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基于DNA计算的聚类算法研究

摘要第1-13页
Abstract第13-16页
符号说明第16-18页
第1章 绪论第18-36页
   ·研究课题的背景和意义第18-25页
     ·聚类分析简介和意义第18-23页
     ·DNA 计算简介和意义第23-25页
   ·聚类算法研究进展第25-28页
     ·层次聚类方法第25-26页
     ·基于网格聚类方法第26-27页
     ·图聚类方法第27-28页
   ·DNA 计算研究进展第28-31页
   ·论文研究内容及组织第31-36页
     ·研究内容第31-33页
     ·论文创新点第33-34页
     ·论文组织第34-36页
第2章 DNA 计算的面向对象描述和建模第36-48页
   ·DNA 计算简介第36-39页
     ·DNA 分子的结构和性质第36-37页
     ·DNA 计算的常用生化操作第37-38页
     ·DNA 计算的应用思想第38-39页
   ·DNA 计算的面向对象建模第39-47页
     ·DNA 计算的面向对象描述第39-40页
     ·DNA 计算的面向对象静态模型的建立第40-44页
     ·DNA 计算的面向对象动态模型的建立第44-47页
   ·小结第47-48页
第3章 聚类算法的DNA 计算模型建立第48-58页
   ·引言第48页
   ·聚类问题的分析与转化第48-52页
     ·将聚类问题转化成组合问题第49-50页
     ·将聚类问题转化成图论问题第50-52页
   ·聚类算法的DNA 计算模型第52-54页
     ·聚类算法的DNA 计算模型第52-53页
     ·聚类算法的DNA 计算算法第53-54页
   ·可行性的理论证明第54-56页
   ·小结第56-58页
第4章 基于DNA 计算的层次聚类研究第58-72页
   ·引言第58页
   ·基本思想第58-61页
     ·层次聚类方法简介第58-60页
     ·问题域的转化第60-61页
   ·用于层次聚类的DNA 计算模型第61-70页
     ·基本模型第61-62页
     ·DNA 编码设计第62-64页
     ·粘贴模型的建立第64-70页
   ·DNA 计算的生物实验设计第70-71页
   ·小结第71-72页
第5章 基于DNA 计算的网格聚类研究第72-89页
   ·引言第72页
   ·基本思想第72-74页
     ·CLIQUE 算法简介第72-73页
     ·问题域的转化第73-74页
   ·基于过滤模型的网格聚类第74-76页
   ·DNA 编码设计第76-81页
     ·基于节点和边的编码设计第76-77页
     ·基于坐标组合的编码设计第77-79页
     ·基于距离的编码设计第79页
     ·基于节点的编码设计第79-81页
   ·DNA 计算的生物实验方法设计第81-85页
     ·基于节点和边编码的生物实验第81-82页
     ·基于坐标组合编码的生物实验第82-83页
     ·基于距离编码的生物实验第83-84页
     ·基于节点编码的生物实验第84-85页
   ·基于粘贴模型的网格聚类第85-88页
   ·小结第88-89页
第6章 基于 DNA 计算的图聚类研究第89-99页
   ·引言第89页
   ·图聚类问题的转化第89-92页
     ·用k-medoids 算法解决图像分割问题第90-92页
     ·用最小生成树算法解决图聚类第92页
   ·基于过滤模型的图聚类第92-97页
     ·基于k-medoids 的图聚类编码设计第94-95页
     ·基于过滤模型的图聚类算法第95-96页
     ·基于k-medoids 算法的图聚类生物实验第96-97页
     ·基于k-medoids 算法的图像分割的讨论第97页
   ·小结第97-99页
第7章 基于 DNA 计算的聚类算法实验第99-132页
   ·引言第99页
   ·DNA 分子的编码问题第99-104页
     ·DNA 分子的编码约束第100-101页
     ·利用遗传算法生成DNA 序列第101-104页
   ·计算机模拟实验第104-116页
     ·计算机串行模拟算法第104-113页
     ·计算机并行模拟算法第113-116页
   ·网格聚类的边缘检测算法第116-122页
     ·问题描述第116-118页
     ·算法第118-119页
     ·实验结果第119-121页
     ·复杂度分析第121-122页
   ·生物实验验证第122-126页
     ·生物实验算法第122-123页
     ·生化实验与结果第123-126页
   ·算法复杂度的讨论第126-129页
     ·计算机模拟算法复杂度第126-128页
     ·生物实验复杂度第128-129页
   ·与其他聚类算法的比较第129-131页
     ·与CLIQUE 算法的比较第129-130页
     ·与Bakar’s 算法的比较第130-131页
   ·小结第131-132页
第8章 基于DNA 计算的聚类算法应用第132-151页
   ·引言第132页
   ·DNA 计算在城市零售商区域划分中的应用第132-140页
     ·零售商区域划分问题第132-134页
     ·DNA 计算模型的建立和算法设计第134-139页
     ·实验结果和算法复杂度讨论第139-140页
   ·DNA 计算在真实数据集的网格聚类第140-144页
     ·DNA 计算模型的建立第140-143页
     ·实验结果与分析第143-144页
   ·DNA 计算在图像分割中的应用第144-148页
     ·初始化数据第144-145页
     ·DNA 计算模型的建立第145-147页
     ·实验结果和分析第147-148页
   ·小结第148-151页
第9章 总结和展望第151-154页
   ·总结第151-152页
   ·进一步研究工作第152-154页
参考文献第154-169页
攻读学位期间学术论文及参与的项目第169-170页
致谢第170页

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