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小麦亲缘物种二穗短柄草热胁迫下转录组分析和MYB基因家族分析

摘要第6-8页
abstract第8-9页
第一章 文献综述第12-21页
    1.1 高温胁迫影响植物生长发育的研究进展第12-15页
        1.1.1 高温影响植物的生理生长第12-13页
        1.1.2 高温影响植物的转录水平第13-15页
            1.1.2.1 转录因子对高温的转录调控第13-14页
            1.1.2.2 植物在转录组水平上对高温的响应第14-15页
    1.2 植物MYB转录因子第15-18页
        1.2.1 MYB转录因子的发现和结构特征第15-16页
        1.2.2 植物MYB转录因子的进化和分类第16-17页
        1.2.3 植物MYB转录因子的功能研究第17-18页
    1.3 生物信息学的发展与应用第18页
        1.3.1 生物信息学的发展第18页
        1.3.2 生物信息学在植物研究中的应用概况第18页
    1.4 二穗短柄草作为模式植物的优势所在第18-19页
    1.5 本实验的研究目的和意义第19-21页
        1.5.1 研究意义第19页
        1.5.2 研究目标和内容第19-21页
第二章 转录组水平鉴定二穗短柄草热胁迫下差异表达基因第21-35页
    2.1 材料和方法第21-25页
        2.1.1 供试材料第21页
        2.1.2 胁迫处理方法第21页
        2.1.3 RNA-seq数据分析第21-22页
        2.1.4 转录表达分析结果的验证第22-25页
        2.1.5 技术路线第25页
    2.2 结果第25-32页
        2.2.1 RNA-seq测序质量分析第25页
        2.2.2 差异表达基因筛选和验证第25-27页
        2.2.3 差异表达基因聚类分析第27-28页
        2.2.4 差异表达转录因子的筛选第28-30页
        2.2.5 热胁迫下可变剪接分析第30-32页
    2.3 讨论与结论第32-35页
        2.3.1 高温胁迫的影响机制是复杂的第32-33页
        2.3.2 高温胁迫诱导基因发生可变剪接第33-34页
        2.3.3 响应高温的分子机制具有保守性第34-35页
第三章 全基因组鉴定、分析二穗短柄草MYB基因家族第35-51页
    3.1 材料和方法第35-37页
        3.1.1 材料第35页
        3.1.2 数据的获取第35页
        3.1.3 数据分析及筛选第35页
        3.1.4 系统发育分析、染色体分布、基因结构与保守序列分析第35-36页
        3.1.5 顺势作用元件和基因本体(GO)分析第36页
        3.1.6 基因复制和共线性分析第36页
        3.1.7 基因表达分析第36页
        3.1.8 材料处理与表达模式分析第36-37页
    3.2 结果第37-49页
        3.2.1 二穗短柄草MYB基因的预测第37页
        3.2.2 MYB的系统进化分析第37页
        3.2.3 蛋白保守基序和基因结构分析第37-40页
        3.2.4 启动子顺势作用元件和GO基因注释分析第40-41页
        3.2.5 染色体分布、基因复制和共线性分析第41-44页
        3.2.6 二穗短柄草MYB蛋白和其他蛋白相互作用分析第44页
        3.2.7 表达模式分析第44-49页
    3.3 讨论与结论第49-51页
        3.3.1 基因复制促使BdMYB基因不断扩张第49页
        3.3.2 BdMYB基因在花发育中发挥重要作用第49-50页
        3.3.3 MYB基因在应对非生物胁迫方面发挥重要作用第50-51页
参考文献第51-60页
附录第60-68页
缩略词第68-69页
致谢第69-70页
作者简介第70页

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