| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 创新点 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-29页 |
| 1.1 水生态系统中氮素的生物地球化学循环 | 第15-16页 |
| 1.2 微生物在水生态系统氮循环中的作用 | 第16-24页 |
| 1.2.1 好氧氨氧化细菌 | 第17-19页 |
| 1.2.2 氨氧化古菌 | 第19-21页 |
| 1.2.3 AOA和AOB的活性及其对氨氧化作用的相对贡献 | 第21-22页 |
| 1.2.4 反硝化作用 | 第22-23页 |
| 1.2.5 蓝藻水华暴发对水生态系统中微生物的影响 | 第23-24页 |
| 1.3 水生态系统中水生植物对氮循环微生物的影响 | 第24-25页 |
| 1.4 研究目的、意义和技术路线 | 第25-29页 |
| 1.4.1 研究目的及意义 | 第25-27页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第27-29页 |
| 第二章 太湖不同湖区沉积物中氨氧化和反硝化微生物的丰度和群落组成 | 第29-63页 |
| 2.1 材料和方法 | 第30-33页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第30页 |
| 2.1.2 理化指标的测定 | 第30-31页 |
| 2.1.3 PNR的测定 | 第31页 |
| 2.1.4 DNA提取和定量PCR | 第31-32页 |
| 2.1.5 T-RFLP | 第32-33页 |
| 2.1.6 统计分析 | 第33页 |
| 2.2 结果 | 第33-52页 |
| 2.2.1 各点沉积物理化特征 | 第33-36页 |
| 2.2.2 沉积物-水界面氮素交换通量 | 第36页 |
| 2.2.3 氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)的amoA基因丰度的变化 | 第36-38页 |
| 2.2.4 潜在硝化速率(PNR)的变化 | 第38-41页 |
| 2.2.5 AOA和AOB群落结构的变化 | 第41-48页 |
| 2.2.6 反硝化nirK和nirS基因丰度的变化 | 第48-52页 |
| 2.3 讨论 | 第52-59页 |
| 2.3.1 太湖北部湖区氨氧化菌的分布和数量以及北部湖区的氨氧化能力 | 第52-55页 |
| 2.3.2 氨氧化菌的群落结构 | 第55-57页 |
| 2.3.3 反硝化微生物的数量和太湖北部湖区的反硝化能力 | 第57-59页 |
| 2.4 本章小结 | 第59-63页 |
| 第三章 蓝藻水华堆积和降解对太湖水体中氨氧化和反硝化微生物的影响 | 第63-97页 |
| 3.1 材料和方法 | 第64-68页 |
| 3.1.1 体系构建 | 第64页 |
| 3.1.2 样品的采集 | 第64-65页 |
| 3.1.3 理化指标的测定 | 第65页 |
| 3.1.4 PNR的测定 | 第65页 |
| 3.1.5 DNA的提取 | 第65-66页 |
| 3.1.6 末端限制性酶切片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第66-67页 |
| 3.1.7 定量PCR | 第67页 |
| 3.1.8 统计分析 | 第67-68页 |
| 3.2 结果 | 第68-90页 |
| 3.2.1 理化指标的变化 | 第68-75页 |
| 3.2.2 T-RFLP分析细菌群落结构的变化 | 第75-78页 |
| 3.2.3 细菌群落的抵抗力和恢复力 | 第78-83页 |
| 3.2.4 氮转化速率的变化 | 第83-86页 |
| 3.2.5 细菌16S rDNA、古菌和细菌amoA、nirK、nirS基因丰度的变化 | 第86-90页 |
| 3.3 讨论 | 第90-96页 |
| 3.3.1 蓝藻水华暴发使水体中微生物群落结构短期内发生剧烈变化 | 第90-91页 |
| 3.3.2 蓝藻水华暴发和降解过程中水体细菌数量和群落结构的变化 | 第91-92页 |
| 3.3.3 理化因子和细菌群落结构在蓝藻水华暴发过程中的变化 | 第92-94页 |
| 3.3.4 蓝藻水华暴发和降解过程中的氨氧化作用 | 第94页 |
| 3.3.5 蓝藻水华暴发促进水体中反硝化作用 | 第94-96页 |
| 3.4 本章小结 | 第96-97页 |
| 第四章 沉水植物对太湖沉积物中氨氧化菌群落组成和活性的影响 | 第97-115页 |
| 4.1 材料和方法 | 第98-100页 |
| 4.1.1 体系的构建 | 第98-99页 |
| 4.1.2 DNA提取和定量PCR | 第99页 |
| 4.1.3 克隆文库的构建和序列分析 | 第99-100页 |
| 4.1.4 潜在硝化速率 | 第100页 |
| 4.1.5 数据分析 | 第100页 |
| 4.1.6 序列登录号 | 第100页 |
| 4.2 结果 | 第100-109页 |
| 4.2.1 AOA和AOB的amoA基因丰度 | 第100-102页 |
| 4.2.2 AOA和AOB的群落组成 | 第102-108页 |
| 4.2.3 潜在硝化速率与amoA基因丰度的关系 | 第108-109页 |
| 4.3 讨论 | 第109-113页 |
| 4.3.1 苦草对AOA和AOB的amoA基因丰度的影响 | 第109-110页 |
| 4.3.2 AOA和AOB的群落组成 | 第110-111页 |
| 4.3.3 AOA和AOB对潜在硝化速率的贡献 | 第111-113页 |
| 4.4 本章小结 | 第113-115页 |
| 第五章 漂浮植物对富营养化水体中氨氧化和反硝化微生物的影响 | 第115-135页 |
| 5.1 材料和方法 | 第116-118页 |
| 5.1.1 体系构建 | 第116页 |
| 5.1.2 样品的采集 | 第116-117页 |
| 5.1.3 理化指标的测定 | 第117页 |
| 5.1.4 PNR的测定 | 第117页 |
| 5.1.5 RNA的提取、纯化和反转录 | 第117-118页 |
| 5.1.6 DNA的提取和定量PCR | 第118页 |
| 5.1.7 T-RFLP | 第118页 |
| 5.1.8 数据分析 | 第118页 |
| 5.2 结果 | 第118-129页 |
| 5.2.1 理化指标的变化 | 第118-121页 |
| 5.2.2 PNR的变化 | 第121页 |
| 5.2.3 amoA基因和nir基因丰度的变化 | 第121-124页 |
| 5.2.4 细菌16s rDNA和16s rRNA群落结构变化 | 第124页 |
| 5.2.5 AOB群落结构变化 | 第124页 |
| 5.2.6 各处理的氮去除率 | 第124-129页 |
| 5.3 讨论 | 第129-132页 |
| 5.3.1 凤眼莲对水体中氨氧化微生物丰度的提高和对氨氧化作用的影响 | 第129-130页 |
| 5.3.2 凤眼莲对水体中细菌群落结构和功能的影响 | 第130-131页 |
| 5.3.3 凤眼莲减少水体中含nir基因反硝化微生物丰度 | 第131-132页 |
| 5.4 本章小结 | 第132-135页 |
| 第六章 结论与展望 | 第135-137页 |
| 6.1 结论 | 第135-136页 |
| 6.2 展望 | 第136-137页 |
| 参考文献 | 第137-159页 |
| 研究成果与科研经历 | 第159-161页 |
| 致谢 | 第161-162页 |
