57页 |
| 3.4.6 脂肪相关的circRNA的QTL联合分析 | 第57-61页 |
| 第四章 讨论 | 第61-64页 |
| 4.1 circRNA的组织特异性分析 | 第61页 |
| 4.2 circRNA的差异表达分析 | 第61-62页 |
| 4.3 脂肪相关的QTL联合分析 | 第62-64页 |
| 第五章 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 附录 | 第71-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文情况 | 第75页 |
