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解藻酸弧菌Vibrio海藻酸裂解酶系的催化特异性差异

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 综述与导言第10-20页
    1.1 海藻酸生物合成的遗传学第10页
    1.2 海藻酸类酶系的探究性发展第10-16页
        1.2.1 可分解代谢海藻酸酶的微生物第11页
        1.2.2 海藻酸盐类裂解酶系的划分第11-12页
        1.2.3 海藻酸裂解酶系的底物专一偏爱性第12-13页
        1.2.4 海藻酸盐类裂解酶的催化机制及结构特征第13-14页
        1.2.5 海藻酸盐类裂解酶系的酶学特性第14-16页
    1.3 海藻酸生产生物燃料和可再生性日用化学品的微生物平台第16-18页
    1.4 包涵体变复性常见问题及解决手段第18页
    1.5 课题研究意义及工作目标第18-20页
        1.5.1 研究意义第18-19页
        1.5.2 工作目标第19-20页
第2章 材料与方法第20-38页
    2.1 材料与仪器第20-27页
        2.1.1 化学药品与试剂第20页
        2.1.2 生物药品与试剂第20-21页
        2.1.3 培养基第21-22页
        2.1.4 缓冲液第22-23页
        2.1.5 菌种第23-24页
        2.1.6 质粒第24页
        2.1.7 重组质粒第24-25页
        2.1.8 引物第25-26页
        2.1.9 生物学及数学处理软件第26-27页
    2.2 微生物的培养与保种第27页
        2.2.1 微生物培养条件第27页
        2.2.2 菌种的保藏与活化第27页
    2.3 遗传学方法第27-28页
        2.3.1 大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞的制备(短期用)第27-28页
        2.3.2 大肠杆菌热激法转化第28页
    2.4 基因工程方法第28-33页
        2.4.1 大肠杆菌系质粒的抽提第28-29页
        2.4.2 DNA凝胶电泳第29页
        2.4.3 DNA的酶切反应第29-30页
        2.4.4 DNA的连接反应第30页
        2.4.5 DNA凝胶回收第30页
        2.4.6 DNA的沉淀回收第30页
        2.4.7 In-Fusion基因克隆方法第30-31页
        2.4.8 重叠延伸PCR法的定点突变第31页
        2.4.9 SDS-PAGE电泳第31-33页
    2.5 融合His-Tag重组蛋白的纯化第33-34页
        2.5.1 Ni-NTA纯化带组氨酸标签蛋白的原理第33-34页
        2.5.2 蛋白除盐浓缩第34页
    2.6 蛋白浓度的测定第34-35页
    2.7 海藻酸酶的测活方法第35页
    2.8 核磁共振技术第35-36页
    2.9 不溶性蛋白质的变复性第36-38页
第3章 结果与分析第38-70页
    3.1 三种重组蛋白的底物特异性差异第38-39页
        3.1.1 AlgV1-S、AlgV2-及AlgV3-S的克隆第38页
        3.1.2 AlgV1-S、AlgV2-及AlgV3-S的PCR反应体系第38-39页
    3.2 T7启动子介导的重组表达质粒构建第39-41页
    3.3 重组表达质粒的蛋白检测与纯化第41-43页
        3.3.1 AlgV1-S、AlgV2-S、AlgV3-S重组质粒的蛋白表达及SDS-PAGE检测第41-42页
        3.3.2 AlgV1-S、AlgV2-S、AlgV3-S重组蛋白的镍柱纯化第42-43页
    3.4 三种重组蛋白的底物特异性差异第43-50页
        3.4.1 TBA法测定AlgV1-S、AlgV2-S、AlgV3-S对不同类型底物的酶活第43-44页
        3.4.2 重组蛋白AlgV1-S、AlgV2-S、AlgV3-S对不同底物降解的产物鉴定第44-49页
        3.4.3 三种海藻酸裂解酶不同配比对海藻酸钠降解深度影响的研究第49-50页
    3.5 三种重组蛋白的催化部位结构差异第50-65页
        3.5.1 存在于催化中心的重要氨基酸的确定及个别高效酶的获得第50-59页
        3.5.2 不同类型的组合酶的催化差异性第59-65页
    3.6 重组蛋白AlgV1-S、AlgV2-S、AlgV3-S的表观酶学性质差异第65-70页
        3.6.1 测活方法:DNS法及TBA法的结合第65-66页
        3.6.2 不同缓冲液,pH及不同反应温度对重组酶活性的影响第66-67页
        3.6.3 多肽融合标签His6-Tag对目标蛋白影响的初步研究第67-70页
第4章 研究总结与讨论第70-78页
    4.1 重要研究结论第70-71页
    4.2 分析及讨论第71-78页
        4.2.1 底物特异性分析及含量估算第71页
        4.2.2 催化差异显示及值得深入探究的内容第71-72页
        4.2.3 胞内裂解酶algV4与algV5第72-73页
        4.2.4 蛋白质的分子设计和实验进化第73-75页
        4.2.5 包涵体表达蛋白实现可溶性的另一条思路第75-76页
        4.2.6 蛋白质精细三维结构的分析第76-78页
第5章 课题展望第78-79页
第6章 致谢第79-80页
参考文献第80-84页

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