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基于怀山药转录组测序的SSR分子标记的开发与应用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略语表(Abbreviation)第9-12页
1 前言第12-20页
    1.1 山药简介及研究概况第12页
    1.2 转录组学第12-13页
    1.3 DNA分子标记第13-15页
    1.4 SSR分子标记的开发与应用第15-18页
        1.4.1 SSR分子标记的开发第15-16页
        1.4.2 SSR分子标记的应用第16-18页
    1.5 DNA分子标记在山药应用中的研究进展第18页
    1.6 本研究的内容、目的和意义第18-20页
2 材料与方法第20-29页
    2.1 试验材料第20-23页
        2.1.1 植物材料第20-21页
        2.1.2 引物合成第21页
        2.1.3 主要试剂及药品第21-22页
        2.1.4 主要仪器设备第22-23页
        2.1.5 主要试剂配制第23页
    2.2 试验方法第23-26页
        2.2.1 怀山药叶片基因组DNA的提取及检测第23-24页
        2.2.2 怀山药转录组SSR序列第24页
        2.2.3 怀山药的SSR序列扩增第24页
        2.2.4 非变形聚丙烯酰胺凝胶电泳第24-26页
        2.2.5 SSR引物的应用第26页
    2.3 数据统计分析第26-29页
        2.3.1 数据的采集第26页
        2.3.2 数据软件的分析第26-29页
3 结果与分析第29-57页
    3.1 怀山药转录组测序的SSR序列的生物信息学分析第29-37页
        3.1.1 怀山药转录组序列中SSR重复单元的分布第30-32页
        3.1.2 怀山药转录组序列中SSR基元类型重复次数分布第32-37页
    3.2 怀山药转录组SSR分子标记的筛选、应用及分析第37-57页
        3.2.1 怀山药转录组SSR引物的筛选第37-42页
        3.2.2 怀山药SSR分子标记的应用第42-47页
        3.2.3 不同山药品种的聚类分析第47-48页
        3.2.4 不同山药品种的遗传多样性分析第48-57页
4 讨论第57-61页
    4.1 基于转录组测序的SSR分子标记的开发第57页
    4.2 怀山药SSR分布特点第57-58页
    4.3 不同DNA分子标记对山药品种聚类分析比较第58-59页
    4.4 基于SSR分子标记的山药遗传多样性分析第59-61页
5 结论第61-63页
参考文献第63-73页
致谢第73-75页
攻读硕士学位期间发表论文及参加的项目第75-76页

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