| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 引言 | 第11-20页 |
| 1.1 香蕉枯萎病的发生与危害 | 第11页 |
| 1.2 香蕉枯萎病的传播方式与危害症状 | 第11-12页 |
| 1.2.1 香蕉枯萎病的传播方式 | 第11页 |
| 1.2.2 香蕉枯萎病的危害症状 | 第11-12页 |
| 1.3 香蕉枯萎病菌的病原学特征和生物学特征 | 第12页 |
| 1.4 香蕉枯萎病菌的致病机理 | 第12-14页 |
| 1.4.1 寄主与病原菌的互作关系 | 第13页 |
| 1.4.2 致病毒素 | 第13页 |
| 1.4.3 致病相关基因 | 第13-14页 |
| 1.5 植物抗病机理研究 | 第14页 |
| 1.6 香蕉抗枯萎病抗性机理研究 | 第14-16页 |
| 1.6.1 香蕉抗枯萎病结构抗性研究 | 第14-15页 |
| 1.6.2 香蕉抗枯萎病化学抗性研究 | 第15-16页 |
| 1.7 转录组测序技术发展及其应用 | 第16-19页 |
| 1.7.1 转录组测序技术的发展 | 第16-17页 |
| 1.7.2 转录组测序技术的应用 | 第17-19页 |
| 1.8 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-31页 |
| 2.1 供试材料与主要仪器 | 第20页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第20页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第20页 |
| 2.2 供试药剂及生化制剂 | 第20页 |
| 2.3 巴西蕉与宝岛蕉花芽分化期根部组织RNA-Seq测序及分析 | 第20-23页 |
| 2.3.1 RNA-Seq测序样品处理 | 第20-21页 |
| 2.3.2 Illumina测序实验流程 | 第21页 |
| 2.3.3 转录组测序信息分析流程 | 第21-23页 |
| 2.4 差异表达基因的qRT-PCR分析 | 第23-31页 |
| 2.4.1 样品处理 | 第23-24页 |
| 2.4.2 总RNA提取及cDNA第一链合成 | 第24-26页 |
| 2.4.3 qRT-PCR引物设计 | 第26页 |
| 2.4.4 目标序列的克隆回收 | 第26-28页 |
| 2.4.5 目标序列的测序 | 第28-29页 |
| 2.4.6 实时荧光定量PCR | 第29-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-53页 |
| 3.1 RNA-Seq测序结果分析 | 第31-40页 |
| 3.1.1 Illumina测序原始数据质控与统计 | 第31页 |
| 3.1.2 与已知参考基因组比对 | 第31-33页 |
| 3.1.3 GO功能分类 | 第33-34页 |
| 3.1.4 COG分类 | 第34页 |
| 3.1.5 代谢通路分析 | 第34-35页 |
| 3.1.6 差异表达基因分析 | 第35-40页 |
| 3.2 10个差异表达防卫基因的qRT-PCR引物设计 | 第40-41页 |
| 3.3 总RNA质量分析 | 第41-43页 |
| 3.4 10个防卫基因引物的qRT-PCR可用性分析 | 第43-45页 |
| 3.4.1 标准品的制备 | 第43页 |
| 3.4.2 qRT-PCR动力学曲线及溶解曲线分析 | 第43-45页 |
| 3.5 10个差异表达防卫基因的qRT-PCR分析 | 第45-53页 |
| 3.5.1 glutathione-S-transferase Cla47基因qRT-PCR分析 | 第45-46页 |
| 3.5.2 cellulose synthase catalytic subunit 12基因的qRT-PCR分析 | 第46页 |
| 3.5.3 putative chitinase基因的qRT-PCR分析 | 第46-47页 |
| 3.5.4 peroxidase基因的qRT-PCR分析 | 第47-49页 |
| 3.5.5 laccase-4基因的qRT-PCR分析 | 第49-50页 |
| 3.5.6 Snakin-1基因的qRT-PCR分析 | 第50-51页 |
| 3.5.7 Periplasmic beta-glucosidase precursor基因的qRT-PCR分析 | 第51页 |
| 3.5.8 similar to T-phylloplanin基因的qRT-PCR分析 | 第51-52页 |
| 3.5.9 10个差异表达基因所揭示的抗病机理 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| 4.1 花芽分化期Foc4胁迫下巴西蕉和宝岛蕉根部转录组测序 | 第53-54页 |
| 4.2 差异表达基因的实时荧光定量PCR与抗病机理分析 | 第54-56页 |
| 5 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录 | 第63-71页 |
| 在校期间发表文章及参与项目 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
