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CRISPR/Cas系统介导在哺乳动物细胞中mir-505基因的敲除

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-9页
目录第10-12页
1 前言第12-24页
    1.1 CRISPR/Cas 系统第12-17页
        1.1.1 基因编辑第12-13页
        1.1.2 CRISPR/Cas 系统研究历史第13页
        1.1.3 CRISPR/Cas 系统的基本结构和分类第13-15页
        1.1.4 CRISPR/Cas 系统:一种新的基因组编辑工具第15-16页
        1.1.5 CRISPR/Cas 系统存在的问题第16-17页
    1.2 microRNA第17-21页
        1.2.1 microRNA 的研究现状第17页
        1.2.2 microRNA 的概念及特征第17-18页
        1.2.3 microRNA 的加工过程第18-19页
        1.2.4 microRNA 的作用机制第19-20页
        1.2.5 microRNA 的表达第20-21页
        1.2.6 microRNA 的功能第21页
    1.3 立题背景第21-22页
        1.3.1 mir-505第21-22页
        1.3.2 CRISPR/Cas 系统介导 mir-505 敲除细胞第22页
    1.4 研究内容第22-23页
    1.5 研究意义第23-24页
2 材料与方法第24-48页
    2.1 材料第24-27页
        2.1.1 生物材料第24页
        2.1.2 实验试剂与仪器第24-27页
    2.2 方法第27-46页
        2.2.1 sgRNA 表达载体的构建流程第27-33页
        2.2.2 打靶载体的构建流程第33-40页
        2.2.3 细胞培养第40-42页
        2.2.4 细胞基因组 DNA 的抽提及定量第42页
        2.2.5 细胞总 RNA 的抽提及定量第42-43页
        2.2.6 T7E1 assay第43-44页
        2.2.7 实时荧光定量 PCR第44-46页
    2.3 数据分析第46-48页
3 结果与分析第48-69页
    3.1 mir-505 基因 sgRNA 的设计第48页
    3.2 sgRNA 表达载体的构建第48-51页
        3.2.1 41824-sgRNA(1)载体构建第48-50页
        3.2.2 42230-sgRNA 载体构建第50-51页
    3.3 打靶载体的构建第51-57页
        3.3.1 EGFP 打靶载体的构建第51-55页
        3.3.2 无 EGFP 打靶载体的构建第55-57页
    3.4 T7E1 assay 检测 CRISPR/Cas 系统对 mir-505 靶点的剪切效率第57-62页
        3.4.1 剪切效率与 sgRNA 和 Cas9 蛋白的剂量相关第58页
        3.4.2 剪切效率与 sgRNA 和 Cas9 蛋白的共传递相关第58-59页
        3.4.3 剪切效率与 sgRNA 的 GC%相关第59-60页
        3.4.4 剪切效率存在细胞系间差异第60-61页
        3.4.5 CRISPR/Cas 系统介导 mir-505 基因位点测序结果第61-62页
    3.5 G418 筛选 mir-505 knockout 细胞第62-64页
        3.5.1 G418 筛选 mir-505 knockout 细胞原理第62页
        3.5.2 G418 最低致死浓度的确定第62-63页
        3.5.3 无 EGFP 的 mir-505 knockout 细胞筛选第63-64页
        3.5.4 携带 EGFP 的 mir-505 knockout 细胞筛选第64页
    3.6 mir-505 knockout 细胞的检测第64-67页
        3.6.1 mir-505 knockout 细胞 PCR 分型结果第64-65页
        3.6.2 mir-505 knockout 细胞 mir-505 拷贝数检测第65-66页
        3.6.3 mir-505 knockout 细胞生长曲线的测定第66-67页
    3.7 mir-505 双等位基因 knockout 细胞的获得第67页
    3.8 CRISPR/Cas 系统特异性第67-69页
4 讨论第69-71页
    4.1 一步克隆法载体构建第69页
    4.2 CRISPR/Cas 系统的 off-target第69-70页
    4.3 打靶载体同源臂长度的设计第70页
    4.4 G418 筛选稳转株第70-71页
5 结论及展望第71-73页
    5.1 结论第71-72页
    5.2 展望第72-73页
参考文献第73-80页
课题来源第80-81页
攻读硕士学位期间发表学术论文目录第81-82页
致谢第82页

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