| 中文摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1.1 本课题的研究意义 | 第12页 |
| 1.2 玉米根系 | 第12-16页 |
| 1.2.1 玉米根系划分 | 第12-13页 |
| 1.2.2 玉米气生根的起源与作用 | 第13-14页 |
| 1.2.3 玉米根系构型与抗倒性的关系 | 第14-15页 |
| 1.2.4 影响植物根系构型的生理因素 | 第15页 |
| 1.2.5 玉米根系性状的遗传研究 | 第15-16页 |
| 1.3 GWAS定位技术 | 第16-21页 |
| 1.3.1 GWAS定位的起源与发展 | 第16-17页 |
| 1.3.2 GWAS定位原理 | 第17页 |
| 1.3.3 GWAS定位方法 | 第17-19页 |
| 1.3.3.1 玉米全基因组测序 | 第17-18页 |
| 1.3.3.2 群体构建 | 第18页 |
| 1.3.3.3 基因型检测 | 第18页 |
| 1.3.3.4 遗传图谱构建 | 第18页 |
| 1.3.3.5 表型数据收集 | 第18页 |
| 1.3.3.6 关联分析 | 第18-19页 |
| 1.3.3.7 候选基因预测 | 第19页 |
| 1.3.3.8 候选基因功能验证 | 第19页 |
| 1.3.4 GWAS定位的优势 | 第19-20页 |
| 1.3.5 GWAS定位在玉米上的应用 | 第20-21页 |
| 1.4 本课题研究目的与采用的技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.2 基因型检测和高密度遗传图谱构建 | 第22页 |
| 2.2.1 基因型检测 | 第22页 |
| 2.2.2 高密度遗传图谱构建 | 第22页 |
| 2.3 实验方法 | 第22-24页 |
| 2.3.1 田间种植 | 第22-23页 |
| 2.3.2 性状测量方法 | 第23页 |
| 2.3.3 数据整理 | 第23页 |
| 2.3.4 数据分析 | 第23-24页 |
| 2.4 GWAS分析 | 第24-25页 |
| 2.4.1 关联分析作图和显著SNP位点表型贡献率 | 第24页 |
| 2.4.2 候选基因预测 | 第24页 |
| 2.4.3 候选基因功能注释 | 第24-25页 |
| 第三章 结果与分析 | 第25-40页 |
| 3.1 气生根直径GWAS定位的结果分析 | 第25-32页 |
| 3.1.1 气生根直径数据分布情况 | 第25页 |
| 3.1.2 气生根直径在不同地点间的相关性分析 | 第25-26页 |
| 3.1.3 气生根直径在不同亚群间的差异性分析 | 第26-27页 |
| 3.1.4 GWAS定位结果 | 第27-32页 |
| 3.1.4.1 遗传力与方差分析 | 第27-28页 |
| 3.1.4.2 曼哈顿图与QQ-plot图 | 第28-29页 |
| 3.1.4.3 候选SNP位点及表型贡献率 | 第29-30页 |
| 3.1.4.4 候选基因筛选 | 第30-32页 |
| 3.1.4.5 候选基因分类 | 第32页 |
| 3.2 气生根角度的GWAS定位结果分析 | 第32-40页 |
| 3.2.1 气生根角度数据分布情况 | 第32-33页 |
| 3.2.2 气生根直径在不同地点间的相关性分析 | 第33-34页 |
| 3.2.3 气生根直径在不同亚群间的差异性分析 | 第34-35页 |
| 3.2.4 GWAS定位结果 | 第35-40页 |
| 3.2.4.1 遗传力与环境方差分析 | 第35页 |
| 3.2.4.2 曼哈顿图与QQ-plot图 | 第35-36页 |
| 3.2.4.3 候选SNP位点及表型贡献率 | 第36-37页 |
| 3.2.4.4 候选基因筛选 | 第37-39页 |
| 3.2.4.5 候选基因分类 | 第39-40页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第40-45页 |
| 4.1 讨论 | 第40-42页 |
| 4.1.1 玉米气生根直径与角度的遗传变异分析 | 第40页 |
| 4.1.2 玉米气生根角度双峰分析 | 第40页 |
| 4.1.3 候选基因功能分析 | 第40-42页 |
| 4.2 结论 | 第42-45页 |
| 4.2.1 气生根直径性状在关联群体中的遗传基础 | 第42-43页 |
| 4.2.2 气生根角度性状在关联群体中的遗传基础 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 附录 | 第50-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第57-58页 |